| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 2,945,554 | 0 | G | T | 21.5% | 450.2 / 17.1 | 220 | P781Q (CCG→CAG) | ftsK | cell division protein FtsK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (81/87); new base T (6/40); total (88/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.27e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAA > DH1/2945404‑2945701 | cggCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGGGCCGAACCCGGGTGTTCCg > 3:1144677/1‑151 (MQ=25) ggCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCgg < 7:929896/151‑1 (MQ=255) gCTGTCGCCATTACGCATCAACAGTGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGgc < 1:53515/151‑1 (MQ=255) tGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAGTGCTGCTGAGGCGCACCCGGTTGTTGCGgctc > 1:1087373/1‑150 (MQ=255) gTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGgct < 6:131060/149‑1 (MQ=255) gTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGGGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGgct < 2:989039/149‑1 (MQ=255) tCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGAGCAACCGGTTGTTGCGgctgct > 7:1252798/1‑151 (MQ=255) cGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGgctgct < 4:1287167/150‑1 (MQ=255) cGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGctgctg < 5:666558/151‑1 (MQ=255) gCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGa < 8:1063136/151‑1 (MQ=255) cATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGATGTGGAGCAACAGGTTGTTGCGGCTGCTGaa > 1:127854/1‑149 (MQ=255) aTTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGAGCAACCGGTTCTTGCGGCTGCTGATAATGCTGCAGAGGCGCCCCAGGTTCTTGCGCCTGCTGaca > 2:1079250/1‑148 (MQ=25) tACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGGGGATATTGCTGCTGTGGGGCAACCCGTAGGTGCggagcgtgtcatat > 1:1098801/1‑139 (MQ=21) cGCATCAACAGGGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgtg < 3:543227/151‑1 (MQ=255) cGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATtgtg < 4:547222/151‑1 (MQ=255) aTCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGAGCAACAGGTTGTTGAGgctcatctaaatgttcat > 3:314780/1‑136 (MQ=21) cAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑g < 8:255270/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑gcg < 3:999724/151‑1 (MQ=255) cGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCa < 7:872786/151‑1 (MQ=255) cGGAGGAAGCAGGGCACCCTGCGGTTGTGCCGCAACTGGCTGTTGCGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCa < 6:175588/151‑1 (MQ=255) ggATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCaa < 6:328755/151‑1 (MQ=255) tGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGATGCTGTGGGGCAACCGGTTGTTCCGGCAGTATAGATAGTGGCTGGCGgcgcccgg > 3:271165/1‑147 (MQ=18) gAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCg < 5:1088690/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGGGTATCCTGCGGGTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCg < 5:600435/150‑1 (MQ=255) gcggaggcacttccGGATGAGGCGCAAACGGTTGATGCGGCTGCGGATCGTGGGGCTGCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCT‑GCGGTGCAACCGGTtg < 1:748943/138‑1 (MQ=18) cAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCtgt < 4:621974/151‑1 (MQ=255) aGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACAGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCACCCGGCtgat > 2:1150834/1‑149 (MQ=255) gTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTtgtg > 8:80603/1‑151 (MQ=255) aTCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAATGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGAAAATGTGCCT‑GCGGCGCATGCGTGTGTtgtgcg > 5:753102/1‑149 (MQ=18) ccTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGgctg < 1:1012696/151‑1 (MQ=255) ccTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGATGAGGAGCAACAGGATCTTGAGGCTGCTGATCATCTTCCT‑GCCGCGCAATCTGCtgttgt > 5:269101/1‑146 (MQ=17) ccTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGGGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGgct < 4:788113/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGTGGCGCATCTGGCTGTGGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCGGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGctgctg < 5:886833/151‑1 (MQ=255) ggTTGTGGCGCATGGGGCTGTTGCTGCTTATGATACTGCTGCTGCGGCGGAAGCGGTTGTTGCGGCTGCTGATTTTGCTGATTTGGCTCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGAt < 6:1183034/151‑1 (MQ=21) ggTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTCGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCATCCGGCTGTGGTGGCTGCTGAt > 6:1088675/1‑151 (MQ=255) gttgcggacggggCTGTGGTGGCTTCTGATCCTGCGGCTGCGGCGGACGCGGTTGTTGCGGCGGCTGATATTGGGGCTGTGGCGCAACCGGCTGTTGCTGCTGCTGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATAct < 3:473998/139‑1 (MQ=255) gtgGCGCTTCTGTTTTTTGTTGCTTATGATTATTCTGCTGCGGCGTATTCGGTTTTTGCTTCTGATGATTTTGGTGATGTGGCTCAACCTGTTGTTGAGGCTGCTTATATTGTGGGT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATAct < 4:974768/150‑1 (MQ=255) ggggCGCACGTGGCTGGTGGGGCTGCTGATCCTGCTGCTGCGGCGCACGCGGTTGATGCTGCTGCGGAGATTGCGGCTGTGGCGGAACCGGGTGTTGCGGCTGCGGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATActg < 7:1180117/149‑1 (MQ=255) 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tGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAATGCTGCTGAGGAGCAACCGGTTGTTGCTGCTGCTGATAATGTTCCT‑GAGGCGCATACATCTGGTGTGCGTGATGATAatgctgctgcaac > 3:1282408/1‑148 (MQ=14) ggCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTTGCTGTCGAGCAAACGGTTCTTGCGCCTGCTGAAAATGTGCCT‑GCGCCGCAAACAGCTGAGGTGCCTCATGATActccggctccaccg > 5:1332887/1‑145 (MQ=12) gCTGTGGTGGCTGCTGCTCCGGCTGCTGCGGCGCCCCCGGTTGTTGCGGCGGCTGCTAGTGCGGCTGTGGCGCAACCGGGTGTTGCGGCTGCTGATACTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGcggcgg < 5:579516/151‑1 (MQ=37) cTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTCGGGCAACCGGTTGTTGCGGGTGCTGAAAATGTTCCT‑GCGGCGCAAGCAGCTGCTGTTCGTGCTGATCCTCCGGCTCccgcgg > 3:859634/1‑150 (MQ=17) gtgGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGAGGCGCAACCGGATGTTGCGCCTGCTGAGAATGTTCCT‑GACGCGCAATCTGATGCTGAGGCTGCTGATCCTGCGCCAGCGGCGGaccacg > 7:489625/1‑146 (MQ=17) 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gctgATATTGCGGCTGCGGCGGAACCGGTTGATGCTGCTGCTGATAGTGGGGAT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGgttgtt < 1:370155/150‑1 (MQ=21) tattcgtgctgTGGCGGAATCGGTTGTTGCTTCTGCTGATTGTGTGGCT‑GAGGCTCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGgc < 8:975154/144‑1 (MQ=18) tatTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGCCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCAGCGGCGCAACAGTTTGTTGCGGCTGCTGATAATCCTGCTGCGGAGCAAACGGTTGTAGCgtat > 2:702034/1‑148 (MQ=18) tttGCCGCTGTGGCTGCACCTGTTGTTGCGGCTGCGGATAGTGGGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGgct < 7:1204054/149‑1 (MQ=18) ttGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GAGGAGCAAGCGGCTGTTGTGGCTGCTGAGACTGCGGCTGCGGCGGAAGGGGTTGTTGCGGCTGATGAGATTGCTGCTGCGCTGCAGGCCGTTGTTGCGgctgc > 3:1305025/1‑151 (MQ=18) tgctgcTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGTAGCAGGCGGCTGGTGTGGCTGGTGATACTGCGGCTGCGGCGGAAGTGGTTGTTGAGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAAGCGGTTGTTGCGggtgct > 3:1049813/1‑151 (MQ=21) ctgctgTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTCCTGCTGCGGCGCAAATGGTTGTTGCTGCTGCTGATATTCCTGCTGCCGTGCAAACGGTTCTTGCGGATGCTGt > 4:144544/1‑151 (MQ=18) gctgtcgctgcatctgttgttGCTGCTGAGGATTTTGGGGTT‑TTGGCGCAACGGGCGGTTGATGCTGGGGATACTGCGGTTGAGGCGGAACTGGGTGTTGTGGCTGCTGATAGTGCTGCTGCGGGGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTa < 8:216279/135‑1 (MQ=2) gctgTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCATCCGGTTGTTGCGGCTGCTGTAc > 6:437889/1‑151 (MQ=255) gctgTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGATGCTGCAACGGAACAAGTTGTTGAGGCTGATGATATTGCTGCTGCGGTGCAAACTGTTGTTGAGGCTGCTGTAc > 2:281713/1‑151 (MQ=18) gctgTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGAT‑GAGGAGCAACCGGCTCATGTGCCTGATGATAATGCGGCTGCCGCGCAACGAGTTGTTGAGGATCATGATATTCATGCTCAGGAGCAACCGCTTGATCAGGATGCTGAAc > 4:391353/1‑151 (MQ=12) tgtgGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAAACGGTTGTTGCGGCTGATGTAc > 8:1313605/1‑149 (MQ=255) tgtgGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTAGTTGCGGCTGCTGTAc > 8:191183/1‑149 (MQ=255) ttggctgaaCCGGTTGATGAGGCTGGTGATATTGTGGAT‑GTGGCGCAACGTGCTGTTGTGGCTGGTGATACTGCGGGTGCGGCGCAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAg < 6:977896/143‑1 (MQ=17) ttcgcgcAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAGTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAg < 3:203276/147‑1 (MQ=255) tgGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGGTGGGGATACTGCTGCTGCGGCGGAAGCGGTTGTTGCGCGTGCTGATATTGCTGCTGCAGTGCATCCGGTTGTTGCGGGTGCTGTACATGt > 7:1294106/1‑151 (MQ=21) tgGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGt > 7:307360/1‑151 (MQ=255) gcccctgctgatgCCGCTGCGGATCGTGGGGAT‑GTGGCGCAACGGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTcaac < 4:1142211/140‑1 (MQ=17) cagctgttgttGCCGCTGCTGATATTGGGGCT‑GAGGCGGAACGGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTcaac < 2:405632/145‑1 (MQ=21) aCCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGAGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGAGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGAGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAAGCGGTTGTTCCGGCTGCTGTACAGGTTcaaca > 7:582403/1‑150 (MQ=255) cGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATCATGAGCCTGCGGCGGAGCTGGTTGTTGAGCCTGTTGATAATCCTGCTGCGGGGCAACCGGTTGTTGCCGCTGATGATCAGGATCAACTAtt > 5:962965/1‑151 (MQ=18) gttgttGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGATGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAAGCGGTTGTTGCGGGTGCTGTCCAGGTTcacctagtgg > 5:307295/1‑143 (MQ=21) gctgatgctgcTGTTGATAGTGGGGCT‑TTGGCGTAACCTGCTGTTGTTGCTGCTGATACTGCGGGTGCGGCGGAACTGGTTGTTGAGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTg < 6:47430/145‑1 (MQ=18) gtgttgtGGCTGCTGATAGTGGTGCT‑GAGGCTTAACCTGCTGTTGTGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGc < 8:1252136/150‑1 (MQ=17) gttgCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAAGTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTCCTGCAGTGCAAACGGTTGTTGAGGCTGATGTACAGGATCAACAATTGGAGt > 6:1127482/1‑151 (MQ=25) tgctgctgcTGATAGTGCGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCAGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTa < 7:244558/150‑1 (MQ=255) gCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTaa > 8:1129727/1‑150 (MQ=255) | CGGCTGTCGCCATTACGCATCAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGTGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCT‑GCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAA > DH1/2945404‑2945701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |