| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 731011 | 149 (0.940) | 42 (0.290) | 9/166 | NT | 22.2% | coding (1429/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 731020 | 155 (1.050) | coding (1438/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CAGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/730907‑731011‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtcagGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/731020‑730922 CAGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAAC > 2:179632/1‑100CAGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAAC > 1:3969638/1‑100CAGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAAC > 1:970101/1‑100CAGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGAGGTTTACTATAACCACCACAGCCAGTGAAC > 1:3784144/1‑100 AGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACG < 2:1427843/100‑1 AGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAAC < 1:637800/99‑1 AGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGACATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACG < 1:2702458/100‑1 GAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACat > 1:1394540/1‑98 GAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGT > 2:135705/1‑100 GAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGT > 1:280406/1‑100 GAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGT > 2:287376/1‑100 AATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTC < 2:359912/100‑1 AATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTC < 2:96381/100‑1 TACGGTCGGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAG < 1:1748002/100‑1 ACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAG < 1:4400674/99‑1 GTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTG < 2:1552370/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 1:1025702/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 2:387570/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 1:1153489/100‑1 gtgGGGCTTCATCACGCGCATAACCAGGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCTGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 1:2005070/97‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 2:1096732/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 2:166539/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 1:3109334/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 1:1367915/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 1:167951/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:755606/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:1217021/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:3114282/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:290031/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:4259550/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 1:607997/100‑1 GGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 1:3864435/100‑1 GGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 2:4167900/100‑1 GGCCTCATCACGTGCATACCCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 1:3313229/100‑1 GGCCTCATCACGTGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:1452176/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCA‑CACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTG < 1:84308/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:2091343/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:2200191/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 1:3845346/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:1635392/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:3559588/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 1:2824040/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:1478112/100‑1 GCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTG < 2:1788027/100‑1 GCCTCATCACGCGAATCACAACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCGCCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTG < 1:1738470/100‑1 ccgCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGG < 1:3353723/97‑1 CCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTCTTATAACCTCCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGG < 2:3073950/100‑1 GCCGGATGGCAGGGCAGCGGCGTGTTACTATAACCACCACTGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAA < 1:1737426/97‑1 GCCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAG > 1:1025476/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGG > 1:1809933/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGG > 2:269465/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGG > 1:1604516/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCC > 2:3489893/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCC > 1:1867111/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCC > 1:3921330/1‑100 AGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCC > 2:3397002/1‑100 AGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGAT > 1:4042705/1‑85 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:4131023/1‑100 GTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:4039364/1‑100 TAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGG > 1:2653139/1‑95 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC > 2:420823/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 1:4261387/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 2:343922/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 2:3583027/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTACCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 1:297338/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:1272010/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 2:243464/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 1:3141870/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 2:3820233/100‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC < 1:799391/100‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC < 1:2233432/100‑1 GGC‑CCGGTGGCTGGCGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAATAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:2719862/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:2903653/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:2544196/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:4158758/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:1717761/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:222302/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:2787656/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:79630/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGGTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:3458871/1‑100 CAGAATACAGTCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/730907‑731011‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtcagGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/731020‑730922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |