| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,900,322 | C→T | 8.1% | intergenic (‑49/‑270) | ygcW ← / → yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,900,322 | 0 | C | T | 8.1% | 240.3 / 7.4 | 87 | intergenic (‑49/‑270) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/41); new base T (5/2); total (43/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.32e-01 | |||||||||||
CCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACAC > NC_000913/2900177‑2900471 | ccTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAAAAAGGTAACTTCCCCcgcg > 2:482936/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCga > 1:856248/1‑150 (MQ=255) gCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGagag > 1:754638/1‑150 (MQ=255) tAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAggg > 2:1229955/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGaa < 1:493162/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAg < 2:1260898/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAg > 2:315167/1‑150 (MQ=255) ccGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGtt > 2:821346/1‑150 (MQ=255) ccGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGtt > 2:1194286/1‑150 (MQ=255) cGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCTATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTa > 2:46045/1‑150 (MQ=255) tATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCt < 1:1291122/150‑1 (MQ=255) tATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCt < 2:532361/150‑1 (MQ=255) aTTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGCTTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCtt < 1:786407/150‑1 (MQ=39) aTTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAATAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCtt > 1:1306236/1‑150 (MQ=255) tCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGATAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTtc < 1:1084941/150‑1 (MQ=255) tCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGAATGACATAGTTAGCTCCAATATCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTtc < 1:186391/150‑1 (MQ=255) cccACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTtct > 2:688447/1‑150 (MQ=255) cccACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTtct > 1:166861/1‑150 (MQ=255) ccGGTAACAATTGCGGTATTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑‑AAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTa < 1:519955/150‑1 (MQ=255) ggTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTTACATAGTTAGCGCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTa < 2:621955/150‑1 (MQ=255) cAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTg < 1:716993/150‑1 (MQ=255) aaaTTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTg < 2:739364/149‑1 (MQ=255) cGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAAGAAAGGTAAATTACCCCGCGAGAGGGAAGTTACATTTCTCATTATCTCTGGTAAc > 1:78959/1‑150 (MQ=255) tttACCTTTCAGGGAT‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGgag < 2:220939/150‑1 (MQ=255) tACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGTGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGAt < 1:336222/150‑1 (MQ=255) tACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGAt > 1:440771/1‑150 (MQ=255) aCCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAATAAAGTTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAGGTTCCCTTTATCTTTAAATATGGTAACTGGAGATa > 2:182199/1‑150 (MQ=255) aCCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATa > 1:348679/1‑150 (MQ=255) ccTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATaa > 2:94964/1‑150 (MQ=255) tttCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAAtt < 1:415659/150‑1 (MQ=255) gggAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAg < 2:431314/150‑1 (MQ=255) ggAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCACGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGTTAACTGGAGATAATTTTTAGc > 1:45349/1‑150 (MQ=255) gag‑aAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCa > 1:624650/1‑150 (MQ=255) ag‑aAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCAt > 2:341109/1‑150 (MQ=255) ag‑aAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCAt > 2:58608/1‑150 (MQ=255) taaaaaaTCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGAGTGACATAGTTAGCTCCAATTTCAGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATa < 1:795307/149‑1 (MQ=255) aaaaTCCATTGAGAAAGCATTGAGAGATTCTATTGACTTAGTTAGCTCAAATTTCCGTAAGGA‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAgg < 1:353945/150‑1 (MQ=255) ccATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTTTCATAGTTTGCTCCAATTTCCGTAATGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTACCTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTTGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATa < 2:129083/150‑1 (MQ=255) aTTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTATGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAAc > 1:1143592/1‑150 (MQ=255) ttGAGAACTCATTGATAGATTCGATTGACAAAGTTATCTACAATTAACGTAAGGC‑AAAAAAAACGACAGCTAACTTACCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTATCATAAGTGCATAACt < 1:962626/150‑1 (MQ=255) tGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCCAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTTGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTg > 2:1241952/1‑150 (MQ=255) agaACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCt > 1:284837/1‑150 (MQ=255) agaACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCt < 1:1279188/150‑1 (MQ=255) gaACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTACCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTa > 1:485584/1‑150 (MQ=255) aaCGCATTTAGAGATTCGATTTACATAGTTACCTCCATTTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTaa < 1:1260082/150‑1 (MQ=255) aCGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATACCTGCTAAt > 1:1076649/1‑150 (MQ=255) cGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTTCCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtg > 2:123965/1‑150 (MQ=255) cGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtg < 1:688447/150‑1 (MQ=255) gCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtgt < 2:531947/150‑1 (MQ=255) cATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAtgtg > 2:682663/1‑150 (MQ=255) aTTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGa > 1:472161/1‑150 (MQ=255) ttGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGAt < 1:279736/150‑1 (MQ=255) tGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACATCCCCCGTGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATc > 2:76913/1‑150 (MQ=255) agaTTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTTCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTaa < 1:21643/150‑1 (MQ=255) agaTTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTaa < 2:856248/150‑1 (MQ=255) aTTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATc > 1:707532/1‑150 (MQ=255) tGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAgtgt < 1:56150/150‑1 (MQ=255) tAGCTCCAATTTCCGTAAGGCAAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCg < 1:394684/150‑1 (MQ=255) cTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTAtt > 1:952986/1‑150 (MQ=255) cTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTAtt < 1:341109/150‑1 (MQ=255) tCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGTGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTg < 2:299757/150‑1 (MQ=255) tCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTg < 2:608101/150‑1 (MQ=255) ccAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGt < 2:711695/150‑1 (MQ=255) ccAATTTCCGTAAGGC‑‑‑AAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCa > 1:314323/1‑150 (MQ=255) cAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTc < 1:410154/150‑1 (MQ=255) aaTTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCa > 1:638563/1‑150 (MQ=255) aaTTTCCGTAAGGA‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCa < 1:955384/150‑1 (MQ=255) ttCCGTAAGGC‑ATAACATATGATCGGTTAATTCCCCCGCGAGATGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGGAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaat < 1:103348/150‑1 (MQ=255) ttCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCACGCGAGATGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaat < 2:697900/150‑1 (MQ=255) tAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAttt < 2:952036/150‑1 (MQ=255) tAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAttt < 1:1194286/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGc < 2:726454/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGc < 2:78959/150‑1 (MQ=255) aaaaaGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAg < 2:754638/150‑1 (MQ=255) atgagaaagGTAACTTCCCTCTTGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGa > 2:168822/4‑150 (MQ=39) aagaaagGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAg < 1:614071/150‑1 (MQ=255) aagaaagGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAg > 1:951619/1‑150 (MQ=255) aagGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTg > 1:240084/1‑150 (MQ=255) 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aaCTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTAc > 2:1288232/1‑150 (MQ=255) aCTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTAct > 2:904298/1‑150 (MQ=255) cTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTActc > 2:1205531/1‑150 (MQ=255) ttCCCTCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTActct < 1:821346/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTcacac < 2:166861/150‑1 (MQ=255) | CCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAG‑AAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACAC > NC_000913/2900177‑2900471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |