| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1096961 = | 67 (0.670) | 13 (0.180) | 6/414 | 6.4 | 19.7% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
| ? | NC_000913 | = 1097503 | 58 (0.800) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
GTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGC > NC_000913/1096665‑1097246 | gTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTTCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCgg > 1:223927/1‑301 (MQ=255) cAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGc < 1:222665/301‑1 (MQ=255) aaTGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTAATCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑aa < 1:461811/299‑1 (MQ=255) aTTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGCGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACAAATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTCACTGAGTACCCATACATTTCATGTGCACGCTTTCCTCTCGACTTAACAGCCTTGGGCGAGTGCACGCGGGGTGGGCAATATCCG‑ACAAACATGCCCGCACtgcatgacgatt > 2:810277/1‑290 (MQ=255) ctGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTaa > 1:45509/1‑301 (MQ=255) ctGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGAGTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGACGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACTTATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTCACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCCCACTAACCGCCGTGGGAGCGGGCACCCGGTGTTTGCATTTTTCG‑CAAAAAAAGGCCGGACtttatgaaatgtccttccttaa > 2:810313/1‑282 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTTGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAGGCCCGTCCTTTCGTACGAGCTcttcttgtaat > 2:181400/1‑296 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAat > 1:279910/1‑301 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAat > 1:91461/1‑301 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTAATCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACAAGAAAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACCTGGGCGGGGGCACCCGGTGCTTGCACTATACG‑CAAAAAAAGCACTCACATTCGTCTGATCTCTTGTTTaaaa > 2:553884/1‑300 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGAAATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGAGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCACCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAACAAGCCAGTACTTTCGGACGAGGTATTCTTTaa > 1:807314/1‑299 (MQ=255) gTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGTGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAAAATGGCGGTTATGGGGGGATTGATtagtttcgcctc > 2:676840/1‑297 (MQ=255) gTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCAccc < 1:738373/208‑1 (MQ=255) tcgggattaatagttttttGATGGCTTGTTGCTTGTCTTTCCGTTGGGTGCATTTTATGAATTGAGGAAGGGATAGGAAGTGACCAGATAATACCTTTATGTTTGTTATTCTCTGGCGCATTTGGATTGTGGACGGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGc < 2:625930/288‑1 (MQ=25) aTTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCTGGCAGC‑CCGCTCa > 1:827217/1‑299 (MQ=255) tttggaatttgtaaTGGATTTCCGTGGGTGGTACTTTATTAAGTGAGTAAGTGATATGAAGTGTCCAGATAATACATATATGTTCTGTACTTTCGTGCGTATTTTGATTGTTGACTTAGTTACCCGACAGTTGATGTGCACGTTTTCCCCTAGCCCTATCCGTCGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑Ca < 2:807284/288‑1 (MQ=21) ggCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAACAAAAGCCCGTACTTTCGTACGACCTCTTCTTTAAATCTGGCGCGTACGGGGTGATTGACTCACTTCGCTCGACCGGC‑GGCACCACCCCACACTGCGTT‑CACg > 2:650893/1‑300 (MQ=255) taTGTGACATGGATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTTAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGt < 1:529297/299‑1 (MQ=255) aTGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGGGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATAGATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAAc < 1:25719/301‑1 (MQ=255) 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ataCATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGcca > 1:785946/1‑299 (MQ=255) taCATATATTTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGc < 1:43258/276‑1 (MQ=255) taCATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTGGTACGAGCTTTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGTGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCACGCCGGCTGC‑TCGCTCACTGTGTT‑CCCCGTCTGTCCCGCTGGCTGTCCACCGTTTTCGACCCCACGTCggggtcgctcccctttaaccagcctgccg > 2:43258/1‑275 (MQ=21) 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gTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGGCTGTCCACCTGGCTGTCGCCACTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCCTCCCCCCgctcggctcttcttcacat > 2:544474/1‑281 (MQ=255) tCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CCCGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGaaaaaa > 1:402473/1‑301 (MQ=255) tCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCCGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATCCACGaacaaa > 1:851688/1‑301 (MQ=255) tCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCCGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCCCATCCCCCCGGTGTgcgc > 2:57593/1‑287 (MQ=255) tCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGc < 1:57593/287‑1 (MQ=255) gTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATgg > 1:388367/1‑155 (MQ=255) gTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATgg < 2:388358/155‑1 (MQ=255) ctctTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTGGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATCCACGAAAAAAAAGCCCGt > 1:86606/1‑301 (MQ=255) gATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTTTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTAcctgtcccttaca > 1:189322/1‑289 (MQ=255) tgttgACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAACAAAAGCACGTACTTTCGTCCGACcttt > 1:531236/1‑299 (MQ=255) 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gtgCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCCGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGCTTGCTCCTAGTTGTCGACGCCCGGTCCGGGCATCTCACCCCCCGGGCGCTTGCACCACCCGAAAAATAAGCACGTACTTCCCCACGAGCGCTTCTTTAActaagcggctcgcgtggggg > 2:79008/1‑284 (MQ=17) aTTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCCGTTGTCGACCCCCGGTCAGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAACCAAAATCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGTATTGACt > 1:147081/1‑300 (MQ=255) cccTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATATACGACCATAAAGCCCGTCCCTTCGCCCGCGGTCTGCTTTAAACATCGCGGtcgtgcggtggtctcgtccattt > 1:27776/1‑279 (MQ=14) cGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATCCACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCTTACGAGCTCCTCTTTAAATATGACGGTGAGGGGGGGATTCACtcgcttcagc > 1:669587/1‑297 (MQ=255) tAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGCGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGcct > 1:129133/1‑299 (MQ=255) gACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGCGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTTGCTCGCCCTGCggg > 1:683793/1‑301 (MQ=39) aCGTGGGCGGGGGCACCCTGTGTGTTCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCGGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCggg < 1:625162/300‑1 (MQ=255) cGTGGTCGGAGTCACCGGGTGTTTAAAATATATG‑AAAAAAAGGTCCGTCCGTTGGTATGAGTTCGTCTTTAATGGGGGGGGTGCGGGGGGGATTGCTCCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTTGCGGCGTT‑CGCGGTCGGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGc < 2:279904/300‑1 (MQ=11) | GTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGC‑CCGCTCACTGCGTT‑CACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGC > NC_000913/1096665‑1097246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |