| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,089,854 | 0 | A | T | 7.0% | 366.6 / 11.7 | 129 | intergenic (‑141/‑142) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/54); new base T (6/3); total (72/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.30e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACTTTTATGACACG > NC_000913/2089705‑2090003 | tGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACa < 2:630291/150‑1 (MQ=255) aCGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTc < 2:1221932/150‑1 (MQ=255) cGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTcc > 1:496276/1‑150 (MQ=255) 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ggCTAAGAGGACTGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGAc > 2:196583/2‑150 (MQ=255) gCTAAGAGGACTGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACt > 2:715410/1‑150 (MQ=255) gCTAAGAGGACAGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACt > 2:723029/1‑150 (MQ=255) ttagagGACAGTCCTCTTAT‑CACACTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCCAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTTAATAAACATTCACAGAGACttt < 2:899303/148‑1 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTATCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACttt < 1:1535749/150‑1 (MQ=255) 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aCAGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACTTTTATGaca < 1:465689/150‑1 (MQ=255) aGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACTTTTATGACAcg > 2:720525/1‑150 (MQ=255) | TGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAG‑CCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACTTTTATGACACG > NC_000913/2089705‑2090003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |