| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,900,322 | 0 | C | T | 5.6% | 1159.3 / 37.2 | 336 | intergenic (‑49/‑270) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (134/183); new base T (9/10); total (143/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
AATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACAC > NC_000913/2900173‑2900471 | aaTGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGTTTTTACCTTTCAGGGATAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGATATATTCGATTGACATAGTTAGATCAAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAACGGTAACTTcccc < 1:2902730/150‑1 (MQ=255) tGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCgag > 1:6045758/1‑150 (MQ=255) ggCCTAATCCGCTTTTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGTGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTTAGAGATTCGATTGAATTAGTTAGCTCCATTTTCCGTAAGGC‑AAATACAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCgaga < 2:3593261/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |