| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,993,889 | T→A | 19.6% | intergenic (+33/‑50) | ygeI → / → pbl | uncharacterized protein/pseudogene, peptidoglycan‑binding enzyme family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,993,889 | 0 | T | A | 19.6% | 431.3 / 106.4 | 197 | intergenic (+33/‑50) | ygeI/pbl | uncharacterized protein/pseudogene, peptidoglycan‑binding enzyme family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/75); new base A (24/14); total (108/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.29e-02 | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATT > NC_000913/2993791‑2993988 | ccTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACttt < 1:999342/100‑1 (MQ=255) ttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata < 2:3227707/100‑1 (MQ=255) ttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata < 2:438815/100‑1 (MQ=255) ttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata > 1:1647875/1‑100 (MQ=255) cAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat < 1:77533/100‑1 (MQ=255) cAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat < 2:282258/100‑1 (MQ=255) aaaaTGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata > 2:1249642/1‑100 (MQ=255) aaaTGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAg < 2:1208437/100‑1 (MQ=255) aTGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTa > 1:1690457/1‑100 (MQ=255) tGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAt > 2:3474979/1‑100 (MQ=255) tGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAt > 1:909063/1‑100 (MQ=255) gATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc > 1:3950348/1‑100 (MQ=255) atGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCg < 1:1453684/100‑1 (MQ=255) tGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGt > 1:1292403/1‑100 (MQ=255) tGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGt < 2:16987/100‑1 (MQ=255) tGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGt < 1:2829705/100‑1 (MQ=255) tGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGt < 1:3614332/100‑1 (MQ=255) tGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGt < 1:2183957/100‑1 (MQ=255) tGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAAAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGt > 1:2766201/1‑100 (MQ=255) tATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTc > 2:2654795/1‑100 (MQ=255) tATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGtta < 1:2264530/100‑2 (MQ=255) tATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGtta < 1:1039363/100‑2 (MQ=255) tATTCAGAAGATAAACCTATCTTACCTTACAATAAAATTGAGAGGTAGACGATTGACCAAATAAAACAAAACGAGATACTTTTATAATAGTATCACGtt > 2:3285209/1‑99 (MQ=255) aTTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTcc > 1:491228/1‑100 (MQ=255) aTTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGttat < 1:3606246/100‑3 (MQ=255) aTTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGttat < 2:1984601/100‑3 (MQ=255) ttCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAATTCATAACGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGttatg < 2:2108496/100‑4 (MQ=38) agaagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttc < 1:215218/100‑1 (MQ=255) agaagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttc < 2:2942349/100‑1 (MQ=255) agaagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttc > 2:3330453/1‑100 (MQ=255) aagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcat < 2:1473912/100‑1 (MQ=255) gaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcattc < 1:3464869/100‑1 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcattca < 2:606397/100‑1 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcattca < 2:1582994/100‑1 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcattca > 1:1078905/1‑100 (MQ=255) tAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCaa > 2:3677403/1‑100 (MQ=255) aaTCCTATCTTACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAAt < 1:116627/100‑1 (MQ=255) aTCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATc < 2:549051/100‑1 (MQ=255) tCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATcc < 2:2523262/100‑1 (MQ=255) tCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATcc < 1:1548332/100‑1 (MQ=255) ccTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCt < 1:3443613/100‑1 (MQ=255) ccTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCt > 1:2379134/1‑100 (MQ=255) ccTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCt < 2:2871592/100‑1 (MQ=255) ccTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCt < 2:2889476/100‑1 (MQ=255) aTCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTcac < 1:978614/100‑1 (MQ=255) aTCTAAACTTACTATAAAATAAAGTGGAAGACGATTGACCAAATAAATCATAACCAGATTCTCTTCTAATAGTATCTCGATCATTTCAATCAATcc > 2:3496080/1‑96 (MQ=255) cACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCTTCACACAt > 2:3461957/1‑100 (MQ=255) aCCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATg < 2:231222/100‑1 (MQ=255) ccTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑a > 1:1499058/1‑100 (MQ=255) cattACTATAAAACTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑a > 1:2676468/3‑100 (MQ=255) cTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑aa < 1:273693/100‑1 (MQ=255) ttACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑aaa > 2:3386422/1‑100 (MQ=255) aCTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑aaaaa < 1:2352254/100‑1 (MQ=255) cTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑aaaaaa < 1:3475004/100‑1 (MQ=255) cTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑aaaaaa > 1:3315742/1‑100 (MQ=255) tataAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAat > 2:3940566/1‑100 (MQ=255) ataAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAata > 1:1783147/1‑100 (MQ=255) aaaaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATg > 2:2754962/1‑100 (MQ=255) aaaaTTAAGTGGTAGACGATTAACAAAATAAATCATAACGAGATAGTTTTATAATAGTATCTCGTTCTTTTACTTCAATTCTCATAAATG‑AAAAAATATg > 2:1906480/1‑100 (MQ=255) aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATgcg < 1:3677431/100‑1 (MQ=255) aTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATgcgc > 2:2386889/1‑100 (MQ=255) gTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCAcc > 1:3002206/1‑100 (MQ=255) tGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCa < 1:2445378/100‑1 (MQ=255) gTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCaaa < 1:3084206/100‑1 (MQ=255) tAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCaaaa > 1:937873/1‑100 (MQ=255) aGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAg < 2:3854836/100‑1 (MQ=255) aCGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCaaa < 2:225010/96‑1 (MQ=255) cGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTACTTTCATTAAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTa > 2:1922760/1‑100 (MQ=255) gATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATACTCACAAATG‑AAAAAATTTGTGTTCACAAAAAGTTaa > 2:964142/1‑100 (MQ=255) ttGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAAt < 2:1783138/100‑1 (MQ=255) ttGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAAt < 2:872194/100‑1 (MQ=255) gACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTc > 1:2499611/1‑100 (MQ=255) ccAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCGCCAAAAGTTAAATTCtt > 1:2215760/1‑100 (MQ=255) aataaatCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAAc > 1:3147534/1‑100 (MQ=255) aataaatCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAAc < 2:388907/100‑1 (MQ=255) ataaatCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAAc < 2:402153/100‑1 (MQ=255) ataaatCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAAcc < 1:2563348/100‑1 (MQ=255) gaaaggaaCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATc > 1:2914882/7‑100 (MQ=37) ggaaCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCa > 2:855058/3‑100 (MQ=255) ggaaCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCa > 1:2174361/3‑100 (MQ=255) gaaCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAACATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCAc > 2:947530/2‑100 (MQ=38) gaaCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCAc > 1:3907845/2‑100 (MQ=255) aaCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACg > 2:1535198/1‑100 (MQ=255) aCGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGt > 1:1958206/1‑100 (MQ=255) aCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGt > 1:3351281/1‑100 (MQ=255) aCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGt > 2:3653209/1‑100 (MQ=255) aCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAAACCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGt > 2:2155799/1‑100 (MQ=39) aCGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTAATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGAGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACAATCTTCACg > 2:3222828/1‑99 (MQ=38) cGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGtt > 1:2120580/1‑100 (MQ=255) cGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGtt > 2:670339/1‑100 (MQ=255) cGAGATACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGtt > 1:38174/1‑100 (MQ=255) gagaTACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGttt > 1:1004568/1‑100 (MQ=255) gagaTACTATTATAAAAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGttt > 1:880104/1‑100 (MQ=255) agaTACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGtttt > 1:3390239/1‑100 (MQ=255) agaTACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGtttt > 1:1821169/1‑100 (MQ=255) gaTACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTg < 1:525986/100‑1 (MQ=255) cTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGtata > 2:1035441/1‑100 (MQ=255) cTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGtata > 2:1093798/1‑100 (MQ=255) cTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGtata > 2:3099393/1‑100 (MQ=255) tttATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAtatt > 1:711149/1‑100 (MQ=255) | CCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATG‑AAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATT > NC_000913/2993791‑2993988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |