| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,046,782 | G→T | 6.1% | intergenic (‑180/‑184) | yihG ← / → polA | inner membrane protein, inner membrane acyltransferase/5' to 3' DNA polymerase and 3' to 5'/5' to 3' exonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,046,782 | 0 | G | T | 6.1% | 320.8 / 8.2 | 114 | intergenic (‑180/‑184) | yihG/polA | inner membrane protein, inner membrane acyltransferase/5' to 3' DNA polymerase and 3' to 5'/5' to 3' exonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/54); new base T (2/5); total (55/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.24e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GATTTTAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATCC > NC_000913/4046633‑4046931 | taTTTTAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTg < 2:397648/149‑1 (MQ=255)gATTTTAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTg < 1:1101725/150‑1 (MQ=255) tttttAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGt < 2:248504/149‑1 (MQ=255) ttttAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTa < 2:295794/150‑1 (MQ=255) tAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATTAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTaaaa < 2:192631/150‑1 (MQ=255) tcAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAg < 1:886344/149‑1 (MQ=255) gCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGTGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAATAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTATAAAg < 2:1090537/150‑1 (MQ=255) aGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCa > 2:334645/1‑150 (MQ=255) taaaaCGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCAt < 1:744643/149‑1 (MQ=255) aaaaCGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTAAATTATTAGGTATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAAAAAAGAAAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGAATg > 2:1176113/1‑150 (MQ=255) aaCGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGat < 2:721123/150‑1 (MQ=255) aCGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTTTTTACAGCATGatg < 2:1004979/150‑2 (MQ=255) aCGAACCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGata < 2:348156/150‑1 (MQ=255) gACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGataat > 1:195555/1‑150 (MQ=255) caCCCAAATAACGTATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCCTTATCTCAATTAAAAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACACAGACAAACA‑TCATGCTTTTTACAGCATGatgtt < 1:185947/149‑4 (MQ=255) cccAAATAACTGATTATCCTTAATGAGAAAAATAATTCATATCTATACACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTTTTTACAGCATGatgtttg < 2:622664/150‑6 (MQ=255) cccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTTTTTACAGCATGatgtttg < 2:1314939/150‑6 (MQ=255) cccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGAtaat‑aa > 1:371842/1‑150 (MQ=255) ccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTATAAAAAATCGCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑aaa < 2:826168/150‑1 (MQ=255) aaaTAACTGATGATCCTTAATGAGAATAATAATTCATCTATAACCACATTAGAAAAAATCACATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTATAACTGCAGGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAAtt < 1:201097/150‑1 (MQ=255) aaaTAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAAtt > 2:1042058/1‑150 (MQ=255) aaTAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTa < 2:113725/150‑1 (MQ=255) aaCGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTaaaa > 2:744475/1‑150 (MQ=255) aaCGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTA‑TTTTAAAAGGAAGTAAAACAAATGCAAACATTAATGC‑GTAAAAAGGATGATAATAAAATTaaaa > 1:467796/1‑150 (MQ=255) cGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGc < 2:265747/150‑1 (MQ=255) ggATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCg > 1:1042339/1‑150 (MQ=255) ggATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCg > 2:649791/1‑150 (MQ=255) gatCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGt > 2:882500/1‑150 (MQ=255) atCCTTAAGGAGTAAAATAATTCATATCTATCCAAATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACATACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTa < 1:827348/150‑1 (MQ=255) tCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTaa > 2:44841/1‑150 (MQ=255) ccTTAAGTATAAAAATAATTATTATCTATCAACATTAGAAAAAATACCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTaaa < 1:828053/150‑1 (MQ=255) cTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTTTTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATATT‑AAATTAAAAGCGATGTAaat > 2:482029/1‑150 (MQ=255) cTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAATAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAaat > 2:122343/1‑150 (MQ=255) cTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAaat < 1:451651/150‑1 (MQ=255) attAAGGAGAATAATAATTCATATCTATCCAAATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGTATTGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAaat < 1:15005/149‑1 (MQ=255) tAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATAATTAGGGATTGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCTTGCTGTAAAAAGCATGATTAT‑AAATTAAAAGCGATGTAaataa > 2:1075356/1‑150 (MQ=255) agaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTAt < 2:961013/150‑1 (MQ=255) gaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCTATATCTCAATTATTATGTATGGATTTATTTTTAATTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATg < 1:668748/150‑1 (MQ=255) gaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATg > 2:479157/1‑150 (MQ=255) gaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATg > 1:273702/1‑150 (MQ=255) aataatTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGcaca > 1:567716/1‑150 (MQ=255) aatTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACaaat > 1:43523/1‑149 (MQ=255) tatctatcCACATTAGAAAAACTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATATTTTATGCACAAAGTTATcc < 2:1116429/150‑1 (MQ=255) tatctatcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATcc < 1:406116/150‑1 (MQ=255) tatctatcAACATTAGAAAAAATCACATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATTCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATcc < 2:1121614/150‑1 (MQ=255) atctatcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCca > 1:205218/1‑150 (MQ=255) tctatcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCcac < 2:195555/150‑1 (MQ=255) tatcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCcacaa > 2:294037/1‑149 (MQ=255) tatcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACAt > 2:963078/1‑150 (MQ=255) cacaTTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACg > 2:702801/1‑150 (MQ=255) cacaTTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACg > 2:1186572/1‑150 (MQ=255) caTTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGAt > 2:591846/1‑150 (MQ=255) tAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTa < 1:340391/134‑1 (MQ=255) aaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgag < 2:520173/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgag < 1:633831/150‑1 (MQ=255) aaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgagc < 1:1084007/150‑1 (MQ=255) aaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgagcg > 2:151430/1‑150 (MQ=255) aTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TAATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCCCATGACGATTTGAGAGCGAt > 2:352796/1‑150 (MQ=255) aTCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCagaaga > 2:280379/1‑150 (MQ=255) ctcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATc > 2:887747/1‑150 (MQ=255) tcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCt < 1:967055/150‑1 (MQ=255) tcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCt < 1:629518/150‑1 (MQ=255) cAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTa > 2:1221055/1‑150 (MQ=255) aaTTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTAc < 1:284761/150‑1 (MQ=255) attattAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACa < 1:891160/150‑1 (MQ=255) tgatTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCAc < 1:649791/149‑1 (MQ=255) ggatTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCAc > 1:345200/1‑150 (MQ=255) gatTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGCCAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATATATGCACAAAGTGATCCACATGACGATTTGCGAGCGCTCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACg > 2:205364/1‑150 (MQ=255) tatttTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGaaaa > 1:397748/1‑150 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc < 1:711944/150‑1 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc < 2:482937/150‑1 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc < 2:751640/150‑1 (MQ=255) aaCTGCATGAAAAACAAAGACAAAAA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTATAAGCGATGTAAATATTTTATGCAAAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAATAGATTTTCACGAAAAGCGGTGa < 1:787335/150‑1 (MQ=255) cTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGAGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCAACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaa > 1:571038/1‑150 (MQ=255) tGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaaa > 2:1133248/1‑150 (MQ=255) ggCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAAATAAAAGCGATGTAAATAATATATGCACAACGTTATCCACATGACGAATTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaaa > 1:492551/2‑150 (MQ=255) gCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaaaa > 2:663929/1‑150 (MQ=255) taaaaaCAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCa < 1:629425/149‑1 (MQ=255) gAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCa > 1:1096525/1‑150 (MQ=255) gAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCAACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAAATCa > 2:37810/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt > 2:789806/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt > 2:1218057/1‑150 (MQ=255) aaCAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGATGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGtt > 2:857926/1‑150 (MQ=255) aGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCAt < 2:108152/150‑1 (MQ=255) aGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGAAGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCAt < 2:104368/150‑1 (MQ=255) aCAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATcc < 1:455483/150‑1 (MQ=255) aCAAACA‑TCAAGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATATATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGACGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATcc < 2:951587/150‑1 (MQ=255) cAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCct > 1:10911/1‑150 (MQ=255) aCA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtc < 1:871624/150‑1 (MQ=255) ca‑tcatGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtct < 1:924280/150‑1 (MQ=255) ca‑tcatGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtct < 1:397515/150‑1 (MQ=255) a‑tcatGCTTTTTACAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtctg > 1:401606/1‑150 (MQ=255) tcatGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtctgt > 1:398690/1‑150 (MQ=255) atGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATTACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTgg < 2:354595/150‑1 (MQ=255) atGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTgg < 1:1113772/150‑1 (MQ=255) atGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTgg < 1:334645/150‑1 (MQ=255) tGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGc < 1:1186572/150‑1 (MQ=255) tGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGc < 1:702801/150‑1 (MQ=255) cTGTAAAAAGTATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAATTTATCCAGTTGACTATTTGCTAGCGATCCAGAATATCTACTAAATATTTTCACTAAAAGCGGGGTAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGTCAt < 1:704635/150‑1 (MQ=255) gTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATcc < 2:516413/150‑1 (MQ=255) | GATTTTAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACA‑TCATGCTGTAAAAAGCATGATAAT‑AAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATCC > NC_000913/4046633‑4046931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |