| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,799,389 | 0 | T | A | 5.1% | 305.2 / 4.3 | 114 | S76T (TCG→ACG) | alaE | alanine exporter, alanine‑inducible, stress‑responsive |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/58); new base A (3/3); total (53/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.21e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ACATGTGTATTGAAGTTTTCCTCTCCGGAATGAGCTTCGAACAGTCTTTTTATTCCAGATTGGTAGCGATTCCGGTGAACATCTTAATTGCATGGCCATACGGTATGTACCGTGATCTGTTTATGCGCGCGGCACGCAAAGTTAGCCCGTCGGGCTGGAT‑AAAAAATCTGGCGGATATCCTGGCTTATGTGACGTTCCAGTCACCGGTGTATGTGGCGATCTTGTTAGTGGTGGGCGCAGACTGGCATCAGATTATGGCGGCGGTCAGTTCAAACATCGTTGTTTCGATGTTGATGG > NC_000913/2799240‑2799536 | aCATGTGTATTGAAGTTTTCCTCTCCGGAATGAGCTTCGAACAGTCTTTTTATTCCAGATTGGTAGCGATTCCGGTGAACATCTTAATTGCATGGCCATACGGTATGTACCGTGATCTGTTTATGCGCGCGGCACGCAAAGTTAGCCCGt > 1:836933/1‑150 (MQ=255) tgtgTATTGAAGTTTTCCTCTCCGGAATGAGCTTCGAACAGTCTTTTTATTCCAGATTGGTAGCGATTCCGGTGAACATCTTAATTGCATGGCCATACGGTATGTACCGTGATCTGTTTATGCGCGCGGCACGCAAAGTTAGCCCGTCgg > 1:1655768/1‑150 (MQ=255) tgtATTGAAGTTTTCCTCTCCGGAATGAGCTTCGAACAGTCTTTTTATTCCAGATTGGTAGCGATTCCGGTGAACATCTTAATTGCATGGCCATACGGTATGTACCGTGATCTGTTTATGCGCGCGGCACGCAAAGTTAGCCCGTCGGGc > 2:1534082/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |