| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,470,436 | C→A | 11.9% | Q436K (CAA→AAA) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,470,436 | 0 | C | A | 11.9% | 379.8 / 12.3 | 129 | Q436K (CAA→AAA) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/80); new base A (14/5); total (44/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.66e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGT > NC_000913/2470288‑2470585 | tctTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCa < 2:876659/150‑1 (MQ=255) gAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACGTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATa < 2:974356/150‑1 (MQ=255) gAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATa < 1:2343549/150‑1 (MQ=255) gAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATa < 2:568670/150‑1 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAg < 2:1827630/150‑1 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAg < 2:1827632/150‑1 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAg < 2:2042914/150‑1 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAg < 2:615948/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGa < 1:2689263/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGa < 1:2495246/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGa < 1:1150894/150‑1 (MQ=255) atCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGa < 2:1289055/150‑1 (MQ=255) tctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGAt < 2:683766/150‑1 (MQ=255) tctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAATACAATAT‑Cgct > 1:2142197/1‑148 (MQ=255) tctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAATAAAAAAAGACAAAAG‑CGAt > 1:2470973/1‑150 (MQ=255) tcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAAATTATAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAACAAAAG‑ccaagt > 2:2340037/1‑145 (MQ=255) aaTTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTaa < 1:1925816/150‑1 (MQ=255) ttATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAAGAAAAAAT‑CGAAGTAAAACa > 1:2620942/1‑150 (MQ=255) tATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCAc < 2:1569581/150‑1 (MQ=255) tgtCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAg < 1:1560490/150‑1 (MQ=255) tgtCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAATTCAAAGAAATCAAGACAAAAG‑CGATGTAAAGCACTAAg > 2:1467923/1‑150 (MQ=255) tgtCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAAATTATAAAAAAAATCAAAGCAAACAACACAAAAG‑CGATGTAAAGCACGAAg > 2:719964/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGtt < 1:428990/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGtt < 1:428985/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGtt < 1:429056/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGtt < 1:2672429/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGtt < 1:2436689/150‑1 (MQ=255) tttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGAAAAAAG‑CGATGTAAATCACTAAGTTTaa > 2:1382147/1‑150 (MQ=255) tttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACATTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAAATTATAAAATAATACAAAGAAAAAAACACAAAAG‑CGAGGTAAAGCACAAAGTTTaa > 2:1173737/1‑150 (MQ=255) ttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTaaa < 1:1859374/150‑1 (MQ=255) ttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTaaa < 2:2042314/150‑1 (MQ=255) ttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTaaa < 1:1199075/150‑1 (MQ=255) tCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTg < 2:11966/150‑1 (MQ=255) tCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTg < 2:2079887/150‑1 (MQ=255) ggggAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTgcg < 2:392112/150‑1 (MQ=255) ggggAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAAACAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTgcg < 2:159780/150‑1 (MQ=255) ggggAAGGATATAGAGATTGAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTgcg < 2:1948295/150‑1 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgcg < 2:125987/150‑1 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTAATTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgcg < 1:687429/150‑1 (MQ=255) aTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgcgcg > 2:2283436/1‑150 (MQ=255) aTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAATAAAAAAAAAAAAAAG‑CGATGTAAATCACAAAGTTTAAATTTCGCGCCAAAAATTgcgcg > 2:1286770/1‑150 (MQ=255) tttAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgcgcgc > 2:2621339/1‑150 (MQ=255) aagcaagcATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAAATAAAATAAATAAATAAAAAAT‑AGATTTAAATCAAAAAGTTTAAATTTCGCGCCAAACAGGGGGCGcacc > 1:1417953/1‑149 (MQ=255) caagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAT‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTTCGCGCCAATAATGGCGCGCACCAGc > 2:1507381/1‑150 (MQ=255) caagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAAAAAAGAAAAAAT‑CGATGTAAATCACAAATTTTAAATTTATCGCCACTCAAGGCGCGCACaaac > 1:2024111/1‑148 (MQ=255) caagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAATTAAAATAAATAAAGAAAAAAG‑CGATTTAAATAACTAAATTTAAATTTAGCGCCAAAAAAGGCGCGCACAAGc > 2:522613/1‑150 (MQ=255) caagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAAGAAATCAAAAAAATAGACGTTG‑AAAGCCAGAAGTTTAAATTTCGCGGCCATAATGGGGCGCACAAGc > 1:1391803/1‑150 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAAAAG‑CGATGTAAATCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAAGGCGCGCACAATCtaaa > 2:1458212/1‑148 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAAATAAAATAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCAATAAGTTTAAATTTCGCGCCAATAATTGCGCGCACAAGCtata > 2:926596/1‑150 (MQ=255) tttGTATTGTATTTTTCTTTCGACCTTTGATTATACATAACATTCGTTTTTTTATTTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGAAAATCG‑CGATGTAAAGCAATAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAGGGCGCGCACAAGCTATAATACCa < 1:2041376/150‑1 (MQ=255) tttGGAATTTTTTTTTATTTCTAACTTTGCTTATACATAAATGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATAAAGACAATTG‑CGATTAAAAGCACTATGTTTAATTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCa < 1:2041190/150‑1 (MQ=255) tttttttttGTTTCGAACTTTGTTTATAAATAACTGTTTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAATAAATAAAGACATTCG‑CTATGTAAAGCACTATTTTTAAATTGCGCGCAACTCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:792797/146‑1 (MQ=255) tttttttttCGTTCGACGTTTGCTTATACATAACTGTGGTTTTTTTATTTTATAAAATATTTCAAAGAAATCAAGACATTAG‑CGATGTAACGCACTATGTTTAATTTGCGCGCCAATCTGGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:1086569/146‑1 (MQ=255) tttttttttCGTTCGACATTTGATTATACATAACTTTTTTTTTTTTATTTTATAAAATAATTCAAATAAATAAATACATTAG‑CTATTTAAAGCAATAATTTTAAATTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:884422/146‑1 (MQ=255) tttATTTTTCTTTCTAACTTTTCTTATAAATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATTTAAAGCACTAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:1803199/148‑1 (MQ=255) tGTATTTTTCGTTCTACATTTTCTTATACATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:1071024/150‑1 (MQ=255) tGTATTTTTCGTTCTACATTTGCTTATACATAACAGTATTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATTTAAAGCACTAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:1803053/150‑1 (MQ=255) tGTATTTTTCGTTCGACCTTTGATTATAAATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGAAAATAG‑CTATGTAAATCACTATGTTTAAATTGCGCGCCATTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAt < 1:78294/150‑1 (MQ=255) ttATTTTTCGTTCTACATTTGCTTATAAATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGAAAATAG‑CTTTTTAAAGCACTAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAtt < 1:1259764/149‑1 (MQ=255) aTTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtc < 2:478554/150‑1 (MQ=255) aTTTTTCATTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtc < 2:390136/150‑1 (MQ=255) tttttCTTTCGACCTTTGATTATACATAACTGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAG‑CTATTTAAAGCACTAATTTTAAATTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtct < 1:534928/150‑1 (MQ=255) ttttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtctc < 2:800610/150‑1 (MQ=255) ttttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtctc < 2:1509730/150‑1 (MQ=255) ttttCGTCCTACTTTTTCTTATACAAAACAGTCTTTTTTTAAATTTATAAAATAATAAAATGAAATCAAGAAATTAG‑CTATTTAAAGCACTACTTTTAATTTGCGCGCCAATATGGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtctc < 1:1218536/150‑1 (MQ=255) tttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAAACAAGACAATAG‑CGAAGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcc > 2:2014371/1‑150 (MQ=255) tttGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGt < 1:827912/150‑1 (MQ=255) cTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACt < 2:2629096/150‑1 (MQ=255) taCATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTatat < 1:903776/150‑1 (MQ=255) tAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGTAATAAAGACAATAT‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTTCGCGCCTATCATGGCGCGCACAAGCGATAATTCCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTTGGGTGACTATATGTcc > 2:1796011/1‑150 (MQ=255) aaCAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCt < 2:2072498/150‑1 (MQ=255) aaCAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCt < 2:1107573/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGa < 2:2142197/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGa < 2:2470973/150‑1 (MQ=255) tttttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAAt > 1:1893131/1‑150 (MQ=255) tttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg > 2:1987993/1‑150 (MQ=255) tttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg > 2:1475428/1‑150 (MQ=255) tttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACAATATCTCCTGATAGAATTGCg > 1:2544947/1‑150 (MQ=255) tataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGa > 2:1907632/1‑150 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:1294769/1‑150 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:27784/1‑150 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:2106914/1‑150 (MQ=255) taAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACt > 1:2032941/1‑150 (MQ=255) taAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGAACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACt > 2:723261/1‑150 (MQ=255) aatTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaaa < 1:569658/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:1264054/150‑1 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt < 2:352311/150‑1 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt < 2:2305385/150‑1 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt < 1:2621339/150‑1 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt < 2:1973362/150‑1 (MQ=255) aaGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt < 2:1589200/150‑1 (MQ=255) aTCAAGACAATAG‑AGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc < 2:1792038/150‑1 (MQ=255) tCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCg < 1:2283436/150‑1 (MQ=255) tCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCg < 2:883821/150‑1 (MQ=255) tCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCg < 2:471473/150‑1 (MQ=255) cAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 1:131976/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 2:536523/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 2:1803839/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 1:1447128/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGAGGTATTGACTATAAAATGCACTGATTCgt > 1:2330145/1‑150 (MQ=255) | TCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAG‑CGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGT > NC_000913/2470288‑2470585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |