| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,620,224 | 0 | C | G | 7.8% | 406.8 / 22.4 | 128 | intergenic (+17/+14) | marB/eamA | periplasmic mar operon regulator/cysteine and O‑acetyl‑L‑serine efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/81); new base G (6/4); total (43/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.47e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAG > NC_000913/1620075‑1620372 | tACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAc > 2:1129355/1‑150 (MQ=255)tACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAc > 1:1589657/1‑150 (MQ=255) aCTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTTAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACa > 2:24521/1‑150 (MQ=255) 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ttCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGcc < 1:1578345/150‑1 (MQ=255) aataagCCCCGAGATGTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGcc > 2:1152764/6‑150 (MQ=255) aataagCCCCGAGATGTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGGCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAAAAATAGTGcc > 2:1682483/6‑150 (MQ=255) aataagCCCCGAGATGTCGCGGCTTATTAACTAACCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAACCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCATACCCGTTAAGAGTTCATCCAACAAAAGTGcc > 1:73947/6‑150 (MQ=255) tCTGGCCCCGACAACTCGGGGCTTTTTAAATTACCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATTCAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCg < 2:1031588/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCCCCT‑AAAAATTGCAGCCCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCAc > 2:1819493/1‑150 (MQ=255) ggCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCAc > 2:809283/1‑150 (MQ=255) gCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACt < 2:1746308/150‑1 (MQ=255) cccGAGATGTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTg < 1:1152765/150‑1 (MQ=255) cccGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTg < 2:1360555/150‑1 (MQ=255) aCATCTCGGTGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAg < 1:477726/150‑1 (MQ=255) aCATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAg < 2:846949/150‑1 (MQ=255) | TACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCT‑AAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAG > NC_000913/1620075‑1620372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |