| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,311,831 | C→T | 7.4% | intergenic (+23/+17) | tonB → / ← yciA | membrane spanning protein in TonB‑ExbB‑ExbD transport complex/acyl‑CoA esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,311,831 | 0 | C | T | 7.4% | 314.2 / 8.1 | 108 | intergenic (+23/+17) | tonB/yciA | membrane spanning protein in TonB‑ExbB‑ExbD transport complex/acyl‑CoA esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/47); new base T (5/3); total (58/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAAT > NC_000913/1311682‑1311979 | tGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCATCCGAc > 2:394880/1‑150 (MQ=255) aCATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAg < 1:1067276/150‑1 (MQ=255) cATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAgg > 1:517601/1‑150 (MQ=255) gTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGCGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATGCTGTTTAAAATTAACGGCCCCACCGAAATTCAGTAAGCTGCAAGTC‑AAAATCCTCCGACCGGAGGCta > 1:98077/1‑149 (MQ=255) tttGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAATGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCttt > 2:472170/1‑150 (MQ=255) tttGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCttt > 2:516244/1‑150 (MQ=255) tGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTACCGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTg < 2:8328/150‑1 (MQ=255) tGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTg < 2:1703045/150‑1 (MQ=255) gAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGa > 1:537929/1‑150 (MQ=255) cgCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCTGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGAc < 1:312318/149‑1 (MQ=255) gCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACt > 1:1384258/1‑150 (MQ=255) ggagAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAATCCTCCGACCGTAGGCTTTTGACTATTAca > 1:1570661/4‑149 (MQ=255) ggTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACt > 2:1391231/1‑150 (MQ=255) ggTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACt > 2:378127/1‑150 (MQ=255) gAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTAATACTCaa > 2:1114652/1‑150 (MQ=255) gAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTAAGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTATAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCAGACAGGAGGCATTTGACTATGACTCaa > 1:102409/1‑150 (MQ=255) aaaaTGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACa < 2:1372855/150‑1 (MQ=255) atgcgatgcgCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGt < 1:1193391/150‑1 (MQ=255) ggattcgCAGATGGCGTTATGAGGCGGGTAAGCCAGGGAGTGTGATTGTGGTGAATATCCTGGTTATAATTCACGGGACCTCCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGATCGGAGGCTTTTGACTATTACTCATCAGGTAAg < 2:436267/149‑1 (MQ=255) cAGATGGCGTTATGCGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAACTTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAg < 2:243849/150‑1 (MQ=255) aGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAgg < 2:1092992/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACGGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGGCTCCGTCCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGttt < 1:1237110/150‑1 (MQ=255) gCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTc > 1:1695949/1‑150 (MQ=255) cGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTcc < 1:1581972/150‑1 (MQ=255) ttATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCtt < 2:142902/150‑1 (MQ=255) aTGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCa < 2:553896/150‑1 (MQ=255) tGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAg < 1:396772/150‑1 (MQ=255) gAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCCCCGAAATACAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTGCAgg > 2:1592636/1‑150 (MQ=255) gAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAgg < 1:1303317/150‑1 (MQ=255) aGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGa < 1:1179394/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTTAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGa > 2:944233/1‑150 (MQ=255) ccGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGT‑GTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCATCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCa > 2:592549/1‑150 (MQ=255) gggTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCATGATCaa > 1:848318/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACcgc < 1:583350/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGAc < 2:1607438/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGAc > 1:1059232/1‑150 (MQ=255) ccAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCACCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCATCAGGATCAACCGCGAc > 1:1655656/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACa > 2:1022941/1‑150 (MQ=255) gCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATAc < 1:1074664/150‑1 (MQ=255) cAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTTACTTTTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTGCAGGATCAACCGCGACATACt > 1:1310917/1‑150 (MQ=255) cAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACt > 1:1317994/1‑150 (MQ=255) gTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AACAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTa < 1:153527/150‑1 (MQ=255) gTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCCACCGCGACATACTTa > 1:1197863/1‑150 (MQ=255) ggATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAaat < 1:371519/150‑1 (MQ=255) gATTGTGGGGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAACTC‑AAAAGCCTCCGCCCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAaata < 2:298150/150‑1 (MQ=255) aTTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAaataa < 1:180372/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATg < 2:1450244/150‑1 (MQ=255) ggtgAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCtt < 1:857518/150‑1 (MQ=255) tcatttttAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCt < 2:944269/145‑1 (MQ=255) tcatGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAAAAATGCTTCTGTCGCt > 2:477632/4‑150 (MQ=255) ccTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCtt > 1:1412133/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCtt < 2:537929/150‑1 (MQ=255) cTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCttt > 2:562094/1‑150 (MQ=255) tGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTta < 2:517601/150‑1 (MQ=255) gTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCtt < 1:980121/105‑1 (MQ=255) gTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTtat > 2:567142/1‑150 (MQ=255) tttAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTtata > 1:1301483/1‑150 (MQ=255) tttAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTtata > 1:541064/1‑150 (MQ=255) ttAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGTAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGCCATACATAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAg > 2:1169262/1‑150 (MQ=255) ttAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAg > 2:597815/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCg < 2:303693/150‑1 (MQ=255) aaaTTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGt > 2:753672/1‑150 (MQ=255) aaTTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTAAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGtt > 2:1474635/1‑150 (MQ=255) aTTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTg > 1:1726024/1‑150 (MQ=255) tAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGcc < 1:1533726/150‑1 (MQ=255) ggCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGCCATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAAt > 2:798093/1‑150 (MQ=255) gCACCACCGAAATTCAGTAATCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGTCCGGAGGCTTTTGAATATTACTCAACAGGTAATGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAAtt < 1:134380/150‑1 (MQ=255) gCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAAtt < 1:735853/150‑1 (MQ=255) caccGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGtt < 1:1501506/150‑1 (MQ=255) aaccGAAATTCAGTAACCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGtt < 2:307642/149‑1 (MQ=255) ccGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCa < 1:375402/150‑1 (MQ=255) aaaTTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGGTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGAc > 2:1373361/1‑150 (MQ=255) aaTTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGGTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACg < 2:754218/150‑1 (MQ=255) ttCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCt < 1:753672/150‑1 (MQ=255) ttCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCt < 1:1289690/150‑1 (MQ=255) cAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTAc > 2:1651908/1‑150 (MQ=255) cAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTAc > 2:464620/1‑150 (MQ=255) cAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCGTTTGACTATTACTCCACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACATAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTAc > 1:561667/1‑150 (MQ=255) aGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATCGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACt > 1:61146/1‑150 (MQ=255) aGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACt > 2:1733160/1‑150 (MQ=255) gTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACtt > 1:2635/1‑150 (MQ=255) aaGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGCCCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACCGGTAAGGCGCGCGGTTTTACTTACGGATCAACCGCCACATACTTAAATAAATCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAAGTGGGTCCGACGCTACattt > 2:1331220/1‑150 (MQ=255) aaGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGTAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGAGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACtttt < 1:1114652/150‑1 (MQ=255) aGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGATTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCa > 1:268611/1‑150 (MQ=255) aaaGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCAcc < 2:892963/150‑1 (MQ=255) aaGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCAacc > 1:1320815/1‑150 (MQ=255) aGTC‑AAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCca > 1:1025859/1‑150 (MQ=255) aGTC‑AAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCca > 1:1534915/1‑150 (MQ=255) gTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTACGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCcac < 1:464635/150‑1 (MQ=255) c‑AAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCacac > 2:1073749/1‑150 (MQ=255) c‑AAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGAATATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCCCCCacac > 2:375098/1‑150 (MQ=255) c‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCacac > 2:1386141/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACtt > 2:571455/1‑150 (MQ=255) gCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACGGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGCCATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCATTTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCaa > 1:1543667/1‑150 (MQ=255) tCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAatat < 2:669142/150‑1 (MQ=255) ccGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATAtt < 2:550792/150‑1 (MQ=255) gACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCGTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCTTTGCCCAATTGGTTCAGACACTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTaa > 1:252279/1‑150 (MQ=255) gACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTaa < 2:803842/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAAt < 2:552548/149‑1 (MQ=255) ccGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAAt > 1:552548/1‑149 (MQ=255) | TGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTC‑AAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAAT > NC_000913/1311682‑1311979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |