| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3383314 = | 208 (0.840) | intergenic (+47/+16) | degS/mdh | serine endoprotease, periplasmic/malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding | |||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAG > NC_000913/3383166‑3383461 | tctatcggtaccctgagcgcatttgaacagaacgcgctggaaggtatgctggatacgctgaagaaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTtta > 1:1960020‑M1/119‑149 (MQ=255)gCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTtta < 1:1926142/149‑1 (MQ=255)gCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTtta > 2:2266366/1‑149 (MQ=255) cGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCAGCAACCAATTTAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTttat < 2:215369/149‑1 (MQ=255) ggAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCATGTCACCATTCAGCAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTttatt > 2:2031183/1‑149 (MQ=255) ggAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTttatt > 4:199946/1‑149 (MQ=255) ggAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTttatt > 3:1728636/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAGCAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGc < 4:1433935/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCt < 4:1068439/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATcc > 2:1481851/1‑143 (MQ=255) tGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtta < 1:563149/149‑1 (MQ=255) aTCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatt < 4:1249628/149‑1 (MQ=255) aTCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatt < 4:1668091/149‑1 (MQ=255) aTCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatt > 1:797480/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAAc < 1:1116332/149‑1 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACg > 3:401342/1‑149 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACg > 4:732496/1‑149 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACg > 4:2416621/1‑149 (MQ=255) 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gTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAAc > 1:1821235/1‑120 (MQ=255) ttAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAAt > 4:2115273/1‑104 (MQ=255) ttAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAAt < 3:2115273/104‑1 (MQ=255) ttAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt < 4:808884/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAg < 2:740427/149‑1 (MQ=255) aaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTtta > 2:401526‑M1/56‑86 (MQ=255) aaagatatcgccctgggcgaagagttcgttaataagtaattgattagcggataatAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTtta < 1:401526‑M1/31‑1 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aaaaccggagcacagactccggttttttGTTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAttt > 1:243468‑M2/29‑149 (MQ=255) AAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTa > 4:866749‑M1/1‑149 (MQ=255) AAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTa > 1:452377‑M1/1‑149 (MQ=255) aaaccggagcacagactccggttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTa > 1:1405904‑M2/28‑149 (MQ=255) aaccggagcacagactccggttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAg < 4:305534‑M2/61‑1 (MQ=255) cGGAGT‑CTGTGCTCCGGTAGTTTATTATCCGCTAAGCAAATACTTATTAACGAAACCTTCGCCCCGGGCGATATCTTCCTTCAGCGTATCCCACATAACTTTCAGCGCGTTCTGATCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAAGTTTAGGct > 2:90241/1‑149 (MQ=255) t‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAAc < 2:337710/50‑1 (MQ=255) t‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAAc > 1:337710/1‑50 (MQ=255) t‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTcc > 3:1949694/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGcc < 2:1223155/149‑1 (MQ=255) ctccggttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCg > 4:934816‑M2/13‑149 (MQ=255) tccggttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGt > 1:1692902‑M2/12‑149 (MQ=255) cggttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtc < 3:1894065‑M2/52‑1 (MQ=255) ttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTa < 4:2066956‑M2/143‑1 (MQ=255) ttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTAcc < 1:2338374‑M2/145‑1 (MQ=255) tATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAg < 2:55430‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGT‑CTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCAG > NC_000913/3383166‑3383461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |