| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,263,501 | G→C | 7.6% | P54A (CCG→GCG) ‡ | tdcD ← | propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,263,501 | 0 | G | C | 7.6% | 379.1 / 18.6 | 119 | P54A (CCG→GCG) ‡ | tdcD | propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/61); new base C (7/2); total (56/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.17e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACC > NC_000913/3263353‑3263646 | tCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGt < 1:1336306/150‑1 (MQ=255) cATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTg < 2:161864/150‑1 (MQ=255) agcGGAAATAATGGCTGACTCTGTAAAAATACTGCCGCCGTGATCGAGTCGGTGGCCAATTTAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGc < 2:301753/148‑1 (MQ=255) cGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTg > 1:646632/1‑150 (MQ=255) ggTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTgg > 1:1121505/1‑150 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGCTGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCCATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:1485690/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:16134/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 2:646632/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGGGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:529403/150‑1 (MQ=255) taatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGcggtc > 1:134618/1‑146 (MQ=255) aatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑Tcc < 1:1549465/150‑1 (MQ=255) aatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCACCGCTGGCTC‑Acc < 1:1073929/150‑1 (MQ=255) atGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑Tccc < 1:1435953/150‑1 (MQ=255) tGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCTAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAACGGTGCTGGatcaaccc > 2:1456856/1‑145 (MQ=255) gACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCATTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCCGTTGTGGGAC‑TGCCCC‑Attt > 2:1586679/1‑150 (MQ=255) cTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTAc < 1:212578/150‑1 (MQ=255) cTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCACCCGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTAc > 2:506301/1‑150 (MQ=255) cGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACgg < 2:1552305/150‑1 (MQ=255) gTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGATCCCGCGGTGCTGGAAC‑TCCCCCAATTTACgtt > 2:568247/1‑148 (MQ=255) aaaaTACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATACCGGATTTCCAGTTCAAATGCAATAGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCAAGCGGTGCTGGCTC‑ACCCAC‑ATTTACGGATAAg > 1:54956/1‑150 (MQ=255) aaaTACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGa > 2:552565/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGCCGCCGTGAGCGATGCGTGGGCCAATTAGGGCCACCATGGCTTTTAAATGCGTTTTTGCCATTTAAATTGAAATTGCATTCAATGCCCCTTCTTAGCGTTGGTGAGCAAGCGGTCATGGATC‑TCCCCC‑ATTTACGGATacta > 2:1216430/1‑147 (MQ=255) aCTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGGTGGGTC‑GCCCCC‑AATTACGGATAAGAATgg > 2:374799/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCCCGGGGGGGGGGG‑TCCCCC‑ATTTTAGGATTAGAATGGAt‑tt > 1:1063222/1‑150 (MQ=255) ccgccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCGA‑TCCCCC‑CATTAACGTTAATAATGGAt‑tt > 2:597037/1‑150 (MQ=255) cgccgTGCGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCAATTAAATTCCGTTGTGCCAGTTCAACTGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑GCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAt‑ttt < 1:287197/150‑1 (MQ=255) cgccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAt‑ttt > 1:665156/1‑150 (MQ=255) gccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTc < 1:990538/150‑1 (MQ=255) ccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTcc > 2:57764/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGGGGTGCTGGGGC‑TCCCCC‑AATTACGGGTTAGAATGCAT‑TTTGCgg > 1:414324/1‑149 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGa > 2:22533/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGa < 2:162955/150‑1 (MQ=255) aGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCTTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGtt < 1:1453424/150‑1 (MQ=255) aGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGtt < 1:1111166/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCg < 1:1019000/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGGGGTGGCTC‑TACCCC‑ATTTTCGGATTATAATGCAT‑TTTACGAGTTAATAACgg > 1:1703449/1‑149 (MQ=255) tGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCg > 1:1015107/1‑150 (MQ=255) gggCCAAGTCAGGCCTCACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAACGGCAATTGCCTTCAATGCACCATCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCGCC‑ATTTACGCATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGGCg < 2:314684/149‑1 (MQ=255) ggCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCgg > 1:920587/1‑150 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGc < 2:195188/150‑1 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGc < 1:825709/150‑1 (MQ=255) ccAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑GTCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGCGTTAATACCGTCGGcc > 1:37240/1‑149 (MQ=255) aaTTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAAt > 1:36153/1‑150 (MQ=255) aGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTg < 2:842179/150‑1 (MQ=255) ggCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGa < 1:1448372/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTTGAGGCTCAAACCCC‑ATTTAC‑GATTAGAAATCAA‑TTTACGAGATTATACCCTAGGGAAAACCTGaa > 2:1477218/1‑149 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGAc < 2:161830/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGAc < 2:1453338/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGAc < 1:606572/150‑1 (MQ=255) acacTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCTGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAAAGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATTCCTGACAtt > 1:242259/1‑150 (MQ=255) cacTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCACCGGTGGGTGCGG‑ACCCCC‑AGTTAAAGAAAAGAATGCATGTTAACAGGTTAAAACCG‑GGGGAATACCTGACagtt > 2:871129/1‑147 (MQ=255) cTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAAt < 2:1121505/150‑1 (MQ=255) cATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACtt > 1:1020699/1‑150 (MQ=255) aTTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATTCAATTGCCTTCAATGCAACTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCACCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTc < 1:261206/150‑1 (MQ=255) tttAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGAAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTca < 2:723895/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTcac > 2:236613/1‑150 (MQ=255) tAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGAAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCGCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCAGCAATACCTGACATTAATACTTcaca < 2:319279/150‑1 (MQ=255) aaTTCCTTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGAACCTTCGTAGCTGTTGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGTCAATACCTGACATTAATACTTcacatt < 2:642474/150‑3 (MQ=255) cGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCGGTGCTGGCTA‑TACCCC‑AATTAAGGATAAGAATGAAT‑TTTACGAGTTAATACCGTCGGCAAAACATGACAATAATAAATAACAGTCGCTg > 1:1034137/1‑150 (MQ=255) cGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTg > 1:986154/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTgg < 1:980228/150‑1 (MQ=255) gTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTgg < 1:583996/150‑1 (MQ=255) ttttCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTAGCTGGCa > 1:1144220/1‑150 (MQ=255) tttCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCAt < 1:1271494/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGa < 2:217589/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGa < 1:1674948/150‑1 (MQ=255) cAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAg < 1:1477218/150‑1 (MQ=255) aGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCTTATCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATAAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGc < 1:297380/150‑1 (MQ=255) aGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCACCGGGGCTGGCTC‑TCCCCC‑CATTAAGGATAATAAATCAA‑TTTAAGAGTTAATACCGTCGGCCATACCGGACAATAATAAATAACAATAGCAGGCATCGAGc > 2:385737/1‑150 (MQ=255) ttCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTTGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAAAACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCAc < 2:748133/150‑1 (MQ=255) tCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAAAACCGTCGGCAATACCAGACCTTAAAACAGCACAGTCGCAGGCATCGAGCaag > 2:894179/1‑148 (MQ=255) aTGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑AATTACGGATAAGAATGCAT‑TTTACGAGTTAATACCGTCGGCAATAACTGACATTAATAAATAAAACTCGCTGGCATCGAGCACGGaaa > 2:1609291/1‑150 (MQ=255) gCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGTGGTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTAAGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAAAACCGTGGGCAATTCCTGACATTAAAACGTCACAGTAGCTGGCCTAGAGCCCGGAAAAc > 2:141996/1‑150 (MQ=255) cAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑AATTAAGGATAAGAAAGCAT‑TTTACGAGTTAAAACCCTCGGCAAAACCTTAAAATAATAAATAACAGTAGCTTGCCTCGAGCACGGAAAAca > 2:453589/1‑149 (MQ=255) tGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAAt < 1:1456856/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATc < 2:665156/150‑1 (MQ=255) cTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGa < 1:236613/150‑1 (MQ=255) tCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAg < 1:788308/150‑1 (MQ=255) cTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACcac > 1:1124063/1‑150 (MQ=255) ttCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACcaca < 2:1015107/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc < 1:453589/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc < 1:552565/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 1:362307/1‑150 (MQ=255) ggggagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCGGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 2:278721/6‑150 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGa > 2:1273074/5‑131 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGa < 1:1273074/127‑1 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAcc > 1:635309/5‑150 (MQ=255) gtgCGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa < 2:1501750/150‑1 (MQ=255) gagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa > 1:633492/3‑150 (MQ=255) gagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa > 1:730257/3‑150 (MQ=255) gagAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACACTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTAAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa > 2:1281983/3‑150 (MQ=255) tgAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGCATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATTCCTGCCATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaa > 1:77555/1‑150 (MQ=255) tgAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaa < 1:491064/150‑1 (MQ=255) agAGCCAGCACCGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaa > 1:122473/2‑150 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaaca < 2:134618/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaaca < 2:886878/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGTGCTGGATC‑TCCCCC‑ATTTACGTATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaacaa < 1:1110782/150‑1 (MQ=255) aGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc < 1:867777/140‑1 (MQ=255) aGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 2:867777/1‑140 (MQ=255) aGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATAAATACTTCACAGTCGCTCGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAAcc < 1:57764/150‑1 (MQ=255) | TCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTC‑TCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACC > NC_000913/3263353‑3263646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |