| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 843,202 | 0 | G | T | 29.6% | 122.2 / 11.5 | 71 | A291S (GCC→TCC) | rlmF | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/28); new base T (21/0); total (43/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.23e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAGCAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCG > NC_000913/843064‑843341 | aaGCAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGc < 2:1604790/140‑1 (MQ=255)aaGCAGGTGATGTGGTTTACATCACGGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGc < 1:1748921/140‑1 (MQ=255) gCAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCCt > 1:1568406/1‑140 (MQ=255) ggTGATGTTGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGTAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGa < 2:1806779/140‑1 (MQ=255) gtgGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTGGCTGGACCTTTa > 2:287465/1‑140 (MQ=255) gtgGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCGGGCCCTTTa > 2:290020/1‑140 (MQ=255) tACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑Aacg < 1:1467970/140‑1 (MQ=255) cATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCGGGACCTTTATG‑Aaagac > 1:54494/1‑140 (MQ=255) cACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCGGGACCGTTATT‑TACGACGag > 1:859434/1‑140 (MQ=255) cTGGTATCTAGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTAATTCCGGGACCGTAATG‑AACGGCGtgcc > 2:780848/1‑139 (MQ=255) tGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGCTGGACCTTTATG‑AAAGACGagcag > 1:154994/1‑140 (MQ=255) tGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCGGGACCGTTATG‑AACGACGagcag > 1:548702/1‑140 (MQ=255) tGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGGCTGGACCTTTATG‑AACGACGagcag > 1:154981/1‑140 (MQ=255) tGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTTGACCGTTATT‑TAAGACGagcag > 1:154997/1‑140 (MQ=255) tGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCTGGACCGTTATG‑AAACAAGagcag > 1:795218/1‑140 (MQ=255) gTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAgcg > 2:404525/1‑140 (MQ=255) gTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGagcagcc > 2:406114/1‑139 (MQ=255) tctcGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGcgccg < 1:1289256/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGccgccg > 2:170614/1‑140 (MQ=255) tggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAATAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGtt > 2:1341464/1‑140 (MQ=255) tggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGACCATTATG‑AAAGACGAGCAGCGCCGCCGtt > 1:266894/1‑140 (MQ=255) tggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCGTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGtt > 2:804704/1‑140 (MQ=255) tggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTGCTGGGCCATTATT‑AACGACGAGCAGCgccgcccgt > 1:232693/1‑137 (MQ=255) ggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGttt < 2:1624702/140‑1 (MQ=255) gtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTACATGTCCGTTATG‑AAAGACGAGCAGCCCCCCCCtttt > 1:1258/1‑140 (MQ=255) tACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGACGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGc < 1:957956/140‑1 (MQ=255) tACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGc < 2:1487642/140‑1 (MQ=255) tACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGc < 1:1160659/140‑1 (MQ=255) aCCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATT‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAAACGcc > 2:1343343/1‑140 (MQ=255) cggccgTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCa < 2:1767513/138‑1 (MQ=255) ccgccgTTGTTTCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGTAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAACAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCa < 2:1767448/140‑1 (MQ=255) ccgccgTAGGATCGTGCCCCGACGGCCGTGGGCGCGGTGAAGGTGCTTACCAAAGCGAAGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTTGACCTTTATG‑TACGACGAGGAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCa < 2:205946/140‑1 (MQ=255) ttGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCAGGACCGTTATT‑AAACACGATCAACGCCGCCCTTTTTTCAAAAGCCACCGGTa > 1:35908/1‑140 (MQ=255) tATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGGTATTTCCGGGGCCGGTATGTAACG‑CGAGCCGCGCCGCCGGGGTGTCAATCGCCCGCGGGAAAg > 1:106806/1‑140 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCAGGACCATTATT‑AAACACGAGCAGCGCCCCCCTTTTTTAAAAACCCACCCTTAAATCGTTg > 1:676884/1‑140 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTCCTGGGCCATTATG‑TAAGACGAGGAGCGCCGCCGTGTTGTAGAACGCCAGCGTTCATGCGTTg > 1:1245806/1‑140 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCTGGAACATTATG‑AAAGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATAGCCCGCGTTAAAGCGTTg > 1:1594913/1‑140 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCAGGACCATTATT‑AAACACGAGCAGCGCCGCCGGTTTGTCAAAAGCCAGCGGTAAAGCGGTg > 1:298259/1‑140 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGGTATTTCCTGGTCCATTATG‑AACGACCAGCAGCGCCGCCGGTTTTTCAATAGCCAGCGGTGAAGCGTTg > 1:981073/1‑140 (MQ=255) acggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTCCTGGGCCGTTATT‑TAACACGAGCAGCGCCGCCGGTTTGTAAATCGCCCGCGGTAAATCGTTGGTTaccc > 1:1166470/1‑140 (MQ=255) acgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAACAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTAGTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGGTCCCCcggc < 2:1198972/140‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGGACTTTAAG‑AACGACGAGCCGCGCCGCCGTTTTGGAAATAGCCACCGTTAAAGCGTTGGTTACCCCGGCGGt > 2:328267/1‑140 (MQ=255) tGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGt < 1:1573536/140‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGt < 1:1575156/140‑1 (MQ=255) ggTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTGTTTTGCCGGGACCGGTATG‑AAAGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCACCCGTAAAGCGGTGGTTCCCCCGGCGGGAACgggt > 1:1541492/1‑138 (MQ=255) tGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTTTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGGTCa > 2:1460462/1‑140 (MQ=255) gtTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGAATGGACCAGTTTG‑AAAAAACAGCAGCGCCGCCGTTTTTTAAAAAGCCAGCGGTTAATAGGTTGTTACCCCCGCGGTAACGGTTGATCCGGGGt > 1:472333/1‑140 (MQ=255) gtTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCCAGGACCTTTATT‑AAAGACCAGCAGCGCCCCCGTTTTTTCAAAAGCCACCCGTAAAAAGTTTGTTACCCCCGCGGGAAAGGTTAAGCCggggg > 1:1237495/1‑139 (MQ=255) ttAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCTGGGACATTATG‑AAAGACGAGCAGCGCCGCCCTTTTTTCAATCGCCACCGTTAAATCGGTGGTTCCCCCCGCCGTAACGGTTCAGCCGGGGta > 2:1301846/1‑139 (MQ=255) aaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGACCTTTTTT‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGGGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCgcgc > 2:1732953/1‑140 (MQ=255) aaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGGCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATAGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTACCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCgcgc > 2:1732783/1‑140 (MQ=255) aaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCCAGGACCAGTATG‑AACCACGAGCAGCCCCCCCCTTTTGTCAAACCCCACCCTTAAAGCCGTGGTTCCCCCCGCCGGAACCGTTCACCCCGGGTCGCGcc > 1:873447/1‑140 (MQ=255) gaTGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAg < 2:1094488/140‑1 (MQ=255) gCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCAGGAACATTATT‑TAAGACCATCATCGCCGCCCAGTTGTCAAAAGCCACCGGTAAATCGGTGGGTCACCCGGCCGTAACCGATCAACCGGGGTCGCGCCCGGAgcagg > 2:123832/1‑140 (MQ=255) gCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCTGGAACTTTTTT‑AACCACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATAGCCAGCGTTAAAGGGATGGTTACCCCGGCGGTAACGGTTCATCCGGGGGCGCGCCCGGAgcagg > 2:1618796/1‑140 (MQ=255) cccAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcaggc < 1:180529/140‑1 (MQ=255) cAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGCGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcaggcag < 2:1585883/140‑1 (MQ=255) cAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcaggcag < 1:554219/140‑1 (MQ=255) ggggCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGACATTTATG‑AAAGACGAGCAGCTCCGCCCGTTGGTGAAACGCCATCGTTAGTGGAAATGGTACCCCGGCGGTAACGCTTCAGCCCGGGGCGCGCCCGCAGCAGgccgca > 2:617128/1‑140 (MQ=255) ggggCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGgcagca < 2:1298239/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGa < 2:1548679/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGa < 1:418493/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGa < 2:1324321/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGATTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGa < 2:1548593/140‑1 (MQ=255) aaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATT‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGGTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCCGCGGTAAAGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCAGAt > 2:329998/1‑140 (MQ=255) aaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGAt < 1:991775/140‑1 (MQ=255) aaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGAt < 1:933420/140‑1 (MQ=255) aaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGGTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCAGAt > 2:1208807/1‑140 (MQ=255) cAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGt < 1:1580921/140‑1 (MQ=255) cAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGt < 1:629755/140‑1 (MQ=255) ttGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGgcgcg > 2:501610/1‑140 (MQ=255) gCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGcgcgcg > 2:755788/1‑140 (MQ=255) | AAGCAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATG‑AACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCGTTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCG > NC_000913/843064‑843341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |