| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,674,183:1 | +G | 7.4% | coding (271/1035 nt) | tqsA → | pheromone AI‑2 transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,674,183 | 1 | . | G | 7.4% | 306.3 / 21.6 | 81 | coding (271/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (40/35); new base G (3/3); total (43/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.04e-01 | |||||||||||
ATTTATTGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCAAC > NC_000913/1674035‑1674329 | atttattGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑c > 1:867492/1‑150 (MQ=255) tattGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCG‑TCAACTCGTTGagcgcg < 2:1414187/150‑6 (MQ=255) attGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGGGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCgg < 2:1606302/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCG‑TCAACTCGTTGAGCGCGGa < 1:1508389/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACTTGGGCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCTATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCG‑TCAACTCGTTGAGCGCGGaa < 1:394990/150‑2 (MQ=255) tGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGtt > 1:210950/1‑150 (MQ=255) gTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTa > 1:1275332/1‑150 (MQ=255) gTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTa > 1:1702261/1‑150 (MQ=255) ttATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCG‑TCAACTCGTTGAGCGCGGaacccag < 2:1390103/150‑7 (MQ=255) tATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTAcc < 1:963923/150‑1 (MQ=255) aTTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCg < 1:703945/150‑1 (MQ=255) aTTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCg > 1:90649/1‑150 (MQ=255) tCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCa > 2:409952/1‑150 (MQ=255) cGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGAAGTTACCGCAATATCGCa > 1:1220800/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCaa > 2:75255/1‑150 (MQ=255) tGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCta > 2:515605/1‑150 (MQ=255) cAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCACCTCtatt > 2:835308/1‑150 (MQ=255) cAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCtatt < 1:515605/150‑1 (MQ=255) aaCACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCGTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCtattt > 1:300786/1‑149 (MQ=255) tGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGAcgc > 1:1707088/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGc > 1:1179386/1‑150 (MQ=255) ggCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAg < 2:500157/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCt < 1:75255/150‑1 (MQ=255) gCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGa > 2:720062/1‑101 (MQ=255) gCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGa < 1:720062/101‑1 (MQ=255) cgcgTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAAc < 1:309792/150‑1 (MQ=255) cgcgTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTGCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAAc < 1:502148/150‑1 (MQ=255) ggtACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCgtt < 1:474093/149‑1 (MQ=255) tACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCgttgt > 1:401078/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCa < 2:1417947/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCa < 1:409952/150‑1 (MQ=255) ggTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAAcg > 2:1197835/1‑150 (MQ=255) tCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTa > 1:275601/1‑150 (MQ=255) cGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAg > 1:755130/1‑150 (MQ=255) gATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAgg < 2:867492/150‑1 (MQ=255) aTTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAggg > 1:1018171/1‑150 (MQ=255) ttttGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGa > 1:291919/1‑150 (MQ=255) gatgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGa > 2:956532/1‑150 (MQ=255) gatgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGa < 1:1045362/150‑1 (MQ=255) atgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGAc < 2:291919/150‑1 (MQ=255) atgaCCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGAc < 1:33962/150‑1 (MQ=255) aCCATCATCGTGATGGCGATGGTGCTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGtc > 1:635171/1‑150 (MQ=255) ccATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCACAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGtct > 2:1118486/1‑150 (MQ=255) catcatCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGtctc < 2:755130/150‑1 (MQ=255) tcatcGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAg < 1:928798/150‑1 (MQ=255) tcatcGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAg < 1:934993/150‑1 (MQ=255) catcGTGTTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCTCGCTCAACGAGTTGA‑CCCGGACGTTACCGCATTATCGCAACTCTATTATGTCGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGt < 1:881288/150‑1 (MQ=255) gTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGAc > 1:765608/1‑150 (MQ=255) gTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGAc < 2:1275332/150‑1 (MQ=255) tGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGAcc < 1:1501154/150‑1 (MQ=255) aTGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCAGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGCCGTCTCAGTTGACCAg > 2:207335/1‑150 (MQ=255) cGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTgg < 1:9344/150‑1 (MQ=255) cGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTgg > 1:766587/1‑150 (MQ=255) gATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGgc < 2:90649/150‑1 (MQ=255) tGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGgcgc < 1:1672647/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCAt < 2:1702261/150‑1 (MQ=255) tgtTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCAtt > 2:177417/1‑150 (MQ=255) tgtTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCAtt > 1:1697439/1‑150 (MQ=255) tGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATtata > 2:1614907/1‑150 (MQ=255) gCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCATCTATAATATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGATGGCGCATTatat > 1:297221/1‑150 (MQ=255) cTATTAGCTTATCTGTGTTGCGCGCTCTACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTTTTATGCCGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACGAGCTGGCGCATTAtttt < 1:993341/150‑1 (MQ=255) tATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTg > 1:1057415/1‑150 (MQ=255) aGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATcc < 1:956532/150‑1 (MQ=255) gCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCg > 2:947317/1‑150 (MQ=255) tCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAAcgc > 2:461283/1‑150 (MQ=255) ggtaacgtCCGCG‑TCAACTCGTTGAGCGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCACCGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAAcgc > 2:193347/8‑150 (MQ=255) gtaacgtCCGCG‑TCAACTCGTTGAGCGCGGACGTTACCGCAATATCGCCACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGCCGTCTCAGTTGCCCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGCTcgcg > 1:1642687/7‑150 (MQ=255) gggTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACgcggc < 2:1244514/150‑1 (MQ=255) gggTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACgcggc < 2:1707088/150‑1 (MQ=255) cgtCCGCG‑TCAACTCGTTGAGCGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGa > 1:541453/3‑150 (MQ=255) ttCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCACAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGAt < 1:1118486/150‑1 (MQ=255) tCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATg < 1:1197835/150‑1 (MQ=255) tCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATg < 1:1614907/150‑1 (MQ=255) tCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATg > 1:204870/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGAc > 1:1712949/1‑150 (MQ=255) cTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTg > 1:686328/1‑150 (MQ=255) cAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCt > 2:1200532/1‑150 (MQ=255) cAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCt > 2:1374491/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCTc > 2:711217/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTAGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCTc > 1:1707256/1‑150 (MQ=255) gTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCaa > 1:1554524/1‑150 (MQ=255) ttGA‑CGCGGTCGTTACCGCAATATCGCATCTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCTACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATAATGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCAAc < 2:297221/150‑1 (MQ=255) ttGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGTACGCGGCGATGTCGTTGCTCACCAAc < 2:1018171/150‑1 (MQ=255) | ATTTATTGCTGTTATTCTTAACCCGCTGGTGCAACACATGGTCCGCTGGCGTGTGCCGCGTGTACTGGCGGTGTCGATTTTGATGACCATCATCGTGATGGCGATGGTGTTGCTATTAGCTTATCTGGGTTCCGCGCTCAACGAGTTGA‑CGCGGACGTTACCGCAATATCGCAACTCTATTATGACGCCGCTGCAAGCGCTTGAACCGTTGTTGCAACGCGTAGGGATTGACGTCTCAGTTGACCAGCTGGCGCATTATATTGATCCGAACGCGGCGATGACGTTGCTCACCAAC > NC_000913/1674035‑1674329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |