| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,263,502 | T→C | 7.7% | A53A (GCA→GCG) | tdcD ← | propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,263,502 | 0 | T | C | 7.7% | 323.0 / 14.9 | 118 | A53A (GCA→GCG) | tdcD | propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/60); new base C (7/2); total (56/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.83e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAA > NC_000913/3263353‑3263651 | tCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGt < 1:1336306/150‑1 (MQ=255) cATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTg < 2:161864/150‑1 (MQ=255) agcGGAAATAATGGCTGACTCTGTAAAAATACTGCCGCCGTGATCGAGTCGGTGGCCAATTTAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGc < 2:301753/148‑1 (MQ=255) cGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTg > 1:646632/1‑150 (MQ=255) ggTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTgg > 1:1121505/1‑150 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGCTGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCCATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:1485690/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:16134/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 2:646632/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGGGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:529403/150‑1 (MQ=255) aatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTcc < 1:1549465/150‑1 (MQ=255) atGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCTCACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTccc > 1:302854/1‑150 (MQ=255) atGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTccc < 1:1435953/150‑1 (MQ=255) tGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCTAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAACGGTGCTGGatcaaccc > 2:1456856/1‑145 (MQ=255) cGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGACAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACAGTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑At > 2:1110782/1‑150 (MQ=255) ggACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGATGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑Att < 1:1537311/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCATTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCCGTTGTGGGACTGCCCC‑Attt > 2:1586679/1‑150 (MQ=255) cTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTAc < 1:212578/150‑1 (MQ=255) cGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCACCCGTGGTGGGGCTCCCCC‑AATTAAgg > 2:1448372/1‑150 (MQ=255) cGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACgg < 2:1552305/150‑1 (MQ=255) gTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGATCCCGCGGTGCTGGAACTCCCCCAATTTACgtt > 2:568247/1‑148 (MQ=255) aaaTACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGa > 2:552565/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGCCGCCGTGAGCGATGCGTGGGCCAATTAGGGCCACCATGGCTTTTAAATGCGTTTTTGCCATTTAAATTGAAATTGCATTCAATGCCCCTTCTTAGCGTTGGTGAGCAAGCGGTCATGGATCTCCCCC‑ATTTACGGATacta > 2:1216430/1‑147 (MQ=255) tACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGTATg < 2:1564986/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGGTGGGTCGCCCCC‑AATTACGGATAAGAATgg > 2:374799/1‑149 (MQ=255) aCTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGc < 1:1208795/150‑1 (MQ=255) ccgccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCCCGGGGGGGGGGGTCCCCC‑ATTTTAGGATTAGAATGGAt‑tt > 1:1063222/1‑150 (MQ=255) ccgccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCGATCCCCC‑CATTAACGTTAATAATGGAt‑tt > 2:597037/1‑150 (MQ=255) cgccgTGCGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCAATTAAATTCCGTTGTGCCAGTTCAACTGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCGCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAt‑ttt < 1:287197/150‑1 (MQ=255) gccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTc < 1:990538/150‑1 (MQ=255) ccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTcc > 2:57764/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGGGGTGCTGGGGCTCCCCC‑AATTACGGGTTAGAATGCAT‑TTTGCgg > 1:414324/1‑149 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGa < 2:162955/150‑1 (MQ=255) gAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGTATGCAT‑TTTCCGAGt > 1:714026/1‑150 (MQ=255) aGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCTTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGtt < 1:1453424/150‑1 (MQ=255) aGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGtt < 1:1111166/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCg < 1:1019000/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGGGGTGGCTCTACCCC‑ATTTTCGGATTATAATGCAT‑TTTACGAGTTAATAACgg > 1:1703449/1‑149 (MQ=255) tGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCg > 1:1015107/1‑150 (MQ=255) ggCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCgg > 1:920587/1‑150 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGc < 1:1415423/150‑1 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGc < 1:825709/150‑1 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGc < 2:195188/150‑1 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCACTACCCC‑ATTTACGGATAAGAAAGCAT‑TTTACGATTTAATACCTTCgga > 2:297380/1‑149 (MQ=255) aaTTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAAt > 1:36153/1‑150 (MQ=255) ggCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGTGCTGGGTCTCCCCC‑ATTTAAGGATAAAAATTCAT‑TTTACGAGTTTATAACGTAGGCAATACCAGa > 2:491064/1‑150 (MQ=255) ggCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGa < 1:1448372/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGAc < 2:1453338/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGAc < 1:606572/150‑1 (MQ=255) ccACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACa < 1:584359/150‑1 (MQ=255) acacTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCTGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAAAGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATTCCTGACAtt > 1:242259/1‑150 (MQ=255) cacTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCACCGGTGGGTGCGGACCCCC‑AGTTAAAGAAAAGAATGCATGTTAACAGGTTAAAACCG‑GGGGAATACCTGACagtt > 2:871129/1‑147 (MQ=255) cTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAAt < 2:1121505/150‑1 (MQ=255) cTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAAAGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAAt < 1:459365/150‑1 (MQ=255) cATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACtt > 1:1020699/1‑150 (MQ=255) tttAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGAAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTca < 2:723895/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTcac < 2:63964/150‑1 (MQ=255) ttAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTcac > 2:236613/1‑150 (MQ=255) tAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGAAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCGCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCAGCAATACCTGACATTAATACTTcaca < 2:319279/150‑1 (MQ=255) cGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCGGTGCTGGCTATACCCC‑AATTAAGGATAAGAATGAAT‑TTTACGAGTTAATACCGTCGGCAAAACATGACAATAATAAATAACAGTCGCTg > 1:1034137/1‑150 (MQ=255) cGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTg > 1:986154/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTgg < 1:980228/150‑1 (MQ=255) tttCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCAt < 1:1271494/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGa < 2:217589/150‑1 (MQ=255) aGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCTTATCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATAAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGc < 1:297380/150‑1 (MQ=255) aGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCACCGGGGCTGGCTCTCCCCC‑CATTAAGGATAATAAATCAA‑TTTAAGAGTTAATACCGTCGGCCATACCGGACAATAATAAATAACAATAGCAGGCATCGAGc > 2:385737/1‑150 (MQ=255) ttCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTTGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAAAACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCAc < 2:748133/150‑1 (MQ=255) tCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAAAACCGTCGGCAATACCAGACCTTAAAACAGCACAGTCGCAGGCATCGAGCaag > 2:894179/1‑148 (MQ=255) aTGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑AATTACGGATAAGAATGCAT‑TTTACGAGTTAATACCGTCGGCAATAACTGACATTAATAAATAAAACTCGCTGGCATCGAGCACGGaaa > 2:1609291/1‑150 (MQ=255) gCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGTGGTGGCTCTCCCCC‑ATTTAAGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAAAACCGTGGGCAATTCCTGACATTAAAACGTCACAGTAGCTGGCCTAGAGCCCGGAAAAc > 2:141996/1‑150 (MQ=255) cAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑AATTAAGGATAAGAAAGCAT‑TTTACGAGTTAAAACCCTCGGCAAAACCTTAAAATAATAAATAACAGTAGCTTGCCTCGAGCACGGAAAAca > 2:453589/1‑149 (MQ=255) aaTTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCGCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAA‑TTTACGAGTTTATACCGGCGGGAATACCTGGCATTAATAAGTCACAGTCGCTGGCAGCGAGAACGGAAAAcgt > 2:833930/1‑148 (MQ=255) tGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAAt < 1:1456856/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATc < 2:665156/150‑1 (MQ=255) cTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGa < 1:236613/150‑1 (MQ=255) tCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAg < 1:788308/150‑1 (MQ=255) tGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGa < 1:22533/150‑1 (MQ=255) cTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACcac > 1:1124063/1‑150 (MQ=255) aGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACGTCAAAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATAGAAGTCGCACCACACTtaa > 1:909727/1‑150 (MQ=255) gtggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc < 1:552565/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 1:362307/1‑150 (MQ=255) gtggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc < 1:453589/150‑1 (MQ=255) ggggagAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCGGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 2:278721/6‑150 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGa > 2:1273074/5‑131 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGa < 1:1273074/127‑1 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAcc > 1:635309/5‑150 (MQ=255) gtgCGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa < 2:1501750/150‑1 (MQ=255) gtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa > 1:107929/1‑150 (MQ=255) gagAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa > 1:633492/3‑150 (MQ=255) gagAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaa > 1:730257/3‑150 (MQ=255) tgAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGCATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATTCCTGCCATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaa > 1:77555/1‑150 (MQ=255) tgAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaa < 1:491064/150‑1 (MQ=255) agAGCCAGCACCGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaa > 1:122473/2‑150 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaaca < 2:1703449/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaaca < 2:134618/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaaca < 2:886878/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGTGCTGGATCTCCCCC‑ATTTACGTATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaacaa < 1:1110782/150‑1 (MQ=255) aGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 2:867777/1‑140 (MQ=255) aGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATAAATACTTCACAGTCGCTCGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAAcc < 1:57764/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACCGTTAATAACCAACACAACCGGaaa > 1:556419/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGaaa > 1:563192/1‑150 (MQ=255) | TCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCC‑ATTTACGGATAAGAATGCAT‑TTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAA > NC_000913/3263353‑3263651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |