| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,531,875 | G→A | W20* (TGG→TGA) | ydcC → | H repeat‑associated putative transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,531,875 | 0 | G | A | 99.2% | 421.6 / NA | 129 | W20* (TGG→TGA) | ydcC | H repeat‑associated putative transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (70/58); total (71/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCC > NC_000913/1531727‑1532021 | ttAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGaaa < 1:1021006/151‑1 (MQ=255)ttAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGaaa < 1:2154617/151‑1 (MQ=255) caaaTTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGATTTTTATTGCTTACACATGATCTAATACTCGTTACATAATCAAGGAGAATAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTATAGATAAGACTGAaaaaa > 2:73085/2‑150 (MQ=14) aaaTTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATg < 1:2161911/151‑1 (MQ=255) aaTTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATgg < 1:1391460/151‑1 (MQ=255) aTTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGa < 2:2499366/151‑1 (MQ=255) aTTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGa < 1:777619/151‑1 (MQ=255) ttGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGaa < 1:2570947/151‑1 (MQ=255) ttGAGATATTACTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGaa < 1:1761898/151‑1 (MQ=255) agaTATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCACGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACAt > 2:548430/1‑151 (MQ=255) tatTCCTTCTTTCCTAAAGCTGCTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATTGAACTTAAAAAATTGATGGTACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAACATCGACCATAAg < 2:2046832/151‑1 (MQ=14) tatTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGATCTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAg < 2:111594/151‑1 (MQ=255) tatTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAg > 1:1064517/1‑151 (MQ=255) tatTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAg < 1:967995/151‑1 (MQ=255) tatTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAg < 1:1093413/151‑1 (MQ=255) tatTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGATTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAACATAAAAAATGGAACATAAg < 2:146447/151‑1 (MQ=14) atTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACATAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATTGAACATAAGt > 2:2120672/1‑151 (MQ=14) tCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTa > 1:810894/1‑151 (MQ=255) cTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATTATCAAATACTCCTTACATAATTAAGTATGACAAAGTGGAACGGAGAAAATTGATGGGACATATTTCTAGTAGCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATc > 1:1054409/1‑151 (MQ=21) ttattaCCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCg < 1:1621744/151‑1 (MQ=255) aCCTAAAGCTGTTTTTTATTGTTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGatat > 2:1400472/1‑151 (MQ=255) cTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTc > 1:463925/1‑151 (MQ=255) aGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACt > 1:313205/1‑151 (MQ=255) gTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTg < 2:1904743/151‑1 (MQ=255) gTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTg < 2:1904689/151‑1 (MQ=255) tATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTAtt > 2:1508368/1‑151 (MQ=255) tATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTAtt > 2:826702/1‑151 (MQ=255) ttGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtg < 2:2500330/151‑1 (MQ=255) ttGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtg < 2:2415372/151‑1 (MQ=255) tagCTAACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAATGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATTGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAAATAACACCGATTAATGGAACATAAGAAATCGCATAATCTACTGTTTTCTATTtg < 2:870119/149‑1 (MQ=14) gCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg < 2:1194298/151‑1 (MQ=255) gCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg < 1:969518/151‑1 (MQ=255) ttACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGcc > 2:969639/1‑151 (MQ=255) ttACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGcc > 2:2175835/1‑151 (MQ=255) cAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTgg > 2:1768932/1‑151 (MQ=255) cAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTgg < 2:2005908/151‑1 (MQ=255) cAAATACTCCTTACATAATTAAAGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTgg < 1:1583229/151‑1 (MQ=255) aaaTACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGt < 1:969649/151‑1 (MQ=255) aaaTACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGt < 2:2001760/151‑1 (MQ=255) aaaTACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGAAAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGt < 2:1680229/151‑1 (MQ=255) aaTACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTg < 1:1643584/151‑1 (MQ=255) tACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 2:1915463/151‑1 (MQ=255) tACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 1:199814/151‑1 (MQ=255) aCTCCAAACAAAATGAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTATATTATCCCCGATTACAGAAAAAAAAAAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAg < 2:1139789/151‑1 (MQ=11) cTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGa > 2:53184/1‑151 (MQ=255) ccTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGGACATAATTTATCGGATATTCTACGGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAg > 1:1868022/1‑151 (MQ=255) ccTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGCTATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGcagcag > 2:1441552/1‑151 (MQ=255) ccTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAg > 2:1257870/1‑151 (MQ=38) cTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAgg > 1:17230/1‑151 (MQ=255) cTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAgg > 1:925953/1‑151 (MQ=255) aTAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑ggg > 1:805858/1‑151 (MQ=255) aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAg > 2:1256769/1‑151 (MQ=255) ggAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAATGGTACATAAGTTATCGGATAGTCTAGTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGAtata > 1:2320242/1‑151 (MQ=255) ggAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGAtata > 1:2099794/1‑151 (MQ=25) ggAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGAtata > 2:251418/1‑151 (MQ=255) ggAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGAtata > 1:482857/1‑151 (MQ=255) ggAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGAtata > 1:2519290/1‑151 (MQ=255) agaACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATaga > 2:1042432/1‑151 (MQ=255) agaACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATaga > 2:615987/1‑151 (MQ=255) gaACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATagag < 1:2149022/151‑1 (MQ=255) aaaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGAAAAGACAAAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATagag < 2:2029155/150‑1 (MQ=11) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCCGAAGGGT‑GGGAAGACATAGAgg > 1:883208/1‑151 (MQ=255) aCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGa > 1:574909/1‑151 (MQ=255) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGAt < 2:2264803/151‑1 (MQ=255) aTGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTg < 1:2585619/151‑1 (MQ=255) aTGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTg > 2:1481835/1‑151 (MQ=38) tGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAAACAAACAAAAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTgg < 2:1777046/151‑1 (MQ=11) aaCTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGCGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGa < 2:789780/151‑1 (MQ=255) tAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAaca > 1:296713/1‑151 (MQ=255) tAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAaca > 1:1841698/1‑151 (MQ=255) aaaaaaTTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTAAGGGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAacac > 1:600918/1‑151 (MQ=255) aaaaaTTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAAcaca < 2:1427244/151‑1 (MQ=255) aTTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATccc > 1:1899524/1‑151 (MQ=255) gATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGa > 1:405993/1‑151 (MQ=255) gATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGAt > 2:301061/1‑151 (MQ=37) ggACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGAttttt < 1:1935266/151‑1 (MQ=37) cATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGa < 1:1475575/151‑1 (MQ=25) tatTTCTATTATCCCCGATTACAGACACGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGCTTTTTTGAAg < 2:1054398/151‑1 (MQ=255) atTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGc > 1:1342066/1‑151 (MQ=25) atTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGc > 1:622230/1‑151 (MQ=25) ttCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATACGTTATCGGACATTCTACTGTTGACTCTTTGTGCGGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCaa < 1:960747/151‑1 (MQ=255) ttCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCaa < 2:776689/151‑1 (MQ=25) cTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAata > 2:2106712/1‑151 (MQ=25) attatCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATg > 1:2300881/1‑151 (MQ=25) attatCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATg > 1:481654/1‑151 (MQ=25) ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATgg < 1:540936/151‑1 (MQ=25) tatCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGt < 1:2548094/151‑1 (MQ=18) tatCCCCGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGt < 1:415209/151‑1 (MQ=21) cccGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 2:371155/1‑151 (MQ=25) cccGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGACT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 1:911738/1‑151 (MQ=255) cccGATTACAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCCACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 2:317902/1‑151 (MQ=255) aCAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaaaa > 2:1317879/1‑151 (MQ=25) cAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAAt > 2:1216674/1‑151 (MQ=25) cAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAAt > 1:2121522/1‑151 (MQ=25) cAGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAAt > 2:2298702/1‑151 (MQ=25) aGACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTCCCGTTATTTATATTGCAGAAGCCT‑TGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATg < 1:73086/151‑1 (MQ=11) gACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATgg < 1:826712/151‑1 (MQ=25) gACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATgg < 1:2106732/151‑1 (MQ=25) gACAAGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATgg < 1:1783514/151‑1 (MQ=21) aGCCTGAAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTAtt > 1:1697452/1‑151 (MQ=25) | TTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTTATTGCTTACACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGGACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAATGGAACATAAGTTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCT‑GGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCC > NC_000913/1531727‑1532021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |