| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 568,285 | C→G | 6.2% | intergenic (+38/‑30) | renD → / → emrE | pseudogene, DLP12 prophage;Phage or Prophage Related/DLP12 prophage; multidrug resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 568,285 | 0 | C | G | 6.2% | 400.1 / 10.7 | 123 | intergenic (+38/‑30) | renD/emrE | pseudogene, DLP12 prophage;Phage or Prophage Related/DLP12 prophage; multidrug resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/57); new base G (6/2); total (64/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
AGAATGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTAT > NC_000913/568136‑568434 | agaaTGGGACGGAACGGTGAGAACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtc < 1:1631683/150‑1 (MQ=255) gaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct > 2:1586099/1‑150 (MQ=255) gaaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct > 1:1280326/1‑150 (MQ=255) aaTGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct‑c < 2:542308/150‑1 (MQ=255) atcgcaaggacACGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGGGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct‑ct < 1:1222893/145‑1 (MQ=255) tGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATtct‑ctc > 2:563869/1‑150 (MQ=255) gggAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTcc < 1:715643/150‑1 (MQ=255) gggAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTcc < 2:730759/150‑1 (MQ=255) ggaaggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCTCGATGAAACGGGTATTCATGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACACTGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCa < 1:87406/150‑1 (MQ=255) gaaggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAg > 1:1382570/1‑150 (MQ=255) aggaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGtt < 1:506950/150‑1 (MQ=255) gaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGTAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTg < 1:989209/150‑1 (MQ=255) gaaAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTg > 2:1006889/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGa < 2:760999/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGTGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAAc < 2:1497990/150‑1 (MQ=255) aGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAAAATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAAc < 2:1505068/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTAGATAAAAGAACATCAATGGGACCAGAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGaagc > 2:1824668/1‑148 (MQ=255) gTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAg > 1:827435/1‑150 (MQ=255) tGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAActca < 1:181693/150‑4 (MQ=38) tGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTAGTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACCCAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑AAAACTGTAGTACAATTAT‑CTCCAGTTTGAACAgg > 1:1582265/1‑150 (MQ=255) ttcaataaTCTGATTTTTAAGGAGTCTAGCCAGAGTGCCGCGATTAAACGTGTATTGTGGGTATATAAAAGAAGATCAATGGGAACACTATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCAAGTTTGAACAGGaa < 2:730805/144‑1 (MQ=255) gCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGaaa > 1:1061934/1‑150 (MQ=255) gCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGaaa > 1:595339/1‑150 (MQ=255) gAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAat > 2:984011/1‑150 (MQ=255) cTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGTGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGc < 1:459265/150‑1 (MQ=255) cTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGc > 1:1658315/1‑150 (MQ=255) cTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGc < 1:1263957/150‑1 (MQ=255) tGATTTTTAGGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCt > 2:985551/1‑150 (MQ=255) tGATTTTTAAGGAGTGGCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCt < 2:176812/150‑1 (MQ=255) ttttttAGGAGTGTCGCCAGAGGGCCGAGATGAAACGTGTATTGAGGTAATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATg < 1:703567/150‑1 (MQ=255) tttttAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATg < 1:1284484/150‑1 (MQ=255) ttttAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGAATATAAAGGAAC‑TGAATGGGAACCCCAAGGAGCAACCCGGGAGTTGAATTAAAAAATGATGTACATTAAT‑ATCAAGTTTAAAAAGGAAAGAaaatcttatta > 2:1093663/1‑143 (MQ=255) tAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAAcc < 1:984011/150‑1 (MQ=255) gAGTGTCTCCAGAGTGCCGCGATGATACGTGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTTAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTta < 1:91567/150‑1 (MQ=255) gAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTTTTGAGTGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTta < 1:1777031/150‑1 (MQ=255) aGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTtat > 1:1556792/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTAt > 2:836494/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTAt > 2:635736/1‑150 (MQ=255) agTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTtgg < 2:1471022/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGATTAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAATAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTtggtg < 1:1647304/150‑1 (MQ=255) gCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTtggtgg > 1:1252084/1‑150 (MQ=255) cgcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGgtggtg < 2:1382570/150‑1 (MQ=255) gcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGc < 2:1015290/150‑1 (MQ=255) gcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGc < 1:1006889/150‑1 (MQ=255) gcgATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGc > 1:1255150/1‑150 (MQ=255) gAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATAc < 2:873693/150‑1 (MQ=255) aaCGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAAATCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACtt > 2:707651/1‑150 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGc > 2:787864/1‑150 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGc > 1:1412814/1‑150 (MQ=255) cGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAAATCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGc < 1:879611/150‑1 (MQ=255) aTTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAgg < 2:1694323/150‑1 (MQ=255) gAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCa > 2:591920/1‑150 (MQ=255) gAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGAAGAGGtaa > 2:221484/1‑148 (MQ=255) gtgTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCAtt < 1:48887/148‑1 (MQ=255) ggTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTg > 1:242954/1‑150 (MQ=255) gTATATAAAAGAACATAAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTgg < 1:926001/150‑1 (MQ=255) ataAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACa > 1:1601295/1‑150 (MQ=255) taAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACaa < 1:462561/150‑1 (MQ=255) taAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACaa > 1:644448/1‑150 (MQ=255) cATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAAtt > 1:642839/1‑149 (MQ=255) cATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATg > 2:1464131/1‑150 (MQ=255) aTCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGa > 1:1614893/1‑150 (MQ=255) aaTGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGt < 2:866081/150‑1 (MQ=255) tGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAAACTTAATGAAGttt > 2:796684/1‑150 (MQ=255) tGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGATATGAAACCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTAGCAGAGATCATTGGTACAACCTTAATGAAtttt > 1:242572/1‑150 (MQ=255) ttgcgccaATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTc < 2:1589335/144‑1 (MQ=255) ggAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTc < 1:1261955/150‑1 (MQ=255) aaTGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATTCTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAggg > 2:919865/1‑149 (MQ=255) tgatgaAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTGCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCAATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGttt < 2:1393499/150‑1 (MQ=255) gatgaAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGtttt > 1:319544/1‑150 (MQ=255) aCAGGTGAGGTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACgg < 2:1087638/150‑1 (MQ=255) cAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGt < 1:1528156/150‑1 (MQ=255) ggTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTTCACGGttt > 2:204049/1‑149 (MQ=255) gTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTAt > 2:242924/1‑150 (MQ=255) tgagttgagtT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATg < 1:297750/150‑1 (MQ=255) tagttgagtt‑CAATCTGTAGTACTATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGATAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTGATTGGTACATCCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATgg < 1:956812/149‑1 (MQ=255) gttgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGcc > 2:1531345/1‑150 (MQ=255) ttgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCa > 1:352350/1‑150 (MQ=255) tgagtt‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCAt > 2:837662/1‑150 (MQ=255) cctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGATTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACAAGGTTATGGCCaa > 1:1223289/4‑149 (MQ=255) ctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATc > 1:1013954/3‑150 (MQ=38) ctgtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGACATc > 1:1149866/3‑150 (MQ=38) gtt‑CAAACTGGAG‑AGAATTGTACTACAGTTTGAACAGGAAAGAAAATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAAAGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACTCTTATGGCCATCTg > 2:1447126/1‑150 (MQ=255) cAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTg > 1:425169/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTgg > 1:84175/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTgg > 2:841864/1‑150 (MQ=255) aCTGTAGTACAATTCT‑CTCCATTTTGAACAGGAAAGAATATGATATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTa < 2:449378/150‑1 (MQ=255) cTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTAc < 2:1026337/150‑1 (MQ=255) cTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTAc < 1:836494/150‑1 (MQ=255) gtagtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACaa < 2:1061934/150‑1 (MQ=255) gtagtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGATGGTACaa > 2:126440/1‑150 (MQ=255) agtaGAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATTTGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatt < 1:722719/150‑1 (MQ=255) agtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatt > 2:385352/1‑150 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCATTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta < 1:107747/150‑1 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta > 1:1572842/1‑150 (MQ=255) gtaCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACAGTTATGGCCATCTGTTGGTACAatta > 2:988326/1‑150 (MQ=255) aCAATTCT‑CTCCAGTTTGTACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGTTTATGGCCATCTGTTGGTACAattatt < 2:1653858/150‑1 (MQ=255) aCAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAATGAATATGCTATGATCCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAattatt < 2:1690685/150‑1 (MQ=255) cAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTAttt < 1:635736/150‑1 (MQ=255) tct‑ctcCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTa < 1:1464131/150‑1 (MQ=255) | AGAATGGGAAGGAAAGGTGAGCACGAATCTGATTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTT‑CAAACTGTAGTACAATTCT‑CTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTAT > NC_000913/568136‑568434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |