| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 672,110 | 0 | G | A | 5.4% | 681.3 / 18.4 | 203 | T26I (ACC→ATC) | lptE | LPS assembly OM complex LptDE, lipoprotein component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (87/105); new base A (6/5); total (93/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
AGGATGGAACGTCCTTACGCGTGGTTTCTTTATCAAGCAACTCGACACCATTCAGACGTAACTGGTTACGCACCGCACGGCTTAATGGCCCGTTCGGATCGCCTGAGTCCAGGATCATGACCTTCATAGTGGAAGGAACCTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTACGTACAGTA > NC_000913/671964‑672258 | aGGATGGAACGTCCTTACGCGTGGTTTCTTTATCAAGCAACTCGACACCATTCAGACGTAACTGGTTACGCACCGCACGGCTTAATGGCCCGTTCGGATCGCCTGAGTCCAGGATCATGACCTTCATAGTGGAAGGAACCTGCGTGGTa < 1:1066323/149‑1 (MQ=255) ggATGGAACGTCCTTACGCGTGGTTTCTTTATCAAGCAACTCGACACCATTCAGACGTAACTGGTTACGCACCGCACGGCTTAATGGCCCGTTCGGATCGCCTGAGTCCAGGATCATGACCTTCATAGTGGAAGGAACCTGCGTGGTAt > 1:105516/1‑149 (MQ=255) cGTCCTTACGCGTGGTTTCTTTATCAAGCAACTCGACACCATTCAGACGTAACTGGTTACGCACCGCACGGCTTAATGGCCCGTTCGGATCGCCTGAGTCCAGGATCATGACCTTCATAGTGGAAGGAACCTGCGTGGTATCACGCAGa < 1:1550533/149‑1 (MQ=255) 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ggaaggaaCCTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAAt < 2:895847/149‑1 (MQ=255) aaggaaCCTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCa > 4:652376/1‑149 (MQ=255) catcTGCGTGATACCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCaa < 1:557813/106‑1 (MQ=255) catcTGCGTGATACCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACttt > 2:1405565/4‑149 (MQ=255) aCCTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTa < 2:430334/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTa < 2:804756/149‑1 (MQ=255) cTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTACg > 3:983323/1‑149 (MQ=255) cTGCGTGATACCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGtt < 2:356501/124‑1 (MQ=255) tGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATaa > 3:516997/1‑59 (MQ=255) tGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATaa < 4:516997/59‑1 (MQ=255) tGCGTGATACCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTACGt > 1:865597/1‑149 (MQ=255) tGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTACGTACAg < 2:105516/149‑1 (MQ=255) | AGGATGGAACGTCCTTACGCGTGGTTTCTTTATCAAGCAACTCGACACCATTCAGACGTAACTGGTTACGCACCGCACGGCTTAATGGCCCGTTCGGATCGCCTGAGTCCAGGATCATGACCTTCATAGTGGAAGGAACCTGCGTGGTATCACGCAGATGCCAGCCACACCCGGCGGTGATTAA‑CACCGCCAGAGATAACAACAATGTTGCCAGATATCGCACGCTTCCTCCCGCGCTTAGCCAACGACCAGATTGAGGAGTTTACCTGGTACGTAAATCACTTTACGTACAGTA > NC_000913/671964‑672258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |