| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,620,220 | 0 | A | G | 9.0% | 310.9 / 17.0 | 111 | intergenic (‑60/+26) | uraA/upp | uracil permease/uracil phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/49); new base G (5/5); total (57/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACT‑C‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTCCAGC > NC_000913/2620071‑2620369 | aCCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACT‑C‑AAAAAAAAGCCGACTCTTaa > 1:410193/1‑150 (MQ=255) tGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACT‑C‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCt < 1:1220920/150‑1 (MQ=255) tGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCACGATATCCCGGCGCGTCATAGTCTTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACT‑C‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAGAGTCGGCt < 1:609418/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |