| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,305,085 | A→G | 6.1% | intergenic (+692/+23) | eco → / ← mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,305,085 | 0 | A | G | 6.1% | 1303.9 / 47.0 | 396 | intergenic (+692/+23) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (180/190); new base G (10/14); total (191/205) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
CTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTGCAACTCG > NC_000913/2304936‑2305234 | cTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATa > 2:2807225/1‑150 (MQ=255) ggCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAc‑c > 2:1606407/1‑150 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑Ca > 2:3717334/1‑150 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATg > 2:4936610/1‑150 (MQ=255) ctCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAAGATCGAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGcc < 1:49585/149‑1 (MQ=255) tCTTATGAGGCCTACTCCGCTGTTAAGTGCTCCACCCCTTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCTACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCg < 2:1662044/150‑1 (MQ=17) ccatacAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCgg > 2:1831744/6‑150 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCgg < 2:4066204/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATGG‑TATGCCGGa < 2:5006020/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATGG‑TATGCCGGa < 1:2827259/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATGG‑TATGCCGGa < 1:1011003/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGa > 1:5845388/1‑150 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGa < 1:2268037/150‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATGG‑TATGCCGGAt < 1:1290835/150‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGAt < 1:398679/150‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGAt < 2:4635570/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGAtg > 2:2138632/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCGGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGC‑TACGAATGCCGGAtg < 1:5054376/150‑1 (MQ=17) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTGTCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTgg > 1:4819903/1‑150 (MQ=255) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTgg < 2:1213640/150‑1 (MQ=255) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTgg > 2:5262162/1‑150 (MQ=255) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTgg > 2:4374295/1‑150 (MQ=255) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATGG‑TATGCCGGa < 2:1497888/145‑1 (MQ=14) ccTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGt > 1:7092/1‑150 (MQ=255) ccTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGt > 2:3157916/1‑150 (MQ=255) acCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTGATCAGCATACGCCACATCCGGCCTAC‑CAGGCCGGATGTGGCGTATCAt > 2:3011784/1‑150 (MQ=17) acCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCg > 1:3502733/1‑135 (MQ=255) acCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCg < 2:3502733/135‑1 (MQ=255) cGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTCTCAGCATACGCCACATCCGGCCTAC‑CATGCCGGATGTGGCGTAGCAtaa > 2:4281582/1‑148 (MQ=21) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACa > 1:4078835/1‑150 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTAGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CAAGCCGGATGTGGCGTATCATTACa > 1:2498974/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGc < 1:5395914/150‑1 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCaa < 2:4229517/150‑1 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAat > 1:2144862/1‑150 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATc > 1:3157487/1‑150 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATc > 2:1133418/1‑150 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGGATCATTACAACGCAATATc > 1:2015999/1‑150 (MQ=255) tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATcc > 1:1136961/1‑150 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGACCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAAACGACACATCAGTCCTAC‑AAAGCCCGATGTGTCGTATCATGACAACACaacgcaac > 2:5372664/1‑144 (MQ=14) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc < 1:5954049/150‑1 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc > 2:821066/1‑150 (MQ=255) cACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGAt < 1:3729762/121‑1 (MQ=255) aCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCAcc > 1:3225317/1‑150 (MQ=255) gTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCTActtc < 2:2013064/150‑1 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCtttt > 1:966605/1‑150 (MQ=255) ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGACCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAAACGCCACATCCGGCATAC‑AATTCCGGATGTGGCGTATAATTACAAAGCAAAAACCCCCACTTCtattt > 2:4166706/1‑150 (MQ=18) ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGCATACGCCACATCCGGCCTAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTGCtgttt > 1:4757138/1‑150 (MQ=255) gCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGtt > 1:4362874/1‑150 (MQ=255) gCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGtt > 1:4420470/1‑150 (MQ=255) gCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCACGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGATGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTTAACGGGtt > 1:1702935/1‑150 (MQ=255) ttACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCgg < 2:563309/150‑1 (MQ=255) tACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGt < 2:2498974/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGtt < 1:4231293/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CAGGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGtt > 1:1063586/1‑150 (MQ=255) cgcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCaa < 1:92649/150‑1 (MQ=255) cgcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCaa > 2:3306468/1‑150 (MQ=255) cATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACt < 2:5740255/150‑1 (MQ=255) aTCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTg < 1:4517983/150‑1 (MQ=255) aaCATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGt > 1:4853715/1‑150 (MQ=255) aaCATCAAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACAACCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCCTCACAACGCAATATCCGCCCCTTCTTGTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACAGCGGt > 1:2884699/1‑150 (MQ=38) aTCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTc < 1:1831744/150‑1 (MQ=255) cTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCgg > 2:3813186/1‑150 (MQ=255) tAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGc < 1:1511295/150‑1 (MQ=255) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCg > 2:4139982/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGAGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTGGGCGt < 1:1721104/150‑1 (MQ=255) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTAc > 2:5978891/1‑150 (MQ=255) cccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACt < 2:311087/150‑1 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTAt < 2:754628/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTGTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTGTCGGCGTACTATCtgctgc > 2:5885938/1‑150 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGctgcctg < 1:3058629/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCg < 1:4926080/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCg > 2:2275858/1‑150 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAAc < 1:2982010/102‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCgg < 1:2543019/150‑1 (MQ=255) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTg < 1:5222801/150‑1 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCTGCATAC‑CATGCCTGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGTACTGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCTGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTc < 1:5580561/150‑1 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTc < 2:4777540/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCg > 1:3593893/1‑150 (MQ=255) cgTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAAc < 2:2585254/150‑1 (MQ=255) cTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAAcccc > 1:2461792/1‑150 (MQ=255) cTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAAcccc > 1:5681178/1‑150 (MQ=255) ttATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCa < 1:5612708/150‑1 (MQ=255) ttATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGGACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCa > 1:380466/1‑150 (MQ=255) tgaTACGCCACATCCGGCATGG‑TATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCGTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTCTGTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACtt > 1:5290822/3‑150 (MQ=38) gCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACtt < 2:3412011/150‑1 (MQ=255) aTACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCg < 1:566033/150‑1 (MQ=255) aTACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCg < 1:1996078/150‑1 (MQ=255) aCGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCt > 2:435569/1‑150 (MQ=255) cGCCACATCCGGCAAAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATAATTACAAAGCAATAACCGCCACATCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAAATGCGGTTTCGGCGTACTATCATCTGCCTGCGGCTTGTAGTAGTTAAAACCCAGCACTACGCTg > 1:632161/1‑150 (MQ=255) gCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGACCGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTCTCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTCGTTCAACCCCAGCACTGCGCTgg > 2:5452998/1‑150 (MQ=255) gCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTgg > 2:5992985/1‑150 (MQ=255) acaTCCGGCATGG‑TATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGgtgt > 2:4039912/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTTCAACGCAATATCCGCCTCTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTAc < 2:1381135/150‑1 (MQ=255) tCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACt > 1:1203608/1‑150 (MQ=255) tCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACt < 1:2671203/150‑1 (MQ=255) ccGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTg > 1:3749845/1‑150 (MQ=255) ggCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTGCa > 2:4454783/1‑150 (MQ=255) cATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTGCAAc > 1:443390/1‑150 (MQ=255) aTAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACGATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTGCAACt > 2:3978707/1‑150 (MQ=255) tAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTGCAACTc < 1:428272/150‑1 (MQ=255) | CTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAC‑CATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCGGTTTCGGCGTACTATCTGCTGCCTGCGGCTTGTCGTAGTTCAACCCCAGCACTTCGCTGGTGTACTGCAACTCG > NC_000913/2304936‑2305234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |