| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 781369 = | 205 (0.840) | 30 (0.130) +GAAG |
22/270 | NT | 14.8% | noncoding (1/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | = 2521006 | 151 (0.620) | noncoding (76/76 nt) | valU | tRNA‑Val | |||||
GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781497‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTTCG < NC_000913/2521006‑2520858 ||||| GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCACTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGA < 2:696115/150‑1 TACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑CAG‑CGGTGGGTGAATGA‑GGGATCGAAACTCCGACCCACTCATTGTTAGtgcgg > 1:1914160/1‑145 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AG‑GGGTTGGTG‑ATGGCGGGATCGAAACTCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCC > 2:554527/1‑150 CACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AG‑AGGTTGGTG‑ATGAATGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTTTAAGGGAGGTGCTCTCCCA > 2:529563/1‑150 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAAT < 2:2220508/150‑1 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACAGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCACCATGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:855598/1‑150 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTG > 2:2711797/1‑150 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCGTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCtacg > 2:2711782/1‑146 cACCTGCTACCAATGGCTTAAAAGTGAACTGCTCCACCCACTCCGCTACCGACCCGATG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTC < 2:3695920/149‑1 GCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATT > 1:3304738/1‑150 CGACCACTTGATTAAAAGTCAACTGCTCGACCTCCTGTTCTAACGACCCGATG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTA < 2:1376761/150‑1 AATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCGGTGAGTAGTCGGATTAacggg > 2:3579080/1‑145 cgcTTAAAAGTCAACTGCTCCACCCCCTTTGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGA < 2:121287/147‑1 GATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCAGGGAGGAGTCGAATTAAATGGAGAG > 2:2955746/1‑150 ATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTTGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAG > 2:1374276/1‑150 TTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCACCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTT > 1:901485/1‑150 AAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCACCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCA < 2:901485/150‑1 TCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGG > 1:1030884/1‑137 TCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGG < 2:1030884/137‑1 AACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAG > 2:3123865/1‑150 AACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCAT > 2:621945/1‑147 AACTGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCAT < 1:621945/147‑1 TGAGCTACCGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGG < 1:676802/120‑1 TGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTA > 2:1973525/1‑150 TGAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGG > 2:676802/1‑120 GAGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAA < 2:3304738/150‑1 AGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAA < 2:2406897/150‑1 AGCTAACGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAA < 1:3123865/150‑1 CGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTACCAGCTGAGCT < 2:2473132/78‑1 CGACCCGAAG‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTACCAGCTGAGCT > 1:2473132/1‑78 G‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTTCG < 1:3063884/150‑1 ||||| GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781497‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGGGTG‑ATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTTCG < NC_000913/2521006‑2520858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |