| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 2,945,535 | 0 | T | A | 21.9% | 379.6 / 38.3 | 232 | P787P (CCA→CCT) | ftsK | cell division protein FtsK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/122); new base A (43/6); total (98/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CGTCGGTTTATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGT > DH1/2945385‑2945685 | gtcgGTTTATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCtgtg < 2:1234987/151‑1 (MQ=255) cgGTTTATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACGGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGATGCTGAGgc > 5:1205879/1‑151 (MQ=255) cgGTTTATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTgg < 2:584067/150‑1 (MQ=255) cgGTTTATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGgc > 3:1345968/1‑151 (MQ=255) ttATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCa < 5:1076222/150‑1 (MQ=255) tATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTCTGGAGCAAc > 5:47499/1‑151 (MQ=255) tGCAAGGGACGGGTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAAcc < 6:1383169/150‑1 (MQ=255) tGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGAGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATAGATGCTGAGGAGCAAc > 6:189171/1‑149 (MQ=255) tGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGAGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGAAAGTGCTGCTGAGGCGCaggcg > 7:216331/1‑147 (MQ=255) gCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTCTTGCGGCTGCTGATATTGATCCAGAGCCGCAAcccg > 8:324764/1‑149 (MQ=37) aaCGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGgtt < 3:1034076/151‑1 (MQ=255) aaCGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTAGTTGGGGCTGCTCATCTAGCGGCTGTGGCGCACCGGgtt > 1:1052894/1‑151 (MQ=37) ggacggCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGgttgtt < 7:291904/151‑1 (MQ=255) acggCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGCGCAACCGGTTGTTGc > 5:1109572/1‑151 (MQ=255) ggcgggcGCCATTACGCATCAACAGCGGAGGAAGCAGGGTAGCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCgg < 8:552400/145‑1 (MQ=255) ggCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCgg < 1:1090067/151‑1 (MQ=255) gCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGGGGAGAAAcgcggaggaccggg > 3:468547/1‑138 (MQ=25) tGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGAGCAAGAGGTTCTTGCGgctg > 1:291073/1‑151 (MQ=255) gTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGgct < 2:35357/149‑1 (MQ=255) gTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGGGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGgct < 2:989039/149‑1 (MQ=255) tCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGAGCAACCGGTTGTTGCGgctgct > 7:1252798/1‑151 (MQ=255) gCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGa < 8:1063136/151‑1 (MQ=255) cATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGata < 8:1154519/151‑1 (MQ=255) cATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGATGTGGAGCAACAGGTTGTTGCGGCTGCTGaa > 1:127854/1‑149 (MQ=255) aTTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGGTGATGATGCGCCCGCGGTTGTGGCGGCtgatgagc > 3:971062/1‑148 (MQ=25) aCGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATAGTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgt < 2:645708/151‑1 (MQ=255) cGCATCAACAGGGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgtg < 3:543227/151‑1 (MQ=255) cGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgtg < 4:547222/151‑1 (MQ=255) cGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgtg < 5:788014/151‑1 (MQ=255) aTCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGAGCAACCGGTTGTTGAGGCTGCTGATATtgttcat > 8:244543/1‑147 (MQ=255) cAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑g < 4:946738/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑gcg < 1:93774/151‑1 (MQ=255) gCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑gcggcg < 6:1205930/150‑1 (MQ=255) ggATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACAGGTTGTTGGGGCTGCTCATATTGCTGCTGAGGAGCCGCACACTGGTGCGCCTGCTGAGATtggtcaagcagcgctc > 3:830694/1‑137 (MQ=18) gATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGATGCTGAGTAGCAACAGGTTCTTGATGCTGATGATAATGTTCCT‑gcagtgg > 8:932513/1‑143 (MQ=18) tGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGATGCTGTGGGGCAACCGGTTGTTCCGGCAGTATAGATAGTGGCTGGCGgcgcccgg > 3:271165/1‑147 (MQ=18) aaGCAGGGTAGCCTGCGGTCGTGGCCCAACTGGCTCTTGTGGCTGCTGATACTCCGGCTGCGGCGCAACCGGTGGTTGCGGCGGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGGTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGc < 6:1145937/151‑1 (MQ=255) gcggaggcacttccGGATGAGGCGCAAACGGTTGATGCGGCTGCGGATCGTGGGGCTGCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCT‑GCGGTGCAACCGGTtg < 1:748943/138‑1 (MQ=18) cAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCtgt < 4:621974/151‑1 (MQ=255) aGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCtgtt < 5:324414/151‑1 (MQ=255) aGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACAGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCACCCGGCtgat > 2:1150834/1‑149 (MQ=255) gggTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCtgttg < 1:36550/151‑1 (MQ=255) aTCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTgg < 8:741149/150‑1 (MQ=255) aTCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCACAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTgg < 7:868645/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGTTGTGGGGCAAGTGGCGGTGGTTGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTTATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGgct < 6:289011/150‑1 (MQ=21) ccTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGgctg < 1:1012696/151‑1 (MQ=255) ccTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGATGAGGAGCAACAGGATCTTGAGGCTGCTGATCATCTTCCT‑GCCGCGCAATCTGCtgttgt > 5:269101/1‑146 (MQ=17) ccTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGGGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGgct < 4:788113/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGctgctg < 3:1087135/151‑1 (MQ=255) ggTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTCGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCATCCGGCTGTGGTGGCTGCTGAt > 6:1088675/1‑151 (MQ=255) ttggctgtaCTGGCTGTTGTGGCTGCTGATAGTGCTGCTGGGGCGCTACGGGTTGTTGCGTGTGCTGATATTGGTGCTGTGGCGGAACCTGTTGTTGCTGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATAct < 7:43688/142‑1 (MQ=255) ggggCGCACGTGGCTGGTGGGGCTGCTGATCCTGCTGCTGCGGCGCACGCGGTTGATGCTGCTGCGGAGATTGCGGCTGTGGCGGAACCGGGTGTTGCGGCTGCGGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATActg < 7:1180117/149‑1 (MQ=255) ggCGGAAGTGGCTGTTGCGGCTGCTGATACTCCGGCTGCGGCGGAACCGGTTGATGCGGCTGCTGATTTTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATActgcg < 1:508296/151‑1 (MQ=21) gcAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGAGCAACAGGTTGTTGCGGCTGGTGAAAATGTTCCT‑GCCTCGCAATCGGCTGAGGTGCCTGCTGATaatcagtc > 3:636510/1‑143 (MQ=17) cAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGATGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGTCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGATGATActcaggctg > 7:307870/1‑151 (MQ=255) atgtGGCTGTTGTTGCTTATGCTTCGTCTGCTGCGGCGTCTTCGGTTTTTGCTTCTGATGTTTTTGGTGATTTGGCTTAACCTGTTGTTGATGCTGGTTATATTGTGGTT‑GTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATActgcggctg < 2:46715/147‑1 (MQ=9) ggggCGGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGAGATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATActgcggctgcgg < 7:323495/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGCGCAAGACGTTGTTGCGCCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGCCGCAATCTGCTGTTGTGCATGCTGATActgcggcagccc > 7:611306/1‑149 (MQ=21) tGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAATGCTGCTGAGGAGCAACCGGTTGTTGCTGCTGCTGATAATGTTCCT‑GAGGCGCATACATCTGGTGTGCGTGATGATAatgctgctgcaac > 3:1282408/1‑148 (MQ=14) ggCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTTGCTGTCGAGCAAACGGTTCTTGCGCCTGCTGAAAATGTGCCT‑GCGCCGCAAACAGCTGAGGTGCCTCATGATActccggctccaccg > 5:1332887/1‑145 (MQ=12) gCTGTGGTGGCTGCTGCTCCGGCTGCTGCGGCGCCCCCGGTTGTTGCGGCGGCTGCTAGTGCGGCTGTGGCGCAACCGGGTGTTGCGGCTGCTGATACTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGcggcgg < 5:579516/151‑1 (MQ=37) ttgtGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAAcg > 8:289693/1‑150 (MQ=255) gctgctcctgaggctgcGGCGTAAGCGGTTGTTGCTGCTGCTGATTTTCCGGCTGTGGCTGAACCGGTTGTTGCTGCTGCTGATATTGCGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGgttgt < 1:871507/137‑1 (MQ=25) 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aCTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGCGCACCCGGTTGGTGCGGCTGCTGAGCTTGTTGCT‑GCGGCGCAAGCGTCTGCGGTGGCTGCTGATCATCCGGCTCCCCCGGATGCGGTGGTGGCGgctg > 5:1018519/1‑151 (MQ=12) gcggctgcGGCGGATGCGGTTGTTGCTGCGTCTGATTTTGGGGCTGTGGCTCAACCGGTTGTTGCTGCTGGTGATATTGCGGTT‑GAGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGctgctg < 6:23841/148‑1 (MQ=18) gctgcGGCGCAACCGGTTGTTGCTGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGata < 8:536835/151‑1 (MQ=255) gctgcGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGat < 7:67057/150‑1 (MQ=255) tgcGGCGCACCCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGGGCAACCGCCTGTTGGGGCTGCTGCTACTGCGCCTGCGGGGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATAtt > 7:960510/1‑151 (MQ=21) gcggcgCATCCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAGTCCGGATGAGGCGCAACCTGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtg < 8:436924/151‑1 (MQ=21) gggcgtatgcGGTTTTTGCTGCTGAGGATTTTGGGGCTGTGGCTAAACCGGTTGTTGATGCTGCTGATATTGGGGAT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATAATGCTGCTGCGGCGTAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgg < 7:911409/142‑2 (MQ=12) gcggaggcGGGTGTTGCTGCTGCGGATATTGCGGATGTGGCGCAACCGGGTGATGCGGCTGCTGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgctg < 3:168802/144‑1 (MQ=18) gcAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGAGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTTCAT‑GCCTCGCAATCCGCTGCTGTTGCTGCTGATCCTGCTGCTGCCCCGGATGGGGTTGAGCCGGGTGATGATATtcctgcg > 1:493025/1‑150 (MQ=12) gatgcGGTTGTTGCTGCTGATGAAGTTGCTGCTGTGGCGCCTTCTGTTGTTGCTGCTGCTGATATTGTGGCT‑GAGGCGCAATCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGCAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgctgctg < 4:75630/147‑1 (MQ=18) cAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGAGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAATGTTGCT‑GCGACGCAAGCATCTGATGTGGGTGATGATAATGATGCTGCGGCGGATTGGGTTGATCCGGGTGCTGATATtgctgcgg > 5:947976/1‑149 (MQ=16) cgcgggTTGATGCGTCTGCTGCCTTTGGGGCTGAGGCGGCACCGGTTGATGCGGCTGCGGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgctgctg < 3:752953/146‑1 (MQ=18) aaCCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgctgctgc < 5:620992/151‑1 (MQ=255) ggTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGAGGCTGCTGATATTGTGGAT‑GCTGAGCAAACGGCTGATGTTGCTGCTGATACTGCGCCTGCAGCGGAACTCGTTGTTGAGGATGATGATAATGATGCTGCGGTg > 4:1349228/1‑151 (MQ=21) gaggtggccgctgatGATTTTCCTGCTGTGGCGGAAGCGGTTGATGCTGCTGCGGATATTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGc < 8:606989/142‑1 (MQ=21) gttgCTGCTGTTGATTTTGGTTCTTTGGGTTCACCGGTTGTTGATGCTGCGTTTTGTGGGGTT‑GCGGCGGAACCGGCTGTTGTGGCTGGTGATAGTGCGGGTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCaa < 4:327153/150‑1 (MQ=12) gtggccgctgctGATCTTGCTGCTGTGGCGTCACGGGTTGTTGCTGCTGCTGATATTGGGGAT‑GAGGCTCAACGGGCTGTTGTCGCTGCTGATACTGCGGCTGGGGCGCAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCaa < 4:1085840/144‑1 (MQ=18) tgCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGCCA‑GCGGCGCAAAAGGCAATTGTTGCTGATGAAAATGATCCTGAGGAGGAATTTGTTGATGAGGGTGCTTATATTGCTGCTACAGTGGAAACg > 5:70254/1‑151 (MQ=12) gcttctgctgAATATGCTGCTGTGGCGTATCGGGTTGTTGCTGCTGCTGATAATGGGGCT‑GTCGCGCAACGGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCgg < 1:445175/147‑1 (MQ=18) gctgctGTTTTTGCGGCTGTGGCGGAATCGGTTTTTGCTGCTGCTGATTTTGGGGTT‑TTGGCTGAACGGGCTGTTGTTGCTGCTGATAGTGCGGCTGCGGCGGAACTGGGTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGgttg < 6:1129410/151‑1 (MQ=18) gctgcattggaggctgCGGCGTCACCGGTTGATGCTGCTGCGGATCGTGGGGTT‑TGGGCGGAACGGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGGTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGgttgtt < 8:1305698/138‑1 (MQ=14) gatgATCTTCCTGCTGCGGCGGATTCGGTTGATGCTGCTGCTGTTATTGTCGAT‑GCGGCTCAACCGGCTGTTGTTGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGgttgtt < 6:662212/148‑1 (MQ=18) tattcgtgctgTGGCGGAATCGGTTGTTGCTTCTGCTGATTGTGTGGCT‑GAGGCTCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGgc < 8:975154/144‑1 (MQ=18) tttGCCGCTGTGGCTGCACCTGTTGTTGCGGCTGCGGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGgct < 7:1204054/149‑1 (MQ=18) ttGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGAGCACCGGGGTGTAGAGGCTGCTGGAACTGCGGAAGCGGCGGACCTGGTAGTTTCGGCTGCTGTGATTGCTGAAGCGGTGCTCCCGGTGGTTGCGgcggg > 5:1132969/1‑148 (MQ=16) ggggctgTGGCGCGCCCGGTGGCTGCGGCGGCGGGCCGTGGGGCT‑GAGGCGGCCCCGGCGGTTGCGGCTGCGGATCCTGCGGGTGCGGCGCAACTGGGTGTTGCGGCTGCTGATAGTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGctgctg < 1:743866/148‑1 (MQ=2) tctgTGGTGCCATCGGCTGTTGTGGCTGGTTATTGTGTGGAT‑GCGGCGGAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGGGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTa < 2:1087835/149‑1 (MQ=17) gctgTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCATCCGGTTGTTGCGGCTGCTGTAc > 6:437889/1‑151 (MQ=255) gctgCGGCGGCACCGGGTGTTGCGGCTGCTGATCGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGATGTGGCTGCGGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGGTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTAc < 7:940999/151‑1 (MQ=18) ctgTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGAGCAACAGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAAGTGGTTGTTGAGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGAAc > 3:394688/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTAGTTGCGGCTGCTGTAc > 8:191183/1‑149 (MQ=255) tgGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGGTGGGGATACTGCTGCTGCGGCGGAAGCGGTTGTTGCGCGTGCTGATATTGCTGCTGCAGTGCATCCGGTTGTTGCGGGTGCTGTACATGt > 7:1294106/1‑151 (MQ=21) | CGTCGGTTTATGCAACGGACGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGT > DH1/2945385‑2945685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |