| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 580,727 | G→T | 5.9% | intergenic (‑282/‑107) | ylcI ← / → nohD | DUF3950 family protein, DLP12 prophage/DLP12 prophage; DNA packaging protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 580,727 | 0 | G | T | 5.9% | 1399.1 / 13.1 | 449 | intergenic (‑282/‑107) | ylcI/nohD | DUF3950 family protein, DLP12 prophage/DLP12 prophage; DNA packaging protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (241/161); new base T (2/45); total (243/206) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.29e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
CGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGA > NC_000913/580578‑580876 | cGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATg < 2:3834888/150‑1 (MQ=255) ttGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGta > 2:4206988/1‑150 (MQ=255) tgACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGtattt > 2:7875042/1‑150 (MQ=255) aTGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTatttattt > 1:7892111/1‑150 (MQ=255) aGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTaaaa < 1:8895034/150‑1 (MQ=255) atgatAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATa < 2:9374712/150‑1 (MQ=255) atgatAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATa > 2:1263705/1‑150 (MQ=255) tgatAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAc > 2:9070378/1‑150 (MQ=255) gatACTGATTCTCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAcc < 2:1109832/150‑1 (MQ=255) gatAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAcc > 1:2614891/1‑150 (MQ=255) atAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAccc < 1:9186619/150‑1 (MQ=255) atAAATATTATCATTTTGTGGGTCCTTACCGGCGATCCGACAGGTTACTGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTAAGCTATTTATGAAAAATTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTACTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAccc < 2:5817872/150‑1 (MQ=17) attattATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCt > 2:1612361/1‑150 (MQ=255) attattATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCt > 1:8017300/1‑150 (MQ=255) tATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAA < 2:3413382‑M1/150‑1 (MQ=255) tCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGA > 2:7797023‑M1/1‑150 (MQ=255) cATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAA > 2:7192400‑M1/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAA < 2:6886305‑M1/150‑1 (MQ=255) tgGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAAC < 1:3858178‑M1/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGAC > 1:2813624‑M1/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACA > 1:2022686‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAG > 1:4555414‑M1/1‑150 (MQ=255) gcGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGTCCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTTTTTTATTTACACCCTGATTTGAAAGGAAACGACAGGTGCt > 2:8641317/2‑150 (MQ=14) ccGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTGGGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGTAATGAAAGGAAACGACAGGTGCt > 2:2767271/1‑150 (MQ=255) ccGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCt > 2:9179445/1‑150 (MQ=39) cGGCGATCGGACAGGTTCGGGGGCGGCGACCTCGGGGTTTTTCGCTTTTTATGAAATTTTTCCGGTTTCT‑GGTGTTTCCGTTTTTCTTGGTCTTAAATTATTTTATTTTTTTAAAATACCCCCTTAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTg < 2:4309289/150‑1 (MQ=14) ggCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGa > 1:34497/1‑150 (MQ=39) gCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGaa > 2:4152559/1‑150 (MQ=38) aTCCGACTGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTTTTTCCGTTCTTCTTCGTCTTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGc < 2:6062622/150‑1 (MQ=255) aTCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGc > 1:8404208/1‑150 (MQ=38) ccGACTGGTTACGGGGGGGCGACCTCGGGGTTTTTCGATATTTATGAAAATTTTCGGTTTTAT‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCCCGGAAAACAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGa < 2:5756344/150‑1 (MQ=11) cGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAg > 1:469558/1‑150 (MQ=39) cGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCGGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAg > 2:4995705/1‑150 (MQ=255) gACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGc > 2:2909161/1‑150 (MQ=39) gACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGc > 1:3564666/1‑150 (MQ=39) gACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGc > 1:6776111/1‑150 (MQ=39) gACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTGTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGc > 2:6686407/1‑150 (MQ=255) aCAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCt > 1:6880537/1‑150 (MQ=39) ggTTAGGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTTTTTCTGAAATTTTTCCGGTTTAT‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCtttt < 2:3613733/150‑1 (MQ=14) gTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCttttt < 2:736296/150‑1 (MQ=40) ttACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTg > 1:5664897/1‑150 (MQ=40) gcggcgACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctg < 2:7050764‑M2/150‑4 (MQ=255) cggcgACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTGTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgt < 2:1413412‑M2/150‑5 (MQ=255) gcgACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcg < 2:1899782‑M2/150‑7 (MQ=255) cgACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgt < 1:1261820‑M2/150‑8 (MQ=255) gACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAACCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCATTTTGGCCGctgtcgtt < 1:6219179‑M2/150‑9 (MQ=255) ccTCGCGGTTTTTCTCTTTTTATTAAATTTTTCCGGTTTAT‑GGTGTTACCGTTTTTCTTCGTCTTAAATTATTGTTTTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAACGGACACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgtttc > 2:23936‑M2/1‑140 (MQ=255) ccTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgtttc > 2:2245803‑M2/1‑140 (MQ=255) tCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAAATTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTATTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgtttcct < 1:5292288‑M2/150‑13 (MQ=255) gcgGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgtttccttt < 1:1062652‑M2/150‑15 (MQ=255) gcgGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgtttccttt < 1:193644‑M2/150‑15 (MQ=255) gggTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTctgtcgtttcctttct > 2:6389380‑M2/1‑134 (MQ=255) ttttCTTTATTTATTAAATTTTGCGGTTTTTT‑GTTGTTGCGTTTCTTCTTCGTCTAAACTTTATTTATTTATTAAAAAACCCCCCTCAAACCAAAGCAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTg < 1:1368141/150‑1 (MQ=9) ttCGCTTTTTATTAAAATTTTCCTTTTTAT‑GTTGTTTCCTTTCTTCTTCTTCTTAAATTAATTTATTTATTAAAAAAACCCCCTCAAAATAATGCAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGtt < 1:517045/150‑1 (MQ=14) tctttttttATTAAATTTTTCCTTTTTTT‑GGTGTTCCTGTTCTTCTCCTTTGTAATTTATTTTTTTTATTTAAAATACCCCCTTAAAACAAAGCACACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGttt < 1:6721351/144‑1 (MQ=2) tCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGttt > 2:6281805/1‑150 (MQ=255) gCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGttttt > 1:7602628/1‑150 (MQ=255) tATTTTTTAAAATTTT‑CGGTTTAATGGTGTTTCCTTTCTTCTTCGTCTTAACTTATTTTTTTTATTAAAAAAACCCCATCAAAAGAATGCACACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGt < 1:9706256/150‑1 (MQ=11) tttATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCATGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGATGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGATACCTATCTATGTTTTTTTcc > 2:590270/1‑150 (MQ=14) ttATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCg > 1:7301884/1‑150 (MQ=255) tATTAAATTTTTCGGTTTTTT‑GGTTTTTCGTTTCTTCTTCGTCTTAAATTAATTTATTTATTAAAAAAACCCCCTCAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGt < 1:1521095/150‑1 (MQ=14) tATTAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGt < 2:5344128/150‑1 (MQ=255) tATGAAATTTTTCCGGTTTAT‑GGTTTTTCCTTTCTTGTTGGTGTTAACTTATTGTATTTATTTAAAATACCCCCTTAAAAGAACGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGt < 2:2572356/150‑1 (MQ=14) tGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTATAATACCCCCTGAAATGAAAGGAAACGACAGGTGCTGTAAGCGTGGTTTTTGGCATCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTGTTTgtgggtgg > 2:6161829/1‑150 (MQ=14) gAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGa > 2:3207982/1‑150 (MQ=255) gAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGa > 2:791830/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATATAAAATACCCCCTTAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTACATTATATGTTTTTGTACGTGGaa > 1:2141272/1‑150 (MQ=14) aatttttCCGGTTTTT‑GGTGTTGCCGTTCTTCTTGGTGGTAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCCCTCAAAAGAAAGCAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAAt < 1:9451187/147‑1 (MQ=14) aaaTTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAAt < 2:7281846/150‑1 (MQ=255) ttttCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAAtgtg < 2:9515581/150‑1 (MQ=255) tttCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTACTTTCTCTGTTTTTGTCGGTGGAATGTGc > 2:4981922/1‑150 (MQ=255) tttCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTAATAAAAATAACACCTGAAAAGAAAGGAAACTAAAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTATCTGTTTTTTTCCGTGGAAagtta > 1:8619757/1‑148 (MQ=14) tCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCaa > 2:4705932/1‑150 (MQ=255) tCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCaa > 2:3670313/1‑150 (MQ=255) cGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGTAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATg < 2:5234971/150‑1 (MQ=255) cGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATg > 2:8879526/1‑150 (MQ=255) ggTTTAA‑GTTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATgg < 2:490209/150‑1 (MQ=255) tttAA‑GGTTTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGaa < 2:453502/150‑1 (MQ=255) tttAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGaa < 2:1382442/150‑1 (MQ=255) tttAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGaa > 2:6595954/1‑150 (MQ=255) tatggTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAAATTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTTAAAACAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGt < 1:5526070/147‑1 (MQ=255) a‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTca > 2:8273321/1‑150 (MQ=255) gtttttCCGTTCTTCTCCGTCTTAACTTAATTTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTcaac < 1:5990371/147‑1 (MQ=255) gtgtTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATAACCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTcaac > 1:1590539/1‑150 (MQ=255) gtgtTTCCGTACTTCTTCGTCGAAACTTAATTTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAACAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTcaac < 1:6450249/150‑1 (MQ=255) tgtTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTTTCCGTGGAATGTGCAATTGAATTcaaca > 1:5849029/1‑150 (MQ=255) tttCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCGGTTTTTGTCCGTGGACTGTGCAATGGAAGTCAACaaa > 1:419100/1‑150 (MQ=255) cGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAagc > 2:1019640/1‑150 (MQ=255) cGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTACATTCTCAGTTTTTTTCCGTGGAAAGTGCAATGGAAGTCAACAAAAagc > 1:9008229/1‑150 (MQ=14) gTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAagca > 1:2712607/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAagca > 1:7117494/1‑150 (MQ=255) tcttcGTCGTAACTTAATTTATTTATTTAAAACACCCCCTGAAAAGAATGCACACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctgg < 1:290727/150‑1 (MQ=14) cttcGTCTTAAATTATTGTTTTTTTTAAAAAAACCCCCTTAAAACAAAGCAAACGACTGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctggc < 1:3160989/150‑1 (MQ=14) ttcGTCTTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctggct < 1:1413412/150‑1 (MQ=255) ttcGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGACTGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctggct > 2:6761387/1‑150 (MQ=255) ttcGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctggct > 2:5983898/1‑150 (MQ=255) cgtcgtAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGa > 2:4012713/1‑150 (MQ=255) gTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGa < 2:5399570/150‑1 (MQ=255) gTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGa > 2:8062852/1‑150 (MQ=255) gTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGa > 2:3509505/1‑150 (MQ=255) | CGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAA‑GGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGA > NC_000913/580578‑580876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |