| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,649,295 | 0 | T | G | 41.2% | 145.3 / 21.9 | 80 | intergenic (+254/‑314) | ydfC/dicB | uncharacterized protein, Qin prophage/Qin prophage; cell division inhibition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/39); new base G (33/0); total (41/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.10e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTAAAGT > NC_000913/1649145‑1649444 | gAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGt < 1:174238/151‑1 (MQ=255) aaaGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGtt < 1:751360/151‑1 (MQ=255) aaGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTa < 2:221349/151‑1 (MQ=255) aGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑t < 2:1454198/151‑1 (MQ=255) aGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑t < 2:832179/151‑1 (MQ=255) aGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑t < 2:1281478/151‑1 (MQ=255) ggATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑tt < 2:387529/151‑1 (MQ=255) ggATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑tt > 1:348507/1‑151 (MQ=255) tCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTNNNNNNNTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑ttcctt‑cc < 1:375813/150‑1 (MQ=255) tCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑ccc > 2:313264/1‑151 (MQ=255) cccTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑cccc > 2:147133/1‑151 (MQ=255) gAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGt < 2:953933/149‑1 (MQ=255) gAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTg < 1:1295691/151‑1 (MQ=255) gAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTg < 1:82225/151‑1 (MQ=255) aaaaGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCCTTgg > 1:1182668/1‑150 (MQ=255) aaaGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑TCCCtttagg > 2:476505/1‑148 (MQ=255) cAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGacac < 1:588228/151‑1 (MQ=255) cATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCCTTGGGGGCACC‑cggg > 1:436868/1‑150 (MQ=255) tAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGGATGGC‑GGGGTTT‑ATCCTT‑CCCCGCTGTGGAGACC‑CGGGTg > 1:631807/1‑151 (MQ=255) cgAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGGT‑TTTCCT‑CCCCGTTTGGGGCACC‑ggggcggtagg > 2:965017/1‑143 (MQ=255) gAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTATTTTCTT‑CCCCG‑TGAGGGGACC‑ggggcgggcggg > 2:1248774/1‑142 (MQ=255) gAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTCCTT‑CCCCCCTGAGGGGACC‑GGGGTGGCCGGt > 2:536043/1‑151 (MQ=255) aaGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTTCTT‑CCCCCTTTAGGACAAC‑CGGGTGTCAGGGTg > 2:671264/1‑151 (MQ=255) gcATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTT‑TTTCTT‑TCCCCTTGGGGGCACC‑GGGGTGTCCGGGTGaac > 1:543270/1‑148 (MQ=255) gcATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCa < 1:1245227/151‑1 (MQ=255) cATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCAt < 1:1404902/151‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTTTTT‑CCCCCGTGAGGGGACC‑GGGGTGTCAGGTTgtgcaaa > 1:854907/1‑144 (MQ=255) ggCGAGGTCGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGGGGCATCCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTACTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGAGCATACg < 2:544758/151‑1 (MQ=255) ggCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATAc < 1:633110/150‑1 (MQ=255) cGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCt < 2:814050/151‑1 (MQ=255) cGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTTCTT‑TCCCCCTGAGGACACC‑CGGGTGTCAGGGTGACCATACGcc > 2:110313/1‑150 (MQ=255) gAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCt‑t < 1:508721/151‑1 (MQ=255) aGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCGCTGGGGGCACC‑CGGGTGTCAGGGTGGCCATACGcctt > 1:644329/1‑148 (MQ=255) ggTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑Taa < 2:1367603/151‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑TCCCCGTGAGGGCACC‑GGGGTGTCAGGGTGACCCTACGCC‑Taa > 1:216808/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGt < 2:734368/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTg < 1:89007/151‑1 (MQ=255) ggTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACa < 2:678284/150‑1 (MQ=255) gTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAAc < 1:210/151‑1 (MQ=255) tCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCCTTGAGGACACC‑CGGGTGTCAGGGTGACCATACGCT‑TAAGTGACAAacc > 1:851635/1‑151 (MQ=255) cATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAAccc < 1:1000939/150‑1 (MQ=255) cATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTTCTT‑CCCCCCTGGGGGCACC‑GGGGTGTCAGGGTGAACATAAGCT‑TTAGTGGCAAaccc > 2:783143/1‑151 (MQ=255) cATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑TCCCCTTGAGGACAAC‑GGGGTGGCAGGGTGACCATACGCC‑TAAGTGACAAaccc > 1:1102026/1‑151 (MQ=255) atagatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTTCTT‑TCCCCCTGAGGGGACC‑CGGGTGTTTGGGTGACCCTACGCT‑TAAATGaaaaaaccc > 2:21164/1‑146 (MQ=255) tagatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTCCTT‑TCCCCCTGAGGGCACC‑CGGGTGGCAGGGTGACCCTACGCT‑TTAGTGACAAaccccc > 2:616098/1‑149 (MQ=255) agatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTT‑TTTCTT‑TCCCCTTGGGGGGCCC‑GGGGTGTCAGGGTGACCCTTCCCT‑TTAGTGACAAACCCGcc > 1:178046/1‑150 (MQ=255) agatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCGGTGGGGGCACC‑GGGGTGTCAGGGTGACCCTACGCT‑TAAATGACAAacccccc > 1:845879/1‑148 (MQ=255) agatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCCTTGAGGACACC‑CGGGTGTTCGGTTGGTCATAAACT‑TAAGTGAGAAacccccc > 2:1465509/1‑148 (MQ=255) agatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCCT‑CCCCGCTGAGGACACC‑CGGGTGTTAGGGTGAACATACGCC‑TAAGGGACAACCCCCCt > 1:901450/1‑151 (MQ=255) gatagCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCCTTGGGGGCACC‑GGGGTGTCAGGGTGACCATACGCC‑TAAATGACAAACCCCCTg > 1:927698/1‑151 (MQ=255) agCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTTCTT‑CCCCGGTGAGGGCACC‑CGGGTGTCAGGTTGTACCTACGCT‑TAAATGACAACCCCCCTGcc > 2:486812/1‑149 (MQ=255) gCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAAc < 2:283180/151‑1 (MQ=255) tCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGCGGGGGTTT‑TTCTTT‑CCCCCTT‑AGGAGAAC‑CGGGTGGCAGGGTGACCCTTACCT‑TTAGTGAGCACCCCCCTCCAACGgccc > 1:710615/1‑150 (MQ=255) 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aaaTGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGGTA‑TTCCTT‑TCCCGCTGGGGGCACC‑GGGGTGGTAGGGTGAACATACCCC‑TAAGTGACAACCCCCCCGCAACGCCCCCCGTTTTCAATTTTTTGGGGGCGTTTTGCGGTATCAGTTTTTCTccc > 1:154328/1‑150 (MQ=255) gcggcgGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGc < 1:468176/151‑1 (MQ=255) gcggTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGctct < 2:300616/151‑1 (MQ=255) ggC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCtttt > 1:261426/1‑151 (MQ=255) ggC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCtttt > 2:866958/1‑151 (MQ=255) ggC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCtttt < 1:1020517/151‑1 (MQ=255) c‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTa < 2:221634/151‑1 (MQ=255) ggggTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTa > 1:893344/1‑150 (MQ=255) gTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GTGTTTTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGGGACTGCTCTTCCGCCCTTTTTAAAGt > 2:1057954/1‑151 (MQ=255) | GAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCATAACGCGAAAGCGCATGGCGAGGTAGCTGGTTCATAGATAGCCTGTCGTTAAATTTTCGTCGACCGTGCGCTTCCGGTTGTGGCAACCCGCGAAATGGCGCGGCGGTAAGTATGGC‑GGGGTTA‑TTCCTT‑CCCCGTTGAGGACACC‑GGGTTGTCAGGTTGACCATACGCT‑TAAGTGACAACCCCGCTGCAACGCCCTCTGTTATCAATTTTCTGGTGACGTTTGGCGGTATCAGTTTTACTCCGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTAAAGT > NC_000913/1649145‑1649444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |