| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,066,310 | A→T | 5.2% | H288Q (CAT→CAA) | ygfI ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,066,310 | 0 | A | T | 5.2% | 308.3 / 4.1 | 106 | H288Q (CAT→CAA) | ygfI | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/54); new base T (2/4); total (48/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.24e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCGTCAGAA > NC_000913/3066162‑3066455 | aTCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAata > 2:463018/1‑149 (MQ=255) cGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGAATTACACCGTAATTTAATTGCATCCTGCTCGATGATGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACTAT‑ATTCATCAATATg > 1:1104015/1‑149 (MQ=255) agggATTATCTGAATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATg < 1:638293/148‑1 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGc > 2:1284125/1‑149 (MQ=255) ggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCt < 1:334821/149‑1 (MQ=255) ggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCt < 2:1201309/149‑1 (MQ=255) gATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTg < 1:953121/149‑1 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGaa > 1:822839/1‑149 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCGGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGaa < 1:561345/149‑1 (MQ=255) aTCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTAAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCATATTGCTGAAga < 2:390771/149‑2 (MQ=255) cTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGGTAATGACTCGTCCCGGCACGAT‑CTTCAGCATATTGCTGAAgatc < 1:299652/149‑4 (MQ=255) tGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATc > 1:1218267/1‑149 (MQ=255) tGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATc < 1:1322172/149‑1 (MQ=255) tGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGAAATTTAATAGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATc < 1:1281226/149‑1 (MQ=255) aTCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCCCCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCggg > 2:1218716/1‑147 (MQ=255) aTCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTg < 2:567418/149‑1 (MQ=255) tCGCTATCTTGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:1162684/149‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTATCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGATGCATCGGGGCGGtatt > 2:1372595/1‑148 (MQ=255) cTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata > 1:860065/1‑149 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGTCGCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGCCACGATGCTTCAGCATATTGCTGAAG‑ATCGTGACgggacga < 2:541075/149‑6 (MQ=25) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATc < 1:376288/137‑1 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATc > 2:376288/1‑137 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATaa > 2:755895/1‑149 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATaa > 2:21187/1‑149 (MQ=255) ggAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTTAAGCATCGTGGCGGTATAAc > 2:1020408/1‑149 (MQ=255) ggAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAAc > 1:1499303/1‑149 (MQ=255) aaaaTGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga < 1:102394/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACgatgat < 1:645010/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGAtt < 1:659604/149‑1 (MQ=255) gcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGCT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCAGCGTGGCGGTATAACGAAGATTTc > 2:716314/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGGCACGAT‑CTTCAGCAATAAGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGAttacag > 2:1170439/1‑145 (MQ=255) gACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCCGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAG‑CTTCAGCAATATTCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACTATGATTTCTGATTGaa < 1:1405740/149‑1 (MQ=255) atatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaa < 2:489962/149‑1 (MQ=255) atatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaa < 2:860065/149‑1 (MQ=255) tatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaaa < 1:1183518/149‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 2:1433640/149‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 2:916301/149‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg > 2:363830/1‑149 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg > 1:791758/1‑149 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGAAACCGGCTCGATGCTTGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 2:1090873/149‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTAAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCCTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCAGAAGCATCGTGGCGGTATAACGAGGATATCTGATAGAATaaat > 1:396800/1‑148 (MQ=255) ttCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa > 1:473906/1‑149 (MQ=255) ccacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt > 2:376507/1‑149 (MQ=255) cacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTAACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCCTCCCGTCACTAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc > 2:1189885/1‑149 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGTCTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt < 2:79051/149‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt < 1:1020408/149‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCAGCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt > 2:692271/1‑149 (MQ=255) gATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTg < 2:209188/149‑1 (MQ=255) aTCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGc > 2:258292/1‑149 (MQ=255) tCTTAGCGACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTTATTGCAACCGGGGCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa < 1:691575/149‑1 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATAc < 2:291840/149‑1 (MQ=255) ccACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACa > 1:201839/1‑149 (MQ=255) cGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCACGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCg < 2:1087500/149‑1 (MQ=255) tCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGc < 2:369587/149‑1 (MQ=255) ttACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCgg < 2:387412/149‑1 (MQ=255) ttACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCCTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCAGCATATACAACGCACTGTGCgg > 2:549037/1‑149 (MQ=255) tACACCGTAATTTAATTGAACCCGGCTCGATGCTGGGTTAATTCCTCGTCCCGACACGAT‑CTTCAGCACTATCCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGt < 2:860364/149‑1 (MQ=255) acacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTg < 1:463018/149‑1 (MQ=255) acacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGGTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTg < 1:988803/149‑1 (MQ=255) cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTTTGTAAATGACTCGTAACCACACGAT‑CTACACCAATAACATGAAACATCGAGCCGATATAACGATCAATACTGATTTAAAAAACATATTCCTGCATATACATCCGCCTGAGCgcagc > 2:508032/1‑145 (MQ=255) cGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATc > 1:104128/1‑149 (MQ=255) cGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATc > 1:541910/1‑149 (MQ=255) cGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATc > 1:1230617/1‑149 (MQ=255) gTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCa < 1:559521/149‑1 (MQ=255) gTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCGCGTCACGAT‑GTTCAGCAATATGATGAAGCAGCGTGGCTGTATAACGATGATTTCTGATTTAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCa < 1:1139437/149‑1 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCaa > 1:601122/1‑149 (MQ=255) ttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAatt > 2:208625/1‑148 (MQ=255) ttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAata > 2:73216/1‑149 (MQ=255) cAACAGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTAGTCCCGTCACGAT‑CTTCTGCAATATGATGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGTTATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCCGc < 2:1567485/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGtt < 1:750910/149‑1 (MQ=255) gCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGcc < 2:1499303/149‑1 (MQ=255) cGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGa < 2:1231827/149‑1 (MQ=255) gATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGGTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGAt < 2:450115/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGAtt < 1:73216/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTCATTGAATAAAGATATTCCTGCTAATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGAtt > 2:961462/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCAc < 1:124623/149‑1 (MQ=255) ggggTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCAcc < 1:1170881/148‑1 (MQ=255) gggTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATTTGCTTAAGCATCGTGGCGGTATAAGGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGGGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCa < 2:726427/149‑1 (MQ=255) ggTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCCTCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAg > 2:1104938/1‑149 (MQ=255) ggTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAg > 1:702085/1‑149 (MQ=255) gTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGt > 1:1357283/1‑149 (MQ=255) tAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATTTTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCg > 1:1056421/1‑149 (MQ=255) aTGACTCGTCCCGTCACGCT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATCTACATCGGCCTGTGCGGTGCCTCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGCTTCACCAGTCGcc > 2:321336/1‑149 (MQ=255) tGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCa > 2:910131/1‑149 (MQ=255) gACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAg < 2:1374603/149‑1 (MQ=255) gTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCaaa > 1:1022103/1‑149 (MQ=255) ccGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCAGCGTGGCGGTATTACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGTTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATg > 1:348890/1‑149 (MQ=255) gccACGATGCTTCAGCATATTGCTGAAG‑ATCGTGACGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCg > 2:1299620/3‑149 (MQ=38) gTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCg < 2:1357283/149‑1 (MQ=255) tCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCgg < 2:822839/149‑1 (MQ=255) cACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCggg < 1:547773/149‑1 (MQ=255) aCGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGa > 2:48236/1‑149 (MQ=255) gAT‑CTTCATCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGACGGATTCACCATTCGCCAGGCAAAATGCGTGAta > 2:855194/1‑148 (MQ=255) gAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATTTACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCTGGATc > 1:1023844/1‑149 (MQ=255) ttCAGCATATTGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCg > 2:1048349/1‑149 (MQ=255) tCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCGt < 1:516669/149‑1 (MQ=255) cAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCGTc < 2:702085/149‑1 (MQ=255) aGCAATATGCTGAAGCATCGAGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATTTTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACGGTCa > 1:272445/1‑149 (MQ=255) gCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCGTCAg > 1:578675/1‑149 (MQ=255) aaTATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCGTCAGaa < 1:1557432/149‑1 (MQ=255) | ATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGAT‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGGATCACCGTCAGAA > NC_000913/3066162‑3066455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |