| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,437,445 | G→A | 18.5% | A310T (GCC→ACC) | trkA → | NAD‑binding component of TrK potassium transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,437,445 | 0 | G | A | 18.5% | 981.5 / 193.2 | 400 | A310T (GCC→ACC) | trkA | NAD‑binding component of TrK potassium transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (155/170); new base A (32/42); total (187/213) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 406 total aligned reads displayed.
TCGAACGTAATCAGCAGCGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGGCCAATATCATGTCCGCCATGCTTGCCAAACGTATGGGTGCGAAAAAGGTGATGGTATTGATCCAGCGTCGCGCTTATGTGGATCTGGTTCAGGGGAGCGTTATCGATATTGCGATTTCACCACAACAAGCAACTATTTCTGCGTTGCTT > NC_000913/3437296‑3437594 | aaCGTAATCAGCAGCGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGGCCa > 1:4366987/1‑150 (MQ=255) gTAATCAGCAGCGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGGCCAata > 2:2679683/1‑150 (MQ=255) tAATCAGCAGCGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGGCCAatat > 1:755537/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGCGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGGCCAATATCAt < 1:4326949/150‑1 (MQ=255) agcagcGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCACCGATGACGAGACCAATATCATGt > 1:1340140/1‑150 (MQ=255) agcagcGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGACCAATATCATGt > 1:6442617/1‑150 (MQ=255) cagcGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGACGAGGCCAATATCATGTcc > 1:5003727/1‑150 (MQ=255) cagcGCGCTGCCGAACTGGCGGAAAAGTTACAGAATACGATCGT‑CTTTTTTGGTGATGCGTCGGATCAAGAACTACTGGCCGAAGAACATATCGATCAAGTTGATCTGTTTATTGCCGTCACCAACGATGAAGAGGCCAATATCATGTcc > 1:2252020/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |