| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,554,524 | 0 | C | A | 5.1% | 432.8 / 7.6 | 144 | intergenic (+163/‑52) | uxuB/uxuR | D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent/fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (75/59); new base A (4/5); total (79/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.14e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CTACAGACTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTT‑CCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGC‑AAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGC > NC_000913/4554375‑4554672 | cTACAGACTTACTGGTCAATCAAACTGATTTTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTT‑CCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTc > 2:127773/1‑150 (MQ=255)cTACAGACTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTT‑CCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTc < 2:842853/150‑1 (MQ=255)cTACAGACTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTT‑CCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAAAGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTc > 1:1491700/1‑150 (MQ=255) 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gTTCACGCCGCATCCGGC‑AAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACg > 1:846385/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGC‑AAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGc < 1:686309/150‑1 (MQ=255) | CTACAGACTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTT‑CCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGC‑AAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGC > NC_000913/4554375‑4554672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |