| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,596,812 | 0 | C | A | 9.3% | 534.1 / 3.9 | 167 | H275N (CAT→AAT) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (106/39); new base A (2/20); total (108/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-08 | |||||||||||
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Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCAC‑GGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCGCAACGCCACGCCGGAAGATTTTGCTAAAGTCGGTCGACTGATGGCGGAAGGAAAAATCACTGCTGACATGATGTTAACCCATCGCTATCCGTTCGCCACGCTGGCAGAAACCTA > NC_000913/4596664‑4596957 | gTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGGAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCAC‑GGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCa < 1:2872866/150‑1 (MQ=255)gTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCAC‑GGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCa < 2:2790608/150‑1 (MQ=255) tttGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCAC‑GGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCAt < 1:3217980/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |