| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,202,957 | G→T | 5.1% | intergenic (‑24/‑67) | cohE ← / → croE | e14 prophage; repressor protein phage e14/e14 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,202,957 | 0 | G | T | 5.1% | 847.7 / 24.1 | 245 | intergenic (‑24/‑67) | cohE/croE | e14 prophage; repressor protein phage e14/e14 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (109/119); new base T (4/8); total (115/130) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.20e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAC > NC_000913/1202813‑1203105 | ccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa < 3:584174/149‑1 (MQ=255)ccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa > 2:90771/1‑149 (MQ=255) cATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑g > 2:1092627/1‑149 (MQ=255) cATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑g > 3:1070435/1‑149 (MQ=255) aTAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑gg > 2:115662/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 1:1374581/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 1:838562/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAg > 3:368272/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACC‑TTAACGGTACAAg < 2:295347/149‑1 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAgg < 1:953730/149‑2 (MQ=255) ctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTAt < 1:712480/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGaa < 1:237745/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGaa < 1:425004/149‑1 (MQ=255) gggTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAg < 4:866920/149‑1 (MQ=255) gggTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAg > 1:33411/1‑149 (MQ=255) gggTTGGCTCGCGATCAATCATAGTCGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa > 4:677698/1‑131 (MQ=255) ggTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAggg > 1:1159935/1‑138 (MQ=255) ggTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAgg < 4:320979/149‑1 (MQ=255) cTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAtt > 4:281459/1‑149 (MQ=255) cTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAtt < 2:889072/149‑1 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 3:503791/130‑1 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 1:502166/1‑149 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 4:1530825/1‑149 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 4:83671/1‑149 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTGCCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 3:675845/149‑1 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 3:215762/149‑1 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 3:1332384/149‑1 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 4:1142694/149‑1 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 3:943890/149‑1 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 3:922916/149‑1 (MQ=255) gATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAggg > 3:1197790/1‑127 (MQ=255) tcaatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCa > 1:1332946/1‑149 (MQ=255) caatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCAt < 1:148194/149‑1 (MQ=255) caatcaTAGGGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGGCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCAt < 3:1166534/149‑1 (MQ=255) aatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATg > 2:781010/1‑149 (MQ=255) aatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATg > 2:531298/1‑149 (MQ=255) aGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAatat < 3:1569952/149‑1 (MQ=255) aGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAatat < 1:209200/149‑1 (MQ=255) tGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATACAATATGt > 4:1213430/1‑149 (MQ=255) aaaGGAAGAATTCCCGCCAACACAATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTacac > 4:591536/1‑149 (MQ=255) aGGAAGAATTCCCGCCAACTCCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCg > 4:1369773/1‑149 (MQ=255) aGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAgggtt < 2:165569/113‑5 (MQ=255) aGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAgggtt > 1:165569/1‑109 (MQ=255) ggAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAatat > 3:287482/1‑140 (MQ=255) gaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTATCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCtt > 4:1074513/1‑110 (MQ=255) aTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTAc < 1:112235/149‑1 (MQ=255) ttCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACa > 1:1014092/1‑149 (MQ=255) tCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACat < 3:541566/149‑1 (MQ=255) ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTGCCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat > 2:987232/1‑149 (MQ=255) ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat > 2:1365113/1‑149 (MQ=255) ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat > 4:511388/1‑149 (MQ=255) ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat > 3:1365206/1‑149 (MQ=255) ccAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACAAACTGt > 1:1219756/1‑149 (MQ=255) aaCACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTAt < 1:8786/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa > 3:795914/1‑149 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 1:649727/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 3:1533698/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTACATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 1:1409180/149‑1 (MQ=255) cATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAtt < 3:750556/105‑1 (MQ=255) cATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAg > 2:361615/1‑149 (MQ=255) tCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGActc < 1:753652/149‑1 (MQ=255) tgacGTTAGACCGCCGGATGTCATCTATTTTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTATACCGTTAA‑GGTAAACGTATCTTAAAGGTACATCTCAATCATGTAATATCTACACCTGAGGTACATAGTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCtt > 4:975536/4‑149 (MQ=255) gTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTGCCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAAc < 1:987232/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa < 2:1165346/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa < 1:365125/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa > 4:494775/1‑149 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa < 3:840403/149‑1 (MQ=255) ccgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAca > 3:1098367/1‑149 (MQ=255) tGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAgg < 1:898030/149‑1 (MQ=255) tCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGc > 4:780099/1‑149 (MQ=255) tCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGc > 2:1213249/1‑149 (MQ=255) cATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCg > 1:979139/1‑149 (MQ=255) aTGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa > 2:1250968/1‑111 (MQ=255) tGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAg > 4:392405/1‑149 (MQ=255) gATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGtt > 3:69955/1‑149 (MQ=255) gATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGtt < 4:157447/149‑1 (MQ=255) aTTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAg > 2:431578/1‑146 (MQ=255) aTTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAg < 1:431578/146‑1 (MQ=255) ttttCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCg > 2:1303630/1‑149 (MQ=255) tttCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGc < 4:1425299/146‑1 (MQ=255) tttCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGc > 3:1425299/1‑146 (MQ=255) ttCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGa < 4:1247413/149‑1 (MQ=255) aTAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGaaaa < 4:795475/149‑1 (MQ=255) aaCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAcagca > 1:1042275/1‑128 (MQ=255) aaCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAcagca < 2:1042275/128‑1 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 4:41268/95‑1 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa > 3:41268/1‑95 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGtt < 2:82550/149‑1 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGtt < 1:1303630/149‑1 (MQ=255) gAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTgg < 3:511388/149‑1 (MQ=255) gAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTgg < 3:1270698/149‑1 (MQ=255) aaTTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCt > 1:542546/1‑149 (MQ=255) tAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCaa < 2:613206/149‑1 (MQ=255) aaCCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGtt < 1:1098277/139‑1 (MQ=255) ccTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGaa < 3:1519270/109‑1 (MQ=255) gTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTa < 2:33411/149‑1 (MQ=255) cGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTa > 3:6465/1‑149 (MQ=255) gTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTaa > 3:1218896/1‑92 (MQ=255) gTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAc > 1:611638/1‑149 (MQ=255) gTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAc > 3:1303948/1‑149 (MQ=255) | CCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACTTAC > NC_000913/1202813‑1203105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |