| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 207,486 | G→T | 16.9% | M787I (ATG→ATT) | dnaE → | DNA polymerase III alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 207,486 | 0 | G | T | 16.9% | 240.8 / 36.2 | 100 | M787I (ATG→ATT) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/49); new base T (6/11); total (40/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGGATTTAACAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCGGTCT > NC_000913/207387‑207584 | cGGATTTAACAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATg < 2:1334948/100‑1 (MQ=255)cGGATTTAACAAATCGCACTATGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATg > 1:689214/1‑100 (MQ=255) gATTTAACAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGAc > 1:52113/1‑100 (MQ=255) aCAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgc < 2:273776/100‑2 (MQ=255) aCAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgc < 1:1269532/100‑2 (MQ=255) aCAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGa < 1:249982/100‑1 (MQ=255) cAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgcc < 2:702688/100‑3 (MQ=255) cAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgcc < 2:27561/100‑3 (MQ=255) cAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGat < 1:846030/100‑1 (MQ=255) aaaTCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgcca < 2:2290482/100‑4 (MQ=255) aaaTCGCACTCTGCGGCCTATGCGTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAACGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGAccgccctta > 1:1059327/1‑96 (MQ=255) aaTCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTGATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgcca < 1:1654686/99‑4 (MQ=255) aTCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgccata < 2:271146/100‑6 (MQ=255) aTCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATg < 1:395014/100‑1 (MQ=255) aTCGCACTCTGCCGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgccat < 2:2322146/99‑5 (MQ=255) tCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATgg < 1:1418544/100‑1 (MQ=255) tCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATgg < 2:56049/100‑1 (MQ=255) tCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATgg < 2:1296084/100‑1 (MQ=255) cGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGa < 1:2320042/100‑1 (MQ=255) cGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCGGAAAGCTCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCACCGGTAATGACCGCCGATATgg > 1:379894/1‑99 (MQ=255) cGCACCATGCGGCTTATGCATTGCTTTCACATCAACCGTTATGGGTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTCTATGGCGGCGGTCATTAccgccgcc < 1:2262290/95‑3 (MQ=255) gCACTCTTCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTACGGCTGAAAGCGCACTACCCTGACGAGTTCATGGCGGCGGTCATTGccgccgccataaac < 1:2418780/100‑9 (MQ=255) gCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGac < 1:2201117/100‑1 (MQ=255) gCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGac > 1:1275745/1‑100 (MQ=255) gCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGac < 1:2422452/100‑1 (MQ=255) gCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGac > 1:1403258/1‑100 (MQ=255) cACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGaca < 1:2019128/100‑1 (MQ=255) aCTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTCATTAccgccgccataaactc < 2:218151/100‑11 (MQ=38) gtctGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTACGGAGTTTATCGCGGCGGTAACAACCGCCGAGATGGaca > 1:1113831/2‑98 (MQ=255) gtctGCGGCCTATAATTTGGTGCCATATCAAACGTTATGGCTGCAAGCGCACTATACTGCGGAGTTTAAGGCGGCAGAAAAGACTGCCCAAGTGGac > 1:1270497/2‑97 (MQ=255) ctctGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGacaac > 2:349282/1‑100 (MQ=255) ctGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAacac > 2:2086800/1‑100 (MQ=255) ctGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGCTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAacac > 2:2461265/1‑100 (MQ=255) gCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCg > 2:234569/1‑100 (MQ=255) ccTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGaa < 2:276070/100‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAggtg < 2:1485333/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAggtggt > 2:31414/1‑100 (MQ=255) cTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTACGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAggtg > 1:554187/1‑98 (MQ=255) tttGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGgtggtg < 1:1216083/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGtggtgg < 2:1838118/100‑1 (MQ=255) tGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTggg > 2:1606171/1‑100 (MQ=255) ggTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGt > 2:1718183/1‑100 (MQ=255) gtCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtg > 1:13807/1‑100 (MQ=255) gtCATATCAAACGATATGGCTGAAAGCGCACTGTCCTGCGGAGCTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGCTATGGACAACACCGAGAAGGCGGTGGGACtg > 1:1168972/1‑100 (MQ=255) cATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtggt > 2:1001181/1‑100 (MQ=255) atatCAATCGTCATGGCTCAAAGCCCACCACCATGAGGAGTGTAAAGCGTCGGTCATGACCGCCGATATGCACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtggt < 1:2211240/99‑1 (MQ=255) atatCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtggtg < 1:746124/100‑1 (MQ=255) atatCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtggtg < 2:1385454/100‑1 (MQ=255) tatCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtggtgg < 1:920408/100‑1 (MQ=255) tatCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCtggtgg < 1:2348917/100‑1 (MQ=255) atCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTATTGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGa < 1:1126593/100‑1 (MQ=255) atCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTAGCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGa < 1:2461248/100‑1 (MQ=255) cAAACGTTATGGCTGAAAGCGCATTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATg > 2:111206/1‑100 (MQ=255) cAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATg < 1:2568022/100‑1 (MQ=255) aaaCGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGa > 2:252094/1‑100 (MQ=255) aaaCGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGa > 2:2010320/1‑100 (MQ=255) aaaCGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGa < 1:2052289/100‑1 (MQ=255) aaCGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAg < 2:1341065/100‑1 (MQ=255) cGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTg < 2:588059/100‑1 (MQ=255) aTGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTgg < 1:1346714/100‑1 (MQ=255) ggCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCg > 2:2518106/1‑100 (MQ=255) ggCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCg < 1:1718174/100‑1 (MQ=255) ggCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCg < 2:265814/100‑1 (MQ=255) gCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCgg > 2:2477118/1‑100 (MQ=255) gCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCgg > 2:670752/1‑100 (MQ=255) tGAAAGCGCACCATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGGAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGAt > 1:1359458/1‑100 (MQ=255) gcgcACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGc < 1:897277/100‑1 (MQ=255) gcgcACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGc < 2:1162453/100‑1 (MQ=255) gcgcACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGc < 1:1606162/100‑1 (MQ=255) cgcACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGc > 1:651318/1‑99 (MQ=255) cgcACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCt > 2:676544/1‑100 (MQ=255) aCTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGaa > 1:1949937/1‑100 (MQ=255) aTCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAAt > 2:1528033/1‑100 (MQ=255) ccTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATcc < 1:1143924/100‑1 (MQ=255) ccTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATcc < 2:52114/100‑1 (MQ=255) tGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTg < 2:1910719/100‑1 (MQ=255) tGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTg < 1:1009904/100‑1 (MQ=255) tGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTg < 2:2427672/100‑1 (MQ=255) gCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGc < 2:616318/100‑1 (MQ=255) gCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGc < 2:345039/100‑1 (MQ=255) ggAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGcc < 1:234313/99‑1 (MQ=255) aGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGccacc < 1:346207/100‑1 (MQ=255) aGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGccacc < 1:844237/100‑1 (MQ=255) ttATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAg > 1:2591195/1‑99 (MQ=255) catatcggcggTCATTACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGat > 2:2001894/6‑100 (MQ=255) catatcggcggTCATTACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGat > 2:113102/6‑100 (MQ=255) catatcggcggTCATTACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGCCTGGCGGATGAGTGCAGCCGGACGGGGCTGAAAATCCTGccacca > 1:1281517/6‑97 (MQ=255) aTGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGata < 2:379800/100‑1 (MQ=255) ggcggcGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGAtata < 2:1017982/100‑1 (MQ=255) atcggcggTCATTACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGAtata > 2:1460538/3‑100 (MQ=255) atcggcggTCATTACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGAtata > 2:2200139/3‑100 (MQ=255) tcggcggTCATTACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGACTGGTGAATGAGTGCTGGCGCATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATaa > 1:1858995/2‑100 (MQ=255) ggcggTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAAc < 1:111205/100‑1 (MQ=255) gTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCg > 1:58219/1‑100 (MQ=255) gTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGAGGTGGGTCTGGTGGATGAGAGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCCCCAGATATAAACTCCg > 1:849538/1‑100 (MQ=255) tcttGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCgg < 2:842593/97‑1 (MQ=255) tAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTAGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCgg < 2:1545736/100‑1 (MQ=255) ttGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCGGTc < 1:325103/99‑1 (MQ=255) tGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCGGTca > 2:325105/1‑99 (MQ=255) tGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCCGGTGGCTGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCggaga > 1:842590/1‑97 (MQ=255) | CGGATTTAACAAATCGCACTCTGCGGCCTATGCTTTGGTGTCATATCAAACGTTATGGCTGAAAGCGCACTATCCTGCGGAGTTTATGGCGGCGGTAATGACCGCCGATATGGACAACACCGAGAAGGTGGTGGGTCTGGTGGATGAGTGCTGGCGGATGGGGCTGAAAATCCTGCCACCAGATATAAACTCCGGTCT > NC_000913/207387‑207584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |