| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,239,609 | 0 | T | G | 7.0% | 877.5 / 22.3 | 297 | intergenic (+64/‑335) | alx/sstT | putative membrane‑bound redox modulator/sodium:serine/threonine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (196/63); new base G (4/16); total (201/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.01e-07 | |||||||||||
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Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
TGGGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAA‑TCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAT > NC_000913/3239460‑3239757 | gggCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAA‑TCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCCCTCTCCCTTc < 1:7907234/150‑1 (MQ=255) gggCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAA‑TCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCCCTCTCCCTTc > 2:6221091/1‑150 (MQ=255) gggAGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTTTCTACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAA‑TCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCCCTCTCCCTTc < 2:1700558/150‑1 (MQ=255) 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ctctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTg > 2:5092693/1‑150 (MQ=255) ctctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGGGTGTTGCGCTCACCCTATCCGTCTCCGCAATCGGGGCGAGGGGCCTGACGGAGTGCTTTTTTGATGTTGTGATCGGTGTGGAGGCCggtggttg > 2:5022122/1‑143 (MQ=255) tctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:7136879/1‑150 (MQ=255) tctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 1:7068657/1‑150 (MQ=255) tctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTACCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTTATGTTTTAATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTgg > 2:201268/1‑150 (MQ=255) tccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCGCACCCGAACCCACACCCCAAACGGGGCGAGGGGACGGACCGAGTCCATTTTTTATGGTGTCCTCAGTCTGGAAGCCGCACGGTGGCt > 1:2150411/1‑150 (MQ=255) ccctGCCAGGGCGTGGGTGGGGGTGAGGTTAATTGTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGTGGGGCCTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCtt < 1:3260251/150‑1 (MQ=37) | TGGGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAA‑TCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAT > NC_000913/3239460‑3239757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |