| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 960,223 | 0 | A | T | 5.6% | 1599.0 / 10.2 | 469 | intergenic (+128/‑41) | aroA/ycaL | 5‑enolpyruvylshikimate‑3‑phosphate synthetase/putative peptidase‑related chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (160/274); new base T (31/2); total (193/276) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.24e-11 | |||||||||||
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Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
GCGGATTAGCCAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCG‑TTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACATAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGATTGCGACCTCTGCAGCATTACTGACAGGGTGTCAAAATACCCACGGTATTGATACCAATATGGCTATCAGCTCCGGTTTAA > NC_000913/960074‑960372 | cgGATTAGCCAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCG‑TTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGAt < 1:5429221/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCG‑TTTTTTTTCGGACCTTGTGTGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACataaaa > 2:6594557/1‑148 (MQ=255) aGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCG‑TTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGTTACATAATAtt > 1:7315591/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |