| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,649,295 | 0 | T | G | 47.9% | 109.9 / 21.7 | 71 | intergenic (+254/‑314) | ydfC/dicB | uncharacterized protein, Qin prophage/Qin prophage; cell division inhibition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/33); new base G (34/0); total (38/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTT > NC_000913/1649148‑1649439 | aGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTAt < 2:525483/151‑1 (MQ=255) gATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTAttc < 2:1259898/151‑1 (MQ=255) gATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTAttc < 1:775874/151‑1 (MQ=255) atTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCNGNNNNGGCAACCCGCGAAANGNCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTAtttctt > 2:233376/1‑151 (MQ=255) atTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTGtttctt > 1:873783/1‑151 (MQ=255) ccTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCg < 1:853905/151‑1 (MQ=255) cTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTCCTT‑tccccc > 2:518087/1‑149 (MQ=255) gAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑cccccgtg > 1:636593/1‑147 (MQ=255) gAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTCCTT‑cccccctg > 1:1085150/1‑147 (MQ=255) gAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCTTg > 2:1193359/1‑151 (MQ=255) cAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGacac < 2:988103/151‑1 (MQ=255) cAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑CCCCCTTGAGGacac > 2:1238362/1‑151 (MQ=255) cAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑TCCCGTTGAGGgcac > 2:1182106/1‑151 (MQ=255) aGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑CCCCCTTGAggggacc > 1:284828/1‑146 (MQ=255) ccATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑ggg < 1:1117958/151‑1 (MQ=255) ccATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑TCCCGTTGAGGacaaccgg > 2:293252/1‑146 (MQ=255) cATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGt < 1:337785/151‑1 (MQ=255) aTAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGtt < 1:1263784/151‑1 (MQ=255) tAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCGTGAGGGCACC‑CGGGTg > 2:607583/1‑151 (MQ=255) aCGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTc < 2:185918/151‑1 (MQ=255) cgAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAgg < 2:592275/151‑1 (MQ=255) gAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑TCCCGTTTAGGGGACC‑GGGgtgttcggg > 1:917253/1‑146 (MQ=255) gcgcATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGAc < 2:198266/151‑1 (MQ=255) cgcATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTCCTT‑CCCCCCTTTGGGGACC‑GGGGTGTCAGGGTGGcc > 1:936392/1‑151 (MQ=255) ggCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATAc < 1:417245/150‑1 (MQ=255) ggCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATAc < 1:237650/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAg < 1:200340/151‑1 (MQ=255) tCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCCT‑CCCCCTTGAGGGCACC‑CGGGTGTCAGGGTTACCCTACGCTTTAGTGGCAAccc > 2:667803/1‑151 (MQ=255) agatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGc < 1:928652/150‑1 (MQ=255) gatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑ggggaaggaataac < 1:536844/123‑12 (MQ=255) agCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCTTGAGGGCACC‑CGGGTGTCAGGGTGACCATACGCTTAAATGACAAACCCCCTGcc > 2:1088168/1‑149 (MQ=255) gTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑TCCCGTTGAGGAAACC‑CGGGTGTTAGGGTGACCATACGCTTAAATGACAACCCCCCTGCAAAGcccccc > 2:722164/1‑148 (MQ=255) tAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTg < 2:239749/150‑1 (MQ=255) aaaTTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGt < 1:91848/150‑1 (MQ=255) aaaTTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑TCCCCTTGAGGGCACC‑GGGGTGTTAGGGTGAACATAAGCTTAAGTGACAACCCCGCCGCAACGCCCCCTGtt > 2:677909/1‑151 (MQ=255) tttCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑Tc < 2:1067115/150‑1 (MQ=255) tttCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑TCCCGCTGGGGGCACC‑GGGGTGTTCGGGTGGCCATAACCTTAAATGAAAACCCCGCTGCCACGCCcccttgtttt > 2:176634/1‑144 (MQ=255) ttCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCa < 1:934659/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑TCCCCCTGTGGGCACC‑CCGGTGTTCCGGTGACCACACCCTTTAGTGAAAAACCCCCCGCCACACCCCCTCTTT‑TCa > 1:1431749/1‑150 (MQ=255) cgtcgACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTTCTT‑TCCCCGTGTGGGCACC‑GGGGTGTCAGGGTGAGCATACGCCTAAAAGACAAACCCCCTGCCACGCCCCCTGTTA‑TCAAtt > 2:48020/1‑151 (MQ=255) cgtcgACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTCCTT‑TCCCGTTGAGGACACC‑GGGGTGTCAGGGTGACCATACCCTTAAGTGACAACCCCCCCGCAACGCCCCCTGTTT‑TCAAtt > 2:144747/1‑151 (MQ=255) cgACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAAtttt < 1:252280/150‑1 (MQ=255) gACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCCTGTGGACACC‑CGGTTGTCAGGGTTTCCCTACGCTTTAGGGACAAACCCCCTGCAACCCCCCCTGTTT‑TTAAtttttt > 1:487898/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCCTGGGGAGACC‑CGGGTGTTAGGGTGGCCATACGCTTAAGGGGCAACCCCCCCGCCACGCCCCCTTTTT‑TTCAtttttt > 1:170448/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑CCCCCCTGTGGACACC‑CGGGTGTCAGGGTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCCCCGCCACCCCCCCTTTTT‑TTCAttttttttg > 1:1406688/1‑146 (MQ=255) gTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTg < 2:1095700/151‑1 (MQ=255) ccGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTg < 2:806662/150‑1 (MQ=255) cGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGCGGGGGTTTTTCTTT‑CCCCCTTAGGGCCCCC‑GGGTT‑TTACGTTGACCCTACGCTTTAGTGGCAACCCCCCCGCAACGCCCTCTGTTT‑TTCATTTTTTTGTGACGGTTTgg > 1:291814/1‑151 (MQ=255) ggCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATc < 2:690577/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATc < 2:870341/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATc < 2:873784/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTCCTT‑CCCCCGTTAGGCGACC‑CGGGTGTGGGGTTGCCCCTATGCCTTAGAGACAAACCCGGTGCACCCCCCTCTGTTA‑TCTATTTTCTTGTGTC‑GATTTGCGGGATc > 1:27768/1‑150 (MQ=255) cccGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGtttt < 2:494625/151‑1 (MQ=255) ccGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCCT‑CCCCCTTGAGGGCACC‑CGGGTGTTAGGGTGACCATACGCCTAAATGACAAACCCCCCGCCACGCCCCCTGTTT‑TTAATTTTTTTGGGGC‑GGTTGGGGGGATCAGttttt > 1:1044569/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGAAACC‑GGGGTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTTTTGTGAC‑GGTTTGCGGGATTAGttttt > 2:722196/1‑150 (MQ=255) gcgAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑CCCCCTTGAGGGCACC‑CGGGTGTTAGGGTGACCATACGCTTTAGTGACAAACCCCCCGCCAAGCCCCCTGTTT‑TTAATTTTTTTGGGGC‑GGTTGGGGGGATCAGgttttat > 2:960857/1‑148 (MQ=255) gcgAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCCTTAGGGCACC‑CGGGTGTTAGGGTGGACATACGCTTTAGTGACAAACCCGCCGCCACGCCCCCCGTTT‑TTAAATTTTTTGTGGC‑GTTTTGCGGGATCAGgttttat > 1:923256/1‑148 (MQ=255) gcgAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCCTGAGGACACC‑CGGGTGTCAGGGTGACCCTACGCTTTAGTGACAAACCCCCTGCAACGCCCCCTGTTA‑TTAATTTTTTGGTGAC‑GGTTGGCGGGATCAGGTTTACt > 2:955881/1‑151 (MQ=255) cgAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCCTGAGGGAACC‑CGGGTGTCCGGGTGACCATACGCCTTAATGACAAACCCGCCGCCACCCCCCCTGTTA‑TTAATTTTTTGGTGAC‑GTTTGGCGGGATCAGTTTTtctc > 1:1291078/1‑151 (MQ=255) gAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑TCCCGTTGAGGACACC‑GGGGTGTCTGGGTGGGCATATGCTTTAATGAGAAAACCCCTGGCACGCCCTCTGTTT‑TCTATTTTTTTGGGAC‑GGTTGggggggttcatttttctcc > 1:933075/1‑136 (MQ=255) aaTGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTTCCCCCGTTG‑GGGCACC‑GGGGTGTCAGGGTTACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACCCCCCCTTTTA‑TTAAATTTCTTGTGAC‑GGTTGGGGGGATCAGTTTTACTCCGt > 2:40412/1‑151 (MQ=255) aTGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTCTT‑CCCCCCTTTGGACACCGGGGTTGTTGGGTGAACCCAAC‑CCTAAGTGACAACCCCCCGGCCAACCCCCCCGTTATTCAATTTT‑TTGCGAC‑GTTTTGCGGGATCCGGTTTTCttcctt > 2:394930/1‑146 (MQ=255) tGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTTTTTCTT‑TCCCGCTTGGGACACC‑CGGTTGTCCGGGTGGCCAAAAGCTTAAATGGCAAACCCCCCGCCACCCCCCCTGTTT‑TTAAATTTTTTGGGGC‑GGTTTGCGGGATCCAtttttatccctg > 2:132841/1‑142 (MQ=255) ggCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGAc < 2:1385278/151‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACt < 2:1402770/151‑1 (MQ=255) aGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTgccgcc < 2:692734/151‑1 (MQ=255) gTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGccc > 2:335275/1‑151 (MQ=255) aTGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCtt < 1:293258/151‑1 (MQ=255) ggC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCtttt > 1:378741/1‑151 (MQ=255) ggC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCttt < 2:885202/150‑1 (MQ=255) gC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCttttt < 2:225740/151‑1 (MQ=255) | AGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTATTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCTTAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTA‑TCAATTTTCTGGTGAC‑GTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTT > NC_000913/1649148‑1649439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |