| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,725,832 | G→T | 8.4% | intergenic (‑86/+237) | kgtP ← / ← rrfG | alpha‑ketoglutarate transporter/5S ribosomal RNA of rrnG operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,725,832 | 0 | G | T | 8.4% | 524.7 / 7.0 | 164 | intergenic (‑86/+237) | kgtP/rrfG | alpha‑ketoglutarate transporter/5S ribosomal RNA of rrnG operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (60/85); new base T (16/3); total (76/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AAATGCGGCGACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTGGGA > NC_000913/2725683‑2725981 | aaaTGCGGCGACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATAAATtttttg > 2:1933117/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGCGACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGc < 1:952613/150‑1 (MQ=255) gcgACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCa < 1:1248638/150‑1 (MQ=255) gacgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTTTAAAGGAAATATTATACATTTGTTTCATATCAtt > 1:2652756/1‑150 (MQ=255) gaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATg < 1:1894965/150‑1 (MQ=255) aTCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGCAATATTATAAATTTTTTTCATATCATTATTCAAc > 2:804772/1‑150 (MQ=255) aTCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAAAATTATACATTTGTTGCATATCATTATGAAAc > 2:804715/1‑150 (MQ=255) tCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTTTTAATGAAAAATTATACAATTGTTGCATATAAGTATTCAAcc > 1:1351158/1‑150 (MQ=255) tactTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTaa < 2:2583281/150‑1 (MQ=255) ttGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAAAATTATACATTTGTTTCAAATAAATATGCAAACTTAAACa > 2:619455/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATAAATTTGTTGCATATAATTATGCaaccataaccatt > 2:1428239/1‑149 (MQ=255) aGTTTGCTGTCTGCCGATACAGTACTAACACCCAAGCCAATATCTCTCCAGCCGTAATCCGATGCAATTGTCGGTCGAATTAGATTATATATTTTGTAAACGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAAt < 2:1258897/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATAATATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttat > 2:1727869/1‑149 (MQ=255) tGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATAAATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCAAGAATttag > 2:1066236/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCAAATCATTATGCAAACATAACCATGAATttagtt > 2:2279399/1‑150 (MQ=255) tCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAAAAATATAAAATTTTTGCATATAAATATTCAACCATAAACATGAAATTAGTTAGc > 2:1033763/1‑150 (MQ=255) tCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTTTGTTAAGGGAATATTATTAATTTGTTGCCTATCATTTTGCCACCGTAAACATGAATGTTGTTTGc > 1:79485/1‑150 (MQ=255) cTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCa < 1:278179/150‑1 (MQ=255) cGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCGGTTTTTTATTTTTTTTTTTAATGAAAAATTATAAAATTTTTTGATATAAATATTGAAACATAAAAAAGAAATTAGTTAGAA‑GGaa > 1:729468/1‑150 (MQ=255) tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAAt < 1:2462023/150‑1 (MQ=255) tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAAt < 1:2412274/150‑1 (MQ=255) aCAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATg < 1:618309/150‑1 (MQ=255) aCAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATg < 1:926801/150‑1 (MQ=255) tttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTATCA‑GGAAAATGGTTATTg < 1:1025429/150‑1 (MQ=255) tttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTg < 1:1025301/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTga < 2:1775793/150‑1 (MQ=255) aGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTgagga < 2:2660548/150‑1 (MQ=255) gccatgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTgaggag < 2:2133576/150‑1 (MQ=255) gccatgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTAATGGAAAAATATAAAATTTTTTGATATCAATTTGAAAACAAAAACAATAAATTTGTTATCA‑GGAAAATTGTttttttgggg > 1:2134539/1‑144 (MQ=255) gccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTaa < 2:1481325/150‑1 (MQ=255) ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAg > 2:2681133/1‑150 (MQ=255) ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAg < 2:409185/150‑1 (MQ=255) catTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAACATAACCATGAATTTATTTATCA‑GGAAAATGGTTATTTAGGAGCTTAAgg > 2:1936093/1‑150 (MQ=255) atTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGa < 1:1825701/150‑1 (MQ=255) ttATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGAt > 2:697202/1‑150 (MQ=255) tATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATa < 2:851802/150‑1 (MQ=255) tctcCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGTTAAAtt > 2:1070339/1‑150 (MQ=255) tcCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTc < 1:735025/150‑1 (MQ=255) tcCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTc < 2:1065640/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTg < 1:1960059/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTg < 1:2230800/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTg < 1:2733351/150‑1 (MQ=255) cGTAATCCGTTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAATGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAATTGGTTTTTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTaa < 1:2300873/150‑1 (MQ=255) cGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTaa < 2:812106/150‑1 (MQ=255) gTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAag < 2:1651197/150‑1 (MQ=255) aaTCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAagga < 1:149205/150‑1 (MQ=255) aaTCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAagga < 1:2257127/150‑1 (MQ=255) tCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATAAATTTTTTGCATATCATTATGCAAACTTAAACAAGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATTGGTATTTTGGAGCTTAATGATAAATTTGTGGTAaggagg > 2:58707/1‑150 (MQ=255) cGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATAAATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTTAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGac > 2:2735392/1‑150 (MQ=255) gCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGt < 1:1471082/150‑1 (MQ=255) ttttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTAt < 2:1957880/150‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAATGCTAAATTTATGGTAAGGAGGACACGTATgg > 2:1613132/1‑150 (MQ=255) gtcggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGTAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTGAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGaa < 2:2033646/150‑1 (MQ=255) gtcggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGaa < 2:132473/150‑1 (MQ=255) gtcggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGaa < 2:1351158/150‑1 (MQ=255) gtcggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGaa < 2:1511622/150‑1 (MQ=255) gtcggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCATAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGaa < 2:885636/150‑1 (MQ=255) cggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGt < 1:91365/150‑1 (MQ=255) cggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGt < 1:1993842/150‑1 (MQ=255) cggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGt < 1:1050997/150‑1 (MQ=255) cggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTACGGAAGt < 1:1051198/150‑1 (MQ=255) cggtcgCTTTTGTTAACTTTTTTTGAACAGGAAATATTATACATTTGTTGCATCTCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGt < 2:1670022/150‑1 (MQ=255) ggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTg < 1:259386/150‑1 (MQ=255) ggtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTg < 1:1610161/150‑1 (MQ=255) gtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTTTAAAGGAAAAATTATAAAATTTTTGCATATAAATATGGAACCATAACCATTAAATTAGTTATCA‑GGAAAATTTGTATTTAGGAGCTTAAGGTTAAATTTATGGTAAGGAGGACAAGGATGGTAGttg > 2:523506/1‑148 (MQ=255) gtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTgg < 1:485512/150‑1 (MQ=255) gtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTgg < 2:412335/150‑1 (MQ=255) gtcgCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTgg < 1:1780029/150‑1 (MQ=255) ttttGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCTAg > 1:326382/1‑150 (MQ=255) gTTTATTTTTTTTTTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCAAATCATTATGAAACATAAACCAAGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTATGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCACGTTgg > 2:2222704/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGaa > 1:1372636/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGaa < 2:2524628/150‑1 (MQ=255) ttttttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACAATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGCGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACAAGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAg > 1:313359/1‑150 (MQ=255) tttttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGc < 2:2130463/150‑1 (MQ=255) atattttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGc < 1:1640577/147‑1 (MQ=255) tttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCg > 1:1154674/1‑150 (MQ=255) tttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCg > 1:1154319/1‑150 (MQ=255) ttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTCAGGATAAAATTCTGGTAAGGATGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGt > 2:1636462/1‑150 (MQ=255) ttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTGATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGt > 1:180489/1‑150 (MQ=255) gTAAATGTAATTATATTCATTTTTTTCATTTCATTATTCAAACTTAACCATGTATTTAGTTAGCATGTAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATc < 1:619455/150‑1 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATcc < 2:889966/150‑1 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATcc < 1:270831/150‑1 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATcc < 2:1126765/150‑1 (MQ=255) tAAAGGAAGTATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAATATGGTTATTGAGGAGGTTAAGGATATATTTGTGGTGAGGTGGAGACGTTTGGTAGTGGGGAGGTTGGGGTAGCCGTGTCCg > 1:2361011/1‑150 (MQ=255) aaGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGtt > 2:1569199/1‑150 (MQ=255) aGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTg < 2:214902/150‑1 (MQ=255) ggAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGc > 2:310984/1‑150 (MQ=255) ggAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGc > 1:2548392/1‑150 (MQ=255) ggAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGc > 2:662737/1‑150 (MQ=255) gAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCt < 2:713425/150‑1 (MQ=255) aaaTATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGGTGGGGACGCCGTATCCGTTGCTg > 2:4262/1‑150 (MQ=255) atatTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGaa > 1:1925522/1‑150 (MQ=255) tataCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTg > 1:66295/1‑150 (MQ=255) tataCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTg > 1:725147/1‑150 (MQ=255) ataCATTTGGTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTgg < 2:1556965/150‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTgg < 2:110661/150‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTgg > 2:2748426/1‑150 (MQ=255) gCATATCCTTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTGGGa < 1:367688/150‑1 (MQ=255) gCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTGGGa < 2:555536/150‑1 (MQ=255) gCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTGGGa < 2:2320064/150‑1 (MQ=255) | AAATGCGGCGACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCA‑GGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATGGAAGTGGGCAAGTTGGGGAAGCCGTATCCGTTGCTGAATCTGGCATATGTGGGA > NC_000913/2725683‑2725981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |