| Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
CACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936148‑936443 | cACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTAATGC‑TATAC‑TTCATCAAAatttt > 3:330506/1‑149 (MQ=255) atcaAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGCGGAGGGG‑GTGAA‑TACATCTCAATTTAATTGTTTGCGGGGGCATGATTAGACCctacg > 7:1939235/1‑151 (MQ=11) tttGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGTACTGC‑GTTAC‑TTCATCGAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTCCCCCTACGACCttg > 7:1153432/1‑150 (MQ=14) ttGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGtt < 3:1435032/116‑1 (MQ=255) cGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCAACAAAATTTAATTGGtt > 8:531136/1‑109 (MQ=255) ggATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCGCGGTAGTGC‑ATCTC‑TTCAACAAAATTTAATTGGTTGCGGCTGGGTGTTTTGCACAGACCACATTAGGGTTAttatacagaca > 8:1114092/1‑138 (MQ=2) tGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGCCGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTAca > 7:801166/1‑149 (MQ=255) gAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAAttt > 7:1990192/1‑86 (MQ=35) cTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTCAGGGGGAAGTTTATGACCAGACGACCTTGGGCTTATTAGGCAGAACAGCTaaagccttatccacac > 7:354976/1‑136 (MQ=9) cccgtagaGCTCCGAGGCTCCTGCACCCCCCGTCACAGTACTGC‑TGGCT‑TTGGTGGTTTATTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGAt < 7:1497103/145‑1 (MQ=11) gacgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTAGTCG‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTTTTTGGTTGCGGGGGCGGGATTTGAACCGCCGACATTCGGGTTATGAGACCGCCGAGCTACCAGCCTCCTCCACACCGCTTCAGTGGATgcg > 7:1437658/1‑151 (MQ=14) cgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATgcgcc > 7:812995/1‑150 (MQ=255) ctgctCCACCCCGCGTCACCGTAGTGC‑TTTAC‑TTCATCTAATTTTATTTGGTTGCGGGGGGCGGATTTGCACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCGCCCGCGTCCGTGGATGCGCAGTATACTCCGcg > 4:1308673/1‑150 (MQ=17) tCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 5:6420/1‑151 (MQ=255) ccACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGt > 2:1268793/1‑151 (MQ=255) 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atcaAATTTTAATTTGTTGCGGGCGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTACGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCTATc > 7:718779/1‑150 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 4:1415683/1‑151 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 6:1500395/1‑151 (MQ=255) ataaaTTTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc < 5:1307112/149‑1 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGTACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 1:825435/1‑151 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 7:1281742/1‑151 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 5:1666989/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 7:1166011/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 7:424105/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 7:527046/1‑150 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAt > 7:1057169/1‑151 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAt > 1:1694418/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 5:90630/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 6:2024798/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 1:1325352/1‑151 (MQ=255) | CACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTAC‑TTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936148‑936443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |