| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 156 (0.340) | 76 (0.190) | 29/260 | 39.2 | 23.8% | intergenic (+558/+3) | narI/tpr | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/protamine‑like protein |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 351 (0.870) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > NC_000913/1286934‑1287234 | ggatcttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCAAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 6:334966/146‑1 (MQ=11) cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGGGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgt > 5:473633/1‑148 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTagaaccatc > 4:985642/1‑143 (MQ=255) 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aTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGt < 4:174918/151‑1 (MQ=35) ggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGtt < 7:217107/150‑1 (MQ=35) ggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTg < 1:234920/151‑1 (MQ=37) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTggg > 4:310197/1‑151 (MQ=38) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTATCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGCAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCCTGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGAGTGGTTggg > 7:1765699/1‑151 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCGCTCTCGGTGGGGGGCGCGTGGAACCTTGGTGGGAGCTTGTCCTCCGT‑GCCCGCCTGGGGGGCATT‑TTT‑TATTGGGGGTTGGTTggg > 3:1807921/1‑151 (MQ=2) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTTCGGCAACCCTCTATCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCATATCATGCTT‑ACCCGCAAGGGCACCATA‑TTTGAATTgggcgtgggttggga > 8:1314380/1‑136 (MQ=11) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCAACCTT‑CCCCACATCGGAAGAAAA‑TAT‑AATTTCGGAATAGTTTGGa > 4:517357/1‑149 (MQ=11) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATg < 2:1586127/118‑1 (MQ=35) gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGt < 3:446119/151‑1 (MQ=40) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGtt < 1:1023172/151‑1 (MQ=255) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc < 5:1534611/151‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCTCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGGTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 5:1373791/151‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc < 3:1851967/148‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc > 6:1855966/1‑148 (MQ=16) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGGTTCTCAGCCTT‑CCCCGCCTGGGGAGCAGA‑TTT‑AATTGGGGCTTCGGTGGGCGGTGCAggg > 7:27276/1‑151 (MQ=11) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg > 8:134090/1‑150 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCTCGAATAGAACCATAGTCGAAGCTTATAAAACAT‑AACCGCATGGTCAGAATA‑TAT‑AATTTGGGAATAGGTGGGGATTTAAgggg > 6:1566842/1‑149 (MQ=2) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACt > 3:1838646/1‑151 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtt > 6:1408443/1‑151 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTAAGGGACtt > 6:1379342/1‑151 (MQ=255) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGGCGCGCGAGTCGCACCGTTGTAGAAACTTATAATACAT‑ACCCCCATGGGCCGAATA‑TTT‑TATTTCGGATTAGTTGGGTATGTCAggggcgtt > 6:808070/1‑146 (MQ=2) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtgt > 1:1307148/1‑149 (MQ=255) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCGTGTGGTCCTT‑CCCCGCTGGGGCAGCATA‑TTT‑AAGGGCGGATTCGGTGGTGAGGTCTGGGGCttt > 7:146301/1‑151 (MQ=11) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCCCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTCGAAGCATCTCATCCTT‑CCCCCCAAGGGCAGAATA‑ATT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAAGGACttt > 6:1273046/1‑151 (MQ=17) | GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTT‑CCCCGCATGGGCAGAATA‑TTT‑AATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > NC_000913/1286934‑1287234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |