| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4293080 = | NA (NA) | 29 (0.200) | 10/490 | 12.3 | NA | intergenic (+38/+606) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| ? | NC_000913 | = 4293644 | NA (NA) | noncoding (562/602 nt) | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
AAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCG > NC_000913/4292783‑4293374 | aaGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGaa < 1:1102998/299‑1 (MQ=255) aGGGATTGCGGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATg < 1:362203/300‑1 (MQ=255) ggATTGCTGGCGGGGCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTAGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGaa < 2:261869/296‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCTAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGcc < 1:836077/293‑1 (MQ=255) cGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGCAAGCGCT‑GCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACCGCGGATAAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCg > 2:1025547/1‑296 (MQ=255) gTGCCGGGCGGGTCGTTTGTGGGGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGGGTAGGGATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTGATTGCTGGTGTTGACCGTATGCGCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AAGTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACGGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGc < 1:157331/300‑1 (MQ=255) tGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTACGCAAGCGCTGGCTGATGAG‑CGCGAAGTGCTGGGCAAATTTGTTAAAACTGCGGATCCATAATTGAAGATTGACGGGGATATCAACCCCGCATTGTGTGAATGctt > 2:614143/1‑287 (MQ=255) tGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGACAAATCATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCCATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCtt > 1:371226/1‑301 (MQ=255) ggCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGACGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGCTTGCCAAGTGGGAACCCA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGCG‑CGTGAAGTGCTGGTCAAATTTGATAAAACTGCGGATCACTAATTGAAGATTGCCGGGGATCTCCACCCGGCCATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTg > 2:954018/1‑297 (MQ=255) tgtCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGt > 1:847340/1‑299 (MQ=255) cGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACCTGGCGCGTACTGCGCTGAACGTCGTGGGTAATGCGCTTGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGGGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CTTGAGGTGCTGGGCGAATTTGATAAAAATGCGGATCAATAATTGATGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATTTGTGAATGCTGGATGCGACGCTGTCCGTGTGTTa > 1:747795/1‑300 (MQ=255) cGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATACACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGGCGCGTCtt > 2:1066436/1‑299 (MQ=255) tttGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCa > 1:396036/1‑301 (MQ=255) tgtgGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATc < 1:21874/298‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACAGGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATc < 1:468726/298‑1 (MQ=255) ttGCTGGCAACGCTGGGGAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGc < 2:645404/301‑1 (MQ=255) gCAACGCTGGGTTGGGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGGGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAGCGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGAc < 1:1073147/300‑1 (MQ=255) gCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGAc < 1:1232075/300‑1 (MQ=255) aCGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACa > 1:56323/1‑298 (MQ=255) gggTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGTCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAAt < 1:1116932/300‑1 (MQ=255) gggTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTACGCAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAACCTGCGGATCACTAATTGATGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCTACGTGTGAATGCCTGACTCGTCGCTTGCCGCGCCTTATCAGGACTCAGCCAGACa > 2:579872/1‑293 (MQ=255) gggTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGAc > 1:270854/1‑292 (MQ=255) gggTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCaa > 2:921003/1‑299 (MQ=255) gCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGACCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCCATGCGTGAATGCCTGATGAGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCCGACAGCGCACTAGc > 2:113876/1‑298 (MQ=255) tAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGACGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGGCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGAtt > 1:1152665/1‑301 (MQ=255) tAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGTGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGa > 1:188783/1‑299 (MQ=255) tAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAACTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGAtt > 1:1149096/1‑301 (MQ=255) ggTATTCCGGTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGAttt < 1:826675/300‑1 (MQ=255) ggTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGAGGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGCTATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATTCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTAc > 2:41876/1‑275 (MQ=255) gTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGCTTGCCGGGCATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTTCGCCAGACCGCGCATCAGCCTGAtt > 2:567637/1‑298 (MQ=255) gTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCATGATTTa > 2:175263/1‑300 (MQ=255) gTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTAGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTa > 2:1381771/1‑300 (MQ=255) ttCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCg < 1:866174/300‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCACTGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGAtt > 2:469937/1‑301 (MQ=255) aGGTCTGGCGTTTAATGCTGGTGTTGGCCGTATCCTCGACATGGCGCGTGCTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCg < 2:513768/290‑1 (MQ=255) ggTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCCATGTGTGACTGCCTGATg > 1:798742/1‑231 (MQ=255) gTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGGCATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATa < 2:127548/300‑1 (MQ=255) 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gtgtgAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTCACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCACTAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATCCGACGCTTGCCGCTTCCTCTCAGCCATACTCCATCCAGCCCCATCGccctctt > 2:1413567/1‑290 (MQ=11) gtgtgAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCTAGACAGCGCAATACCCTGATTTAGCg > 1:941524/1‑300 (MQ=25) | AAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACA‑AATTTGACCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAG‑CGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCG > NC_000913/4292783‑4293374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |