| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620614 | NA (NA) | 13 (0.140) | 7/166 | NT | 100% | coding (1423/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620635 | 0 (0.000) | coding (1444/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620517‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:1334806/100‑1AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:885565/100‑1 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGT > 1:1086092/1‑100 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC > 2:367024/1‑100 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 2:1194766/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA > 2:2631376/1‑100 tcCAGCCCGGATGAGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG > 1:1861864/3‑100 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG > 1:1175962/1‑100 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:1918881/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 1:1356264/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:1310856/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 1:2106474/100‑1 ATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGC < 1:1778063/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:756620/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:960079/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 2:2353765/99‑1 CCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTT < 2:145688/94‑1 CAACCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATG > 2:322215/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGG > 1:1809913/1‑100 CAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC > 1:747139/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 2:2335003/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCAATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 1:802926/1‑100 AGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 1:15289/1‑100 AGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 2:19873/1‑100 AGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC > 2:839554/1‑99 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 1:681243/1‑100 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 1:121963/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 1:2521038/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC > 2:463943/1‑100 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:481710/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC > 1:1367446/1‑100 GTCAGGC‑CCGGAGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:1947213/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 1:728672/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 1:1336139/100‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC < 1:1212604/100‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC > 1:1604296/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:964434/1‑100 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620517‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |