| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,901,029 | Δ1 bp | 6.7% | coding (557/1557 nt) | yoaE ← | putative membrane protein/conserved protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,901,029 | 0 | A | . | 6.7% | 361.4 / 18.1 | 105 | coding (557/1557 nt) | yoaE | putative membrane protein/conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/50); new base . (3/4); total (51/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTGCGACGCGCAATCTGGTTAAACACTTCGATGATGATCGAGAAGCCAATCGCGGCATACAGGTAACCTTTCGGAATGTGGAAACCGAAACCTTCTGCCACCAGACTCAGACCAATCATTAACAGGAAGCTCAGACAGAGCACCACCACCGTGG‑GGTGCTGGTTAACGAATCGCGTCAGCGGTTTGGATGCCAGCAACATAACCGCCATCGCAATCACTACCGCCGCCATCATCACCGGCAGATGGTTAACCATCCCTACTGCAGTAATTACCGCATCCAACGAGAAGAC > NC_000913/1900885‑1901174 | ttGCGACGCGCAATCTGGTTAAACACTTCGATGATGATCGAGAAGCCAATCGCGGCATACAGGTAACCTTTCGGAATGTGGAAACCGAAACCTTCTGCCACCAGACTCAGACCAATCATTAACAGGAAGCTCAGACAGAGcaccaccac < 2:862825/149‑1 (MQ=255) gACGCGCAATCTGGTTAAACACTTCGATGATGATCGAGAAGCCAATCGCGGCATACAGGTAACCTTTCGGAATGTGGAAACCGAAACCTTCTGCCACCAGACTCAGACCAATCATTAACAGGAAGCTCAGACAGAGCACCACCACCGt < 4:1030495/148‑1 (MQ=255) aCGCGCAATCTGGTTAAACACTTCGATGATGATCGAGAAGCCAATCGCGGCATACAGGTAACCTTTCGGAATGTGGAAACCGAAACCTTCTGCCACCAGACTCAGACCAATCATTAACAGGAAGCTCAGACAGAGCACCACCACCGTg < 4:922546/148‑1 (MQ=255) gcgcAATCTGGTTAAACACTTCGATGATGATCGAGAAGCCAATCGCGGCATACAGGTAACCTTTCGGAATGTGGAAACCGAAACCTTCTGCCACCAGACTCAGACCAATCATTAACAGGCAGCTCAGCCAGAGCACAAGCACCGTgg‑gg 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cagacagaGCACCACCACCGTGG‑GGTGCTGGTTAACGAATCGCGTCAGCGGTTTGGATGCCAGCAACATAACCGCCATCGCAATCACTACCGCCGCCATCATCACCGGCAGATGGTTAACCATCCCTACTGCAGTAATTACCGCATcc > 4:371414/1‑148 (MQ=255) cagacagaGCACCACCACCGTGG‑GGTGCTGGTTAACGAATCGCGTCAGCGGTTTGGATGCCAGCAACATAACCGCCATCGCAATCACTACCGCCGCCATCATCACCGGCAGATGGTTAACCATCCCTACTGCAGTAATTACCGCATcc > 3:855761/1‑148 (MQ=255) cagacagaGCACCACCACCGTGG‑GGTGCTGGTTAACGAATCGCGTCAGCGGTTTGGATGCCAGCAACATAACCGCCATCGCAATCACTACCGCCGCCATCATCACCGGCAGATGGTTAACCATCCCTACTGCAGTAATTACCGCATcc > 4:14541/1‑148 (MQ=255) gacagaGCACCACCACCGTGG‑GGTGCTGGTTAACGAATCGCGTCAGCGGTTTGGATGCCAGCAACATAACCGCCATCGCAATCACTACCGCCGCCATCATCACCGGCAGATGGTTAACCATCCCTACTGCAGTAATTACCGCATCCAAc < 2:1061555/149‑1 (MQ=255) gacagaGCACCACCACCGTGG‑GGTGCTGGTTAACGAATCGCGTCAGCGGTTTGGATGCCAGCAACATAACCGCCATCGCAATCACTACCGCCGCCATCATCACCGGCAGATGGTTAACCATCCCTACTGCAGTAATTACCGCATCCAAc < 2:392837/149‑1 (MQ=255) 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> NC_000913/1900885‑1901174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |