| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,828,537 | 0 | A | T | 5.8% | 359.8 / 7.2 | 118 | intergenic (+21/‑84) | srlD/srlM | sorbitol‑6‑phosphate dehydrogenase/sorbitol=responsive srl operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (65/45); new base T (5/2); total (70/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.00e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AAGTACCGCTCAAACGCGGCTGCGATTATCAAGATGTGCTGAATATGCTGCTGTTCTACGCCAGTCCTAAGGCGTCGTACTGCACCGGACAGTCGATCAATGTCACCGGCGGTCAGGTGATGTTCTGATCAACAGCGGAGATCCATTAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTG > NC_000913/2828389‑2828685 | aaGTACCGCTCAAACGCGGCTGCGATTATCAAGATGTGCTGAATATGCTGCTGTTCTACGCCAGTCCTAAGGCGTCGTACTGCACCGGACAGTCGATCAATGTCACCGGCGGTCAGGTGATGTTCTGATCAACAGCGGAGATCCATTAA‑g < 1:417817/150‑1 (MQ=255) accgagcAAACGCGGCTGAGATTATCAAGATGTGCTGAATATGCTTCTGGTCTACGCCAGTCCTAAGGCGTCGTACTGCTCGGGACAGTCGAGCAATGTCACCGGCGGTCAGGTGATGTTCTGATCAACAGCGGAGATCCATTAA‑GGAtc < 2:1590081/144‑1 (MQ=255) aCCGCTCAACCGCGGCTGCGATTATCAAGATGTGCTGAATATGCTGCTGTTCTACGCCAGTCCTAAGGCGTCGTACTGCACCGGACAGTCGATCAATGTCACCGGCGGTCAGTTGATGTTCTGATCAACAGCGGAGATCCATTAA‑GGAtc < 2:896781/150‑1 (MQ=255) 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gaTCCATTAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTa > 2:702261/1‑150 (MQ=255) caTCCAATAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAACGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTa < 1:282312/149‑1 (MQ=255) tCCATTAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAgg < 1:1613649/150‑1 (MQ=255) cATTAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAggcg > 2:713912/1‑150 (MQ=255) cATTAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAggcg > 1:21275/1‑150 (MQ=255) 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aa‑GGTTCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATAGAGGACTTGCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTg < 2:1002757/150‑1 (MQ=255) | AAGTACCGCTCAAACGCGGCTGCGATTATCAAGATGTGCTGAATATGCTGCTGTTCTACGCCAGTCCTAAGGCGTCGTACTGCACCGGACAGTCGATCAATGTCACCGGCGGTCAGGTGATGTTCTGATCAACAGCGGAGATCCATTAA‑GGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTG > NC_000913/2828389‑2828685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |