| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3795026 | 154 (3.010) | 7 (0.150) | 6/238 | NT | 4.5% | coding (98/1047 nt) | waaF | ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II |
| ? | NC_000913 | = 3795059 | 150 (3.130) | coding (131/1047 nt) | waaF | ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATC > NC_000913/3794911‑3795206 | gACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑Catt > 4:174251/1‑149 (MQ=255) aCGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTa < 2:75311‑M2/149‑2 (MQ=255) aTAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCCATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTattat < 1:95153‑M2/149‑6 (MQ=255) tAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTattatc > 2:370909‑M2/1‑143 (MQ=255) gCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGa < 2:410935/149‑1 (MQ=255) gCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGa > 2:242648/1‑149 (MQ=255) tctGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATg > 1:53700/1‑149 (MQ=255) cATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGCCATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCgg > 1:214272/1‑149 (MQ=255) aTGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGc < 2:431130/145‑1 (MQ=255) aTGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGc > 1:431130/1‑145 (MQ=255) tGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGaa < 4:172354/149‑1 (MQ=255) tGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGaa < 3:96333/149‑1 (MQ=255) tGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGaa < 3:415063/149‑1 (MQ=255) aTACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTaa < 4:466152/149‑1 (MQ=255) aTACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTaa < 3:191867/149‑1 (MQ=255) aTACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTaa < 3:333546/149‑1 (MQ=255) ggTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAg > 1:440564/1‑149 (MQ=255) gTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGc > 1:224055/1‑149 (MQ=255) gTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGc > 1:467388/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTAt < 2:272841/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTAt > 1:341505/1‑149 (MQ=255) cGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTc < 4:378200/149‑1 (MQ=255) cGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTc < 1:5746/149‑1 (MQ=255) ggCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTcc > 3:73267/1‑149 (MQ=255) gCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGGTGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCt < 2:383477/149‑1 (MQ=255) gCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCt > 4:44312/1‑149 (MQ=255) ccGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTAt < 3:163606/149‑1 (MQ=255) ccGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTAt < 2:53700/149‑1 (MQ=255) ccGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTAt > 3:442063/1‑149 (MQ=255) ccGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTAt < 2:323729/149‑1 (MQ=255) tttgcgaCATCATCATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTattatcgc > 4:10864‑M2/4‑100 (MQ=255) tttgCGACATCATCATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTa < 3:284024/129‑1 (MQ=255) tttgCGACATCATCATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCACGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTaa > 2:404030/4‑124 (MQ=255) ttGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGt > 2:358125/1‑149 (MQ=255) gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACgg < 4:73267/149‑1 (MQ=255) aCATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAg < 4:290022/123‑1 (MQ=255) aCATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGa < 3:211433/149‑1 (MQ=255) atgatgatgTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAgc < 2:440564/149‑1 (MQ=255) gatgatgTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTAt > 1:63353/1‑129 (MQ=255) gatgatgTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTAt < 2:63353/129‑1 (MQ=255) gatgatgTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATg < 1:26776/130‑1 (MQ=255) tgatgTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTg < 2:371676/149‑1 (MQ=255) atgTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGa < 4:473279/149‑1 (MQ=255) tCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAAt < 3:174251/149‑1 (MQ=255) tCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAAt > 3:196098/1‑149 (MQ=255) tCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAAt > 2:332816/1‑149 (MQ=255) gCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGc > 3:469662/1‑111 (MQ=255) gCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCg < 4:196098/149‑1 (MQ=255) aaGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCg < 3:291204/149‑1 (MQ=255) ctctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 3:176185/1‑149 (MQ=255) tctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgc > 3:452915/1‑149 (MQ=255) tctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgc > 4:419239/1‑149 (MQ=255) aTCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgccgc > 3:138055/1‑149 (MQ=255) aTCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgccgc > 2:293764/1‑149 (MQ=255) cGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGc > 3:361834/1‑138 (MQ=255) cACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCTGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAAc < 2:214272/149‑1 (MQ=255) cGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTg < 1:358125/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTgg < 1:375227/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTgg < 2:152507/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCt > 3:44727/1‑121 (MQ=255) tCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGt > 4:130391/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 1:276843/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATa < 1:293764/149‑1 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCCATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGc < 2:95153/149‑1 (MQ=255) aTCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGt < 1:242648/149‑1 (MQ=255) cccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaa > 4:246748/1‑149 (MQ=255) cAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatcatcatgtcgccaacccaagacgggccgatcaccagtattttcatgcagagc < 3:84540‑M2/149‑106 (MQ=255) cAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaaa < 3:36572/149‑1 (MQ=255) ggCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgc < 2:467388/149‑1 (MQ=255) gATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCt < 4:452915/149‑1 (MQ=255) aTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTGTCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGa > 4:392829/1‑149 (MQ=255) aTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgc < 4:189280/142‑1 (MQ=255) aTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGa > 1:16384/1‑149 (MQ=255) tCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAc > 4:119624/1‑149 (MQ=255) gATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt > 3:206570/1‑116 (MQ=255) gATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 4:206570/116‑1 (MQ=255) aTGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACcgc < 4:17145/149‑1 (MQ=255) tgtgATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACcgcg > 2:204299/1‑149 (MQ=255) aTGGCACCGGCATGGTGCCGTCACATCgattatcgcctggggatagcgcgcctggagcgtgcgatagagactttgcgacatcatcatgtcgccaacccaagacgggccgatcaccagtattttcatgcagagctcttatgcgtc > 4:448417‑M2/1‑27 (MQ=255) aTGGCACCGGCATGGTGCCCTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTAc < 3:387983/138‑1 (MQ=255) ggCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGa > 3:252156/1‑79 (MQ=255) ggCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGa < 4:252156/79‑1 (MQ=255) gCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTgg < 1:373613/85‑1 (MQ=255) gCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGt > 2:263802/1‑149 (MQ=255) aCCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTa > 3:180415/1‑144 (MQ=255) aCCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTa < 4:180415/144‑1 (MQ=255) aCCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCt > 3:342645/1‑149 (MQ=255) cGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTa < 1:263802/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 1:169468/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc > 4:56338/1‑149 (MQ=255) gTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgcg > 3:233367/1‑115 (MQ=255) gTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGt < 3:405951/133‑1 (MQ=255) gTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTc > 4:269317/1‑149 (MQ=255) tC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGt > 1:402354/1‑94 (MQ=255) tC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCa > 4:329725/1‑149 (MQ=255) cATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaaa < 3:119369/149‑1 (MQ=255) attattATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAAt < 2:224055/149‑1 (MQ=255) ttattaTCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCa < 4:330398/92‑1 (MQ=255) ttattaTCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCa > 3:330398/1‑92 (MQ=255) ttattaTCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATc > 4:203393/1‑149 (MQ=255) | GACGCATAAGAGCTCTGCATGAAAATACTGGTGATCGGCCCGTCTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTC‑CATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATC > NC_000913/3794911‑3795206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |