| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,757,942 | C→A | 7.3% | intergenic (‑115/+75) | yiaY ← / ← selB | L‑threonine dehydrogenase/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,757,942 | 0 | C | A | 7.3% | 374.8 / 12.6 | 135 | intergenic (‑115/+75) | yiaY/selB | L‑threonine dehydrogenase/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (72/52); new base A (8/3); total (80/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTC > NC_000913/3757795‑3758091 | cacaGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCAt < 1:1652457/150‑1 (MQ=255)cacaGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCAt > 2:199567/1‑150 (MQ=255)aacaGAAGGAATAAAGAAAGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTTTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCAt < 1:925888/149‑1 (MQ=255) acaGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCAtt > 1:633512/1‑150 (MQ=255) ggAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACaa > 1:40738/1‑150 (MQ=255) ggAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACaa < 1:574472/150‑1 (MQ=255) ggAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACaa > 1:1580324/1‑150 (MQ=255) ggAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTACTTAAAGTGTAAAAAAGTGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACaa < 1:1742484/150‑1 (MQ=255) gAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAAt > 1:82298/1‑150 (MQ=255) gAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATACATTAA‑ACAAt > 2:155295/1‑150 (MQ=255) aaTAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGAACATTGTATTCATTAA‑ACAAtg > 1:1167157/1‑150 (MQ=255) aaaGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGT‑TTAATGAATACAATGTGc < 2:1445372/150‑1 (MQ=255) aaGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCt > 2:1677867/1‑150 (MQ=255) aGAAAGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTAATGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCTGAATTAATGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTTTATTCATTAA‑ACAATTTGCtt > 2:128536/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCttttttt > 2:581816/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCttttttt > 1:1077179/1‑150 (MQ=255) aaGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCTAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAAt < 1:813140/150‑1 (MQ=255) gCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGAAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGATTTTTTTAAAtta > 2:275608/1‑149 (MQ=255) cTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCa < 1:581656/150‑1 (MQ=255) gCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATa > 2:1465545/1‑150 (MQ=255) aaCACAATCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGTATTTACATTCGATATTATGATCAGTATTATTGATTATAAAAATTAATCTAATAAAAAGATAATTGTATAAATTAT‑TAAATCTGATTTTTTTAAATTCATAAGatt > 1:299429/1‑148 (MQ=255) acacacTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTAATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAAtt > 2:273718/1‑150 (MQ=255) acacacTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTACATACGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAAACTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑AAAATGTCATTTTTTTAAATTAATAATAAtt > 1:637714/1‑150 (MQ=255) acacTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAAtttt > 2:1350122/1‑150 (MQ=255) cacTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTg < 2:624309/150‑1 (MQ=255) aatacttaaaGTGTAAAAAATGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGt < 2:509471/143‑1 (MQ=255) cTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTa < 2:712946/150‑1 (MQ=255) tCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGACAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTAt > 2:1276648/1‑150 (MQ=255) cTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTa > 1:839822/1‑150 (MQ=255) gtAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAatttattt > 2:1708982/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTAtttt < 2:771099/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTAtttt > 1:1019391/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTAtttt > 1:1298104/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTATTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTAtttt > 2:725442/1‑150 (MQ=255) aaaaaaGGTCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTa < 1:1606439/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTaa > 2:1156226/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTaa > 2:790175/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTaa < 1:378562/150‑1 (MQ=255) aaGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAAc < 2:940749/150‑1 (MQ=255) gggcgggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATGTAATAAAAAGCACATTGTATTAATTAA‑ACTATTTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACtt < 2:391590/150‑1 (MQ=255) ggcgggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACtta > 1:705947/1‑150 (MQ=255) gcgggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCAAAAGAATTTTTTATTAATTTATTTTAAAACttaa > 1:1385848/1‑150 (MQ=255) ggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACttaatta > 2:1251526/1‑150 (MQ=255) ggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACttaatta < 1:1503161/150‑1 (MQ=255) gCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCa > 2:1617024/1‑150 (MQ=255) aTTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTAttt > 2:525736/1‑150 (MQ=255) aTTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTAttt < 1:1129233/150‑1 (MQ=255) ttttCATTCGAAAATATGTTTATTATTATTTATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTAtttt < 2:782351/150‑1 (MQ=255) tCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTcc < 2:342387/150‑1 (MQ=255) cATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCg < 1:49640/150‑1 (MQ=255) cATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCg < 2:777098/150‑1 (MQ=255) cATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCg < 2:209663/150‑1 (MQ=255) cATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCg < 2:82298/150‑1 (MQ=255) aTTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCATTATTTTTcagt > 1:488945/1‑147 (MQ=255) aTTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCAAATTGTATTCAATAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCgg > 2:594841/1‑150 (MQ=255) tCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGaa > 2:528606/1‑150 (MQ=255) tCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATAATTTCATTATTTTTCAGGaa > 1:760721/1‑150 (MQ=255) tCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGGGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGaa < 2:1139340/150‑1 (MQ=255) acGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCATTATTTTTACGGaa > 1:760729/2‑150 (MQ=255) cGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCATTATTTTTCCTGaaa > 1:1540373/1‑150 (MQ=255) gAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCTGAaat > 2:1124952/1‑150 (MQ=255) aaaTATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGC‑TTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAaataat < 1:1475167/150‑1 (MQ=255) atGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAaataataat < 1:75085/150‑1 (MQ=255) attattGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCgcgc < 1:622794/150‑1 (MQ=255) gATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCGATaaa > 2:1732768/1‑150 (MQ=255) gATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATaaa > 1:1618526/1‑150 (MQ=255) gATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATaaa > 2:1748428/1‑150 (MQ=255) gATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGAGCAATaaa > 1:903372/1‑150 (MQ=255) aaTTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTAATAATTAA‑ACAATGTGCTTTATATAAATAAATAAGAATTTTGTATTAATTTAAATTAAAAATTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAAAAATAATGCGACGCGCAATaaa > 1:903370/2‑150 (MQ=255) ttATCAAAATTAATCTAAT‑AAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGa < 2:1616861/150‑1 (MQ=255) tATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGa > 2:1140588/1‑150 (MQ=255) tATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGa < 1:595958/150‑1 (MQ=255) aTCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGAt < 2:1580324/150‑1 (MQ=255) cAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCa > 2:636321/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTAATCTAATAAAAAGCACTTTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCa < 2:850020/149‑1 (MQ=255) aaaaaTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCa < 1:523702/149‑1 (MQ=255) aaaaTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATAAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCAt > 2:372857/1‑150 (MQ=255) aaTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCAttt > 1:1733443/1‑150 (MQ=255) aTCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacg > 1:656700/1‑150 (MQ=255) aTCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacg < 1:1029805/150‑1 (MQ=255) tCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacga > 2:1745686/1‑150 (MQ=255) cTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgac > 1:617387/1‑150 (MQ=255) cTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTACCGGAAATAATAATGCTTCGCGCAATAAATCATCATTTCCacgac > 1:1458873/1‑150 (MQ=255) taataaAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGTAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacg > 1:1325268/1‑150 (MQ=255) taaaaaaaGCACATTGT‑TTAATGAATACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacga > 2:1057652/4‑150 (MQ=38) ataaAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTACGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacgac > 2:281534/1‑150 (MQ=255) taaAAAGCACATTTTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGTATTTTGTATTAATTTAATTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacgacg < 1:316744/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGAcgc > 2:1042248/1‑150 (MQ=255) aaaGCACATTGT‑TTAATGAATACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGt > 2:1528825/1‑150 (MQ=255) aaGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTa < 1:1209783/150‑1 (MQ=255) aaGCACATTGT‑TTAATGAATACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTa > 1:703561/1‑150 (MQ=255) aGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTaa > 2:412643/1‑150 (MQ=255) aGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTaa > 2:1029959/1‑150 (MQ=255) gCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCAGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACTAGTaaa > 1:363697/1‑150 (MQ=255) acaTTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGc > 2:406457/1‑150 (MQ=255) gTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATg > 2:719867/1‑150 (MQ=255) aTTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCg > 2:207653/1‑150 (MQ=255) ttCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCgg < 2:1392433/150‑1 (MQ=255) cATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTATTTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTc > 2:131378/1‑150 (MQ=255) cATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTc > 2:723822/1‑150 (MQ=255) | CACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAA‑ACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTC > NC_000913/3757795‑3758091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |