Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 470,675 C→T G272G (GGC→GGT mdlB → fused predicted multidrug transporter subunits and ATP binding components of ABC superfamily

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb470,6750CT99.1% 318.4 / NA 116G272G (GGC→GGTmdlBfused predicted multidrug transporter subunits and ATP binding components of ABC superfamily
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base T (115/0);  minor base A (1/0);  total (116/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

TCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGCTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGC  >  W3110S.gb/470644‑470705
                               |                              
tcattcatTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1065832/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTtct                            >  1:1197833/1‑36 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCTCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:866260/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGc                    >  1:297726/1‑44 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTggg   >  1:1037423/1‑61 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTggg   >  1:636846/1‑61 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTggg   >  1:1068669/1‑61 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTggg   >  1:754574/1‑61 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTggg   >  1:1258110/1‑61 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:596142/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:553198/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:559306/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:574916/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:5839/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:530483/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:598558/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:631842/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:660101/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:551986/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:551757/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:750594/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:528684/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:521541/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:506390/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:471974/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:447709/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:427160/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:423535/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:397894/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:395482/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:851723/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:980861/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:976301/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:955297/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:954540/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:94379/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:934292/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:932645/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:93185/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:91899/1‑62 (MQ=255)
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tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:875380/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:706158/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:847018/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:834863/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:830164/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:826463/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:79498/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:790153/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:327579/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:735651/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:735498/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:719781/1‑62 (MQ=255)
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tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1363409/1‑62 (MQ=255)
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tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1288044/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1281465/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1261551/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1247607/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1230204/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:121597/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1215033/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1374900/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1205328/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1202138/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:118709/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1145417/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1134803/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1099688/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1087754/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1083499/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1074067/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1040881/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1037167/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:163888/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:33045/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1001658/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:321057/1‑62 (MQ=255)
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tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:304772/1‑62 (MQ=255)
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tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:228356/1‑62 (MQ=255)
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tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:185890/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:374675/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:155746/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:149497/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1472576/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1441288/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1433330/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1418217/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1398070/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1378484/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:1378047/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGTTTCTCCGCCAGCGGCACCATAGAAGTGGGc  >  1:279049/1‑62 (MQ=255)
tCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTATGGATTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGc  >  1:65116/1‑62 (MQ=255)
                               |                              
TCATTCTTTGTGGCTTGTTGATGCTGTTTGGCTTCTCCGCCAGCGGCACCATTGAAGTGGGC  >  W3110S.gb/470644‑470705

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: