| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 774,358 | T→A | 5.5% | L17Q (CTG→CAG) | ybgE → | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 774,358 | 0 | T | A | 5.5% | 569.4 / 17.3 | 163 | L17Q (CTG→CAG) | ybgE | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/85); new base A (4/5); total (73/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
ATGGATTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACGGCGT > NC_000913/774210‑774505 | aTGGATTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCt > 3:21649/1‑149 (MQ=255) tGGATTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTg > 1:842333/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCgg < 1:319427/149‑1 (MQ=255) tCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGgc > 4:484604/1‑149 (MQ=255) ggAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCGCAGGGGGCGCtt < 4:1430483/149‑1 (MQ=255) ggAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCGCAGGGGGCGCtt < 2:439521/149‑1 (MQ=255) aaCGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCGCAGGGGGCGCttgt < 3:870281/149‑3 (MQ=255) cttcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTc < 1:530839/149‑1 (MQ=255) cttcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTc < 3:1067589/149‑1 (MQ=255) ttcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGTAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCTGGCGCTT‑TCCTGCg > 4:967773/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGa > 4:1261127/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGa > 1:759167/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGgc > 3:1265842/1‑149 (MQ=255) tGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGgcg > 3:568777/1‑149 (MQ=255) ttCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGTCTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCt > 1:1032994/1‑149 (MQ=255) ttCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCt > 2:1562975/1‑149 (MQ=255) gTTTGGAGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCt < 2:940568/149‑1 (MQ=255) tttGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTg > 1:937896/1‑149 (MQ=255) ggTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGc < 2:389674/149‑1 (MQ=255) ggTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGc < 2:1032994/149‑1 (MQ=255) cACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGatg > 3:263241/1‑149 (MQ=255) cgcgCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGatgtat < 1:1568433/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGatgtat < 3:776701/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTTGACCACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATTAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGCCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCGGGATGTATGttt < 4:1567616/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATGATCGCGACTTTGTATGCGGTAATTGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGttt < 2:404087/149‑1 (MQ=255) gcTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGa > 3:1483789/1‑149 (MQ=255) ttGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGAcc > 3:552972/1‑149 (MQ=255) gTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGt > 3:824746/1‑149 (MQ=255) cGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGttt < 1:1334640/149‑1 (MQ=255) gAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGtttt < 3:187261/149‑1 (MQ=255) aTCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCAtctc < 4:1141258/142‑1 (MQ=255) aTCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGc < 4:709601/149‑1 (MQ=255) aGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGt < 3:506214/109‑1 (MQ=255) cAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGaa < 4:47771/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGAc < 2:657055/149‑1 (MQ=255) ccGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCa < 1:737035/149‑1 (MQ=255) ggTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGt < 2:490020/149‑1 (MQ=255) cAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGaa < 4:816951/149‑1 (MQ=255) agaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACt < 1:543571/149‑1 (MQ=255) gaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTg > 2:1595851/1‑149 (MQ=255) gaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTg > 1:250389/1‑149 (MQ=255) gaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTg > 4:652536/1‑149 (MQ=255) aagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTgg > 3:1291134/1‑149 (MQ=255) agaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGa > 1:1052950/1‑149 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGaa > 1:389579/1‑149 (MQ=255) aCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGaaa < 4:1554951/149‑1 (MQ=255) aTCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGAc > 4:1322148/1‑133 (MQ=255) aTCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGAc < 3:1322148/133‑1 (MQ=255) aTCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGa > 1:1526925/1‑145 (MQ=255) atgaGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGt < 2:710151/68‑1 (MQ=255) aGTAAGATTATGGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTgg > 3:1375331/1‑99 (MQ=255) aGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTgg < 4:1375331/99‑1 (MQ=255) tAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGtt > 1:1528493/1‑149 (MQ=255) tAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGtt < 4:620533/149‑1 (MQ=255) tAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGtt > 3:1191779/1‑149 (MQ=255) aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGAccc > 2:1246080/1‑100 (MQ=255) aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGAccc < 1:1246080/100‑1 (MQ=255) aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTa < 2:700105/149‑1 (MQ=255) aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTa < 4:1483789/149‑1 (MQ=255) gATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTAt > 3:565843/1‑149 (MQ=255) aTTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTAtt < 3:1036817/149‑1 (MQ=255) aTTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTAtt > 4:1036817/1‑149 (MQ=255) ttATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTgg < 1:1209115/137‑1 (MQ=255) ttATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTgg > 2:1209115/1‑137 (MQ=255) tATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGc < 3:899642/149‑1 (MQ=255) aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCt < 2:76227/149‑1 (MQ=255) aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCt < 1:1478042/149‑1 (MQ=255) tCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTg > 2:143295/1‑149 (MQ=255) cgcgACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGa < 4:552972/149‑1 (MQ=255) cgcgACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGa > 3:1125973/1‑149 (MQ=255) cgcgACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGa < 2:749869/149‑1 (MQ=255) cgACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGAtg > 2:980472/1‑149 (MQ=255) gACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGAtgt > 2:182913/1‑149 (MQ=255) cTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTgg > 3:506948/1‑149 (MQ=255) tttGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGttt > 1:342369/1‑135 (MQ=255) tttGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGttt < 2:342369/135‑1 (MQ=255) tttGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTggg < 2:1294764/149‑1 (MQ=255) ttGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGc < 3:1437208/149‑1 (MQ=255) tATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGATCTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGt > 4:124801/1‑149 (MQ=255) tATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGt > 3:912536/1‑149 (MQ=255) tGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCt < 2:759167/149‑1 (MQ=255) tGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCt < 2:1492128/149‑1 (MQ=255) tGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgt < 3:1454489/149‑1 (MQ=255) tGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgt < 1:1595851/149‑1 (MQ=255) gggcAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtg < 4:844078/146‑1 (MQ=255) ggaaaGCGCCCGCAGGGGGCGCTTGTCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtg > 3:434230/4‑149 (MQ=255) ggaaaGCGCCCGCAGGGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtgt < 1:760792/146‑1 (MQ=255) gACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtgt < 4:246590/149‑1 (MQ=255) gACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtgt < 2:842333/149‑1 (MQ=255) gaaaGCGCCCGCAGGGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTg > 4:113822/3‑144 (MQ=255) gaaaGCGCCCGCAGGGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTg < 3:113822/142‑1 (MQ=255) cAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGa < 3:652536/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGAt < 1:661552/149‑1 (MQ=255) aGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGAtt < 1:182913/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCt < 1:961883/134‑1 (MQ=255) ccccTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACt < 1:1468097/92‑1 (MQ=255) ccccTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACt > 2:1468097/1‑92 (MQ=255) cccTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAAc < 2:739558/90‑1 (MQ=255) cccTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAAc > 1:739558/1‑90 (MQ=255) cTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACGGCGt < 1:1419564/149‑1 (MQ=255) | ATGGATTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACGGCGT > NC_000913/774210‑774505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |