| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,263,500 | G→A | 5.1% | P54L (CCG→CTG) | tdcD ← | propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,263,500 | 0 | G | A | 5.1% | 294.0 / 3.4 | 104 | P54L (CCG→CTG) | tdcD | propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/59); new base A (2/3); total (42/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGA > NC_000913/3263351‑3263649 | cTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCg > 1:521641/1‑150 (MQ=255) ttCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGTAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCgg < 1:1794374/150‑1 (MQ=255) tCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTATAAATACTGCCGCCGTGAGCGAGGCGGTGGCCAATTAACGCCACACTGGCAATTAAATTCCGTGTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTGCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGt < 1:392071/150‑1 (MQ=255) tCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCggg > 1:567304/1‑149 (MQ=255) cGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTg < 1:774555/150‑1 (MQ=255) cGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAAAACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTg < 2:75019/150‑1 (MQ=255) ggTAATACTGGCGGACTCGGAAAAAATACTGCCGCCGGGAGCGATGCGGTGGCCAATTAATGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCCATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTgg < 1:1991435/150‑1 (MQ=255) ggTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTgg > 1:2017579/1‑150 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGGCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:174913/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:1649059/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:1880910/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGc < 1:1390061/150‑1 (MQ=255) gTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCACCGGTTCTGGc > 2:1305595/1‑150 (MQ=255) aataatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGctc < 2:271029/150‑1 (MQ=255) aataatGGCGGACTAGGTAAAAATCCTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGATCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCACCGCTGGctc < 2:511640/150‑1 (MQ=255) taatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCCGCGGGGCTGGCtct‑c > 1:2027968/1‑150 (MQ=255) taatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCtct‑c < 2:1972126/150‑1 (MQ=255) taatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCtct‑c < 2:1355833/150‑1 (MQ=255) taatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCACCGCTGGctcac < 2:260613/150‑3 (MQ=255) taatGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCACCGCTGGctcac < 2:849984/150‑3 (MQ=255) aatGGCGGACTAGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGAGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑cc > 2:1209098/1‑150 (MQ=255) atGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑ccc < 2:499769/150‑1 (MQ=255) atGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑ccc < 2:499771/150‑1 (MQ=255) gCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCa < 2:690974/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGTGCTGGGGGT‑CCCCCAttt > 1:1275093/1‑150 (MQ=255) gACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCAttt < 1:1391942/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCCCACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGGGCCCCCCGGGCTGGGTGG‑CCCCCaaata > 1:1524294/1‑146 (MQ=255) cTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTAc > 1:134080/1‑150 (MQ=255) ggTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCCTTTACCGa > 2:730219/1‑150 (MQ=255) gTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGAt < 2:428156/150‑1 (MQ=255) gTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGAt < 2:137622/150‑1 (MQ=255) aaaaTACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAg < 2:725390/150‑1 (MQ=255) aTACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAACCAACGGGGGAGGCAAT‑ACCCCCATTACCGAAAAGaaa > 1:887249/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGCGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑ACCCCATTTACGGATATGAATGCa > 1:133919/1‑150 (MQ=255) gccgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCATAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCGGTCCCCCCATTTAGGGTTATAAATGATtttt > 2:699519/1‑150 (MQ=255) cgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCg < 2:1966824/150‑1 (MQ=255) cgTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCg < 2:1428802/150‑1 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCATATGCATTTGCCTTCAATGGACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCCGCGGTGCTGGCTGT‑CCGCCATTTACGGCTAAGAATGCATTTTCCgg > 2:83689/1‑149 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCGTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGa < 2:130949/150‑1 (MQ=255) gTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGa < 1:719719/150‑1 (MQ=255) tGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTGT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAg > 2:151831/1‑150 (MQ=255) gCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTa < 2:1019399/150‑1 (MQ=255) gCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCAATTTCGGATTAGAAAGCATTTTCCGAGttt > 2:815915/1‑149 (MQ=255) gCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCAGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTa > 2:1345631/1‑150 (MQ=255) aTGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCATCGTAGCTGTGGTGAGCCACCCGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCAATTTCCGAGTTAAT‑a > 2:1117598/1‑150 (MQ=255) gggCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCg < 1:1511602/149‑1 (MQ=255) ggCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTCAAT‑ACCGTCgg < 1:1470529/150‑1 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGc < 1:1493627/150‑1 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAA‑ACCGTCGGc > 2:273137/1‑150 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCAATTAAGGATAATAAAGCATTTTACGAGTTAAT‑AACGTCGGc > 2:1640586/1‑150 (MQ=255) gCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGATCATATGCTATTTCCTTCAATGCTCCTTCGTAGCGGTGGTGAGCCTGCGGTGCTGGGTCT‑CCCCCATATACGGATTAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGc < 2:86595/150‑1 (MQ=255) tcAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGCGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCa < 2:173676/149‑1 (MQ=255) ccAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCa > 2:1340368/1‑150 (MQ=255) ttAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATAc > 1:1179110/1‑150 (MQ=255) tAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATTCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATAcc < 2:1433796/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGTTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGAc < 2:1880265/150‑1 (MQ=255) gCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGAc < 1:1149493/150‑1 (MQ=255) acacTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACAtt < 1:857087/150‑1 (MQ=255) cacTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTa > 1:1102369/1‑150 (MQ=255) cTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGGGCCAAACGTGCGGGCAAA‑ACCCCAATTACAGATAAAAAAGAATTTTAACAATTAAA‑AACGTAGGCAAAACCAGGCAATaaa > 1:1019146/1‑149 (MQ=255) tggcATTTAACTTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGGGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATa < 1:352680/147‑1 (MQ=255) tCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACt < 2:1610579/150‑1 (MQ=255) cATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTACGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACtt > 2:1064319/1‑150 (MQ=255) cATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGAAAAGAAAGCATTTTCCGAGTTAAA‑ACCGTCGGCAATAACTGACAATAATAcat > 2:860372/1‑148 (MQ=255) aTTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTc > 2:68259/1‑150 (MQ=255) tttAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCGTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGCCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAAAACGTGACATTAATTCTTca > 2:1934378/1‑150 (MQ=255) ccGTTTTTCCAGTTCTAATGCAATTGCCTTCAATGGACCTTCGTAGCTGTGGTGTGCCTGAGGTGCTGGCTCT‑CCCACATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCAGAGTCGCt < 1:939877/150‑1 (MQ=255) gTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTgg < 2:1038610/150‑1 (MQ=255) tCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCg < 1:1580579/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCTTAGCTGTGGTGAGCCATCGGTGCTTGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGa < 1:879372/150‑1 (MQ=255) cAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTAACAGTCGCTGGCATCGAg > 2:1476141/1‑150 (MQ=255) tCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGGTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACg < 1:252139/150‑1 (MQ=255) aaaaTGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACgg < 1:1939682/149‑1 (MQ=255) aaaTGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCATCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTCACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGa < 1:667455/150‑1 (MQ=255) cAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACt < 2:567304/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑ACCCCATTTACGGTTAAGAATTCATTTTACGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTGGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATc < 2:1641398/150‑1 (MQ=255) ccTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCg < 1:1730152/150‑1 (MQ=255) ttCAATGCACCATCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGAGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAA‑ACCGTCGGCAATACCTGACATAAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGaa < 1:1189895/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAAcc < 1:1227448/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGtt < 1:1933892/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGtt < 1:1423505/150‑1 (MQ=255) tAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGGTAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAAAACCTGACATTAATACGTCACAGTGGCTGGCATCCCGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGCACCACCGTta > 2:1418957/1‑150 (MQ=255) tAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCGGGCTCT‑ACCCCAATTACGGTTAAGAAATCATTTTACGAGTTAATAACCGAC‑GCAATAACTGACATTATTAAGTCACAGTAGCAGGCCAGTCACACGGAAAACATAAACGAACACGAACACCAGTta > 2:155088/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTtaata < 1:1305596/150‑1 (MQ=255) ggggagAGCCAGCACCGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAc > 1:995236/6‑150 (MQ=255) tggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAAcc < 2:407684/150‑1 (MQ=255) gggagAGCCAGCACCGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGATCCACAGTTAATAAcc > 1:543791/5‑150 (MQ=255) ggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCa > 1:1073170/1‑150 (MQ=255) ggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCa > 1:1223802/1‑150 (MQ=255) ggtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTGAATAACCa > 1:641287/1‑150 (MQ=255) gtgAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACATGACATTAATACATCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACATAATCGAAGACGAACCACAGTAAATAACCaa > 2:1705078/1‑150 (MQ=255) gAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCaaaa < 2:1679937/150‑1 (MQ=255) aGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaac < 1:1640587/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGCCGAACCACAGTTAATAACCAAaaca > 2:1256420/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaaca < 1:694132/150‑1 (MQ=255) cAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAAAACCTGACATTACTACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGCAAAACAGTTAAATACCAAaacaac > 1:86654/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCAGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTTATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAaacaac > 2:824144/1‑150 (MQ=255) gCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCg < 1:644724/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGAAATACCTGACATTAATACTTCACAGGCGCTGGCATCGAGCACGGAATACTTAATCGAAGACGATCCACAGTTATTACCCAAAACAACCg < 2:1668323/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGa > 1:1259245/1‑150 (MQ=255) | CTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCT‑CCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAAT‑ACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGA > NC_000913/3263351‑3263649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |