| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 568,280 | C→G | 6.0% | intergenic (+33/‑35) | renD → / → emrE | pseudogene, DLP12 prophage;Phage or Prophage Related/DLP12 prophage; multidrug resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 568,280 | 0 | C | G | 6.0% | 423.5 / 11.6 | 130 | intergenic (+33/‑35) | renD/emrE | pseudogene, DLP12 prophage;Phage or Prophage Related/DLP12 prophage; multidrug resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (61/61); new base G (6/2); total (67/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AGAGAAGAATGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTT > NC_000913/568131‑568429 | agagAAGAATGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACAGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTAc > 2:1261955/1‑150 (MQ=255) gaagaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAAt < 1:456560/150‑1 (MQ=255) aagaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCTCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAAtt < 1:476490/150‑1 (MQ=255) agaaTGGGACGGAACGGTGAGAACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtc < 1:1631683/150‑1 (MQ=255) agaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGACGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGCAGAGTTTAGTT‑CAAACTGTAGTACAAtta > 2:722719/1‑149 (MQ=255) gaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct > 2:1586099/1‑150 (MQ=255) gaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct > 1:1280326/1‑150 (MQ=255) aaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct‑c < 2:542308/150‑1 (MQ=255) atcgcaaggacACGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGGGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct‑ct < 1:1222893/145‑1 (MQ=255) gggAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTcc < 2:730759/150‑1 (MQ=255) gggAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTcc < 1:715643/150‑1 (MQ=255) ggaaggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCTCGATGAAACGGGTATTCATGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACACTGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCa < 1:87406/150‑1 (MQ=255) ggaaggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGTTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCa > 1:271230/1‑150 (MQ=255) gaaggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAg > 1:1382570/1‑150 (MQ=255) aggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGtt < 1:506950/150‑1 (MQ=255) gaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGTAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTg < 1:989209/150‑1 (MQ=255) gaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTg > 2:1006889/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGa < 2:760999/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGTGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAAc < 2:1497990/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACa < 2:1537677/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTAGATAAAAGAACATCAATGGGACCAGAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGaagc > 2:1824668/1‑148 (MQ=255) gTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAg > 1:827435/1‑150 (MQ=255) tGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTAGTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACCCAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑AAAACTGTAGTACAATTAT‑CTCCAGTTTGAACAgg > 1:1582265/1‑150 (MQ=255) ttcaataaTCTGATTTTTAAGGAGTCTAGCCAGAGTGCCGCGATTAAACGTGTATTGTGGGTATATAAAAGAAGATCAATGGGAACACTATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCAAGTTTGAACAGGaa < 2:730805/144‑1 (MQ=255) gCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGaaa > 1:1061934/1‑150 (MQ=255) cGAATCTGATTTTTTAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CATACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTGTGAACAGGAAAGaa > 2:1148696/1‑150 (MQ=255) gAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAat > 2:984011/1‑150 (MQ=255) cTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGTGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGc < 1:459265/150‑1 (MQ=255) cTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGc > 1:1658315/1‑150 (MQ=255) cTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGc < 1:1263957/150‑1 (MQ=255) tGATTTTTAGGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCt > 2:985551/1‑150 (MQ=255) tGATTTTTAAGGAGTGGCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCt < 2:176812/150‑1 (MQ=255) gATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTa < 2:1478636/150‑1 (MQ=255) ttttttAGGAGTGTCGCCAGAGGGCCGAGATGAAACGTGTATTGAGGTAATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATg < 1:703567/150‑1 (MQ=255) tttttAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATg < 1:1284484/150‑1 (MQ=255) tttttAAGGAGTGTCACCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATg > 1:391228/1‑150 (MQ=255) ttttAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGAATATAAAGGAAC‑TGAATGGGAACCCCAAGGAGCAACCCGGGAGTTGAATTAAAAAATGATGTACATTAAT‑ATCAAGTTTAAAAAGGAAAGAaaatcttatta > 2:1093663/1‑143 (MQ=255) gAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTTTTGAGTGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTta < 1:1777031/150‑1 (MQ=255) aGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTtat > 1:1556792/1‑150 (MQ=255) cGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTCGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTa < 1:862176/150‑1 (MQ=255) gCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTAt > 2:836494/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTAt > 2:635736/1‑150 (MQ=255) agTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTtgg < 2:1471022/150‑1 (MQ=255) gCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTtggtgg > 1:1252084/1‑150 (MQ=255) cgcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGgtggtg < 2:1382570/150‑1 (MQ=255) gcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGc < 1:1006889/150‑1 (MQ=255) gcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGc > 1:1255150/1‑150 (MQ=255) gAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATAc < 2:873693/150‑1 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGc > 1:1412814/1‑150 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGc > 2:787864/1‑150 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGT‑GTGCAATACTTGCa < 2:1768401/150‑1 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAAATCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGc < 1:879611/150‑1 (MQ=255) gAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCa > 2:591920/1‑150 (MQ=255) gAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGAAGAGGtaa > 2:221484/1‑148 (MQ=255) gtgTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCAtt < 1:48887/148‑1 (MQ=255) ggTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTg > 1:242954/1‑150 (MQ=255) gTATATAAAAGAACATAAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTgg < 1:926001/150‑1 (MQ=255) ttaAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACa > 1:702295/2‑150 (MQ=255) ataAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACa > 1:925939/1‑150 (MQ=255) taAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACaa < 1:462561/150‑1 (MQ=255) aaaGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAAcc > 2:286950/1‑150 (MQ=255) cATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAAtt > 1:642839/1‑149 (MQ=255) aTCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGa > 1:1614893/1‑150 (MQ=255) cAATGGTAACACATTGATGAAACAGGTGATTTTTGTT‑CAAACTGTAGTACAATTGT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATAGGCTATGAACCCTTTTATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGTTCATTGGTACAACCTTAATGAAg < 1:596935/150‑1 (MQ=255) aaTGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGt < 2:866081/150‑1 (MQ=255) tGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAAACTTAATGAAGttt > 2:796684/1‑150 (MQ=255) tGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGATATGAAACCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTAGCAGAGATCATTGGTACAACCTTAATGAAtttt > 1:242572/1‑150 (MQ=255) ggAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTc < 1:1261955/150‑1 (MQ=255) aaTGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATTCTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAggg > 2:919865/1‑149 (MQ=255) tgatgaAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTGCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCAATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGttt < 2:1393499/150‑1 (MQ=255) gatgaAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGtttt > 1:319544/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTacac > 2:545827/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACg < 2:1657991/150‑1 (MQ=255) gTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTAt > 2:242924/1‑150 (MQ=255) tagttgagtt‑CAATCTGTAGTACTATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGATAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTGATTGGTACATCCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATgg < 1:956812/149‑1 (MQ=255) tagttgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATgg < 2:694464/149‑1 (MQ=255) gagttgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATgg > 1:1506047/1‑150 (MQ=255) gttgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGcc > 2:1531345/1‑150 (MQ=255) ttgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCa > 1:352350/1‑150 (MQ=255) tcctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACATTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCa > 1:1621522/5‑150 (MQ=38) tgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCAt > 2:837662/1‑150 (MQ=255) cctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGATTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACAAGGTTATGGCCaa > 1:1223289/4‑149 (MQ=255) ctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATc > 1:1013954/3‑150 (MQ=38) ctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGACATc > 1:1149866/3‑150 (MQ=38) gtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTg > 1:808669/1‑150 (MQ=255) gtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAAAATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAAAGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACTCTTATGGCCATCTg > 2:1447126/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTgg > 2:841864/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATAAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTgg < 2:1043879/150‑1 (MQ=255) aCTGTAGTACAATTCT‑CTCCATTTTGAACAGGAAAGAATATGATATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTa < 2:449378/150‑1 (MQ=255) cTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTAc < 2:1026337/150‑1 (MQ=255) cTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTAc < 1:836494/150‑1 (MQ=255) gtagtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACaa < 2:1061934/150‑1 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCATTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta < 1:107747/150‑1 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta > 1:1572842/1‑150 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta > 1:1680725/1‑150 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACAGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta > 2:988326/1‑150 (MQ=255) aCAATTCT‑CTCCAGTTTGTACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGTTTATGGCCATCTGTTGGTACAattatt < 2:1653858/150‑1 (MQ=255) aCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAATGAATATGCTATGATCCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAattatt < 2:1690685/150‑1 (MQ=255) cAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTAttt < 1:635736/150‑1 (MQ=255) cAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTAttt > 1:99985/1‑150 (MQ=255) | AGAGAAGAATGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTT > NC_000913/568131‑568429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |