| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1622824 = | 4773 (87.380) | 12 (0.230) | 11/284 | 2.1 | 0.26% | intergenic (+83/+136) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing |
| ? | NC_000913 | 1622844 = | 4764 (90.920) | intergenic (+103/+116) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 5265 total aligned reads displayed.
TTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATAAA > NC_000913/1622694‑1622995 | gttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCtt > 1:190039/1‑151 (MQ=255) gtggCCGGGTATTTCAGCCAAAAAGGGGAGTACTAATTAGGGGAAATACCCCCTCACCACCCGGGCCCGTTTTTACGGTTGTGAACAGGGGGGTTTATTTTGTGGACG‑GGAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCag < 1:645547/149‑2 (MQ=255) ccccctttttccacccAAAAGTGGGTTAATTAATGAAGGGAGAAAACCCCCCCCCTACCCGCCCCTTTTTTACAGTTGTGAACAAGGGGCTTTTTTTTTATGACG‑GCAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGAt < 1:323050/137‑1 (MQ=255) ttATTTCACCCAAAAATGGGATGACTAATGAACGGAGAAAACCCCTCCCCAACCCGGCCCCTTTTTACAGTTGTGTACAGGGGGCCTGTTTTTTATGACG‑GAAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGAtt < 2:228175/150‑1 (MQ=255) gTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGAtt > 2:244255/1‑151 (MQ=255) gTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGAtt > 1:807276/1‑151 (MQ=255) tctttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCTCCCGTCAACCGGCGGTTAATTCTTGCATGGATAGAttt > 1:756173/3‑151 (MQ=255) ttttCACCAAAAAAGGGGATGAATAATGAAGGGAAATACCCCCCCACCTACCCGCCCCTTTGTTACAGTTGTGTAAAGGGGGCTTTTTTTTTATGACG‑GAAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTtg < 1:352216/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCAAAAAGGGGTTGACTAATGAGGGGAGATACCCCCTCCCCTACCCGGCCCCTTGTTAAAGTTGTGTACAGGGGGCTTGTTTTTTAGGCGG‑GAGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTtgtg < 2:71115/151‑1 (MQ=255) ccAGCAAAAAATGGGATGACTAATGAACGGAAATAACCCCTCACCAACCCGCCCCTTTTTTACAGTTGTGTACAGGGGGCTTGTTTTTTATGACG‑GCAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTgtgt < 2:28565/150‑1 (MQ=255) acaAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTg > 1:789721/1‑149 (MQ=255) caAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCtt > 2:393830/1‑151 (MQ=255) caAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGCACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCtt > 2:300640/1‑151 (MQ=255) aaTGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCtttt > 1:238779/1‑151 (MQ=255) gATAACTAATGAACGGAAATAATCCCTCACCTACCCGCCCCTTTTTTACAGTTGTGTACAGGGGGCTTGTTTTTTATGACG‑GAAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGc < 1:369335/150‑1 (MQ=255) gACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTaa > 1:205807/1‑150 (MQ=255) cTAATGAAGGGAAATAACCCCTCCCCAACCCGCCCCTTTGTTACATTTGTGAAAAGGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTgtgt < 2:521455/132‑1 (MQ=255) cTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTgtgt > 1:521453/1‑132 (MQ=255) tGAACGGAAAAAACCCCCCCCCTACCCGCCCCTTTTTTACGGTGGTGAAAAGGGGGCTTGTTTTTTAGGAGG‑GAAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCAt < 1:539238/151‑1 (MQ=255) gAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCAtt > 2:109370/1‑151 (MQ=255) gAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCAtt > 2:44632/1‑151 (MQ=255) gagaTAATCCCTGACCTAACCGGCCACTTGTTACAGTTGTTTACAAGGGGACTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTccg > 1:257017/1‑150 (MQ=255) gagaTAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTc > 1:617757/1‑149 (MQ=255) gagaTAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTc > 2:151044/1‑149 (MQ=255) aaaaaaacccccccccTACCCGCCCCTTTGTAACAGTTGTGTAAAGGGGGCTTGTTTTTAAGGACG‑GAAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTcc < 2:349459/136‑1 (MQ=255) gaTAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTg > 1:42833/1‑150 (MQ=255) gaTAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTg > 2:258875/1‑150 (MQ=255) gaTAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTg > 1:306131/1‑150 (MQ=255) tAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCa > 2:723236/1‑150 (MQ=255) tAATCCCCCACCGACCCGCCCCCTTATTACGGTTTTGAAGAAGGGCCCTATTTTTGATAGGG‑GGAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCAc < 1:553089/151‑1 (MQ=255) aacccccccactaaaCCGCCCCATTTTTCCAGTTTGGTAAAGGGGGCTTTTTTTTTATGACG‑GCAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCAc < 1:771342/138‑1 (MQ=255) aaacccccccccaacccGCCCCTTTTTTACATTTGTGAAAAGGGGGCTTGTTTTTTAGGCCG‑GCAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCAc < 2:135948/136‑1 (MQ=255) aaacccccCACCAACCCGCCCCTTTTTTACAGTTGTGTAAAGGGGGCTTGTTTTTTAGGCGG‑GAAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCAc < 2:271552/147‑1 (MQ=255) aaaccccTCCCCTACCCGCCCCTTTTTTAAATTTGTGTAAAGGGGGCTTATTTTTTAGGAGG‑GCAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCAc < 2:868154/147‑1 (MQ=255) aTCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCa > 2:770140/1‑148 (MQ=255) tCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGa > 2:190403/1‑151 (MQ=255) ccccTAACCGGCCCTTTGTTACAGTTGTGAACAGGGGGCTTTATTTTTATGGCG‑GAAAAAAAAAGCCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACg < 1:100242/149‑1 (MQ=255) cACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACg > 2:83467/1‑151 (MQ=255) 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CCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATcac > 1:723502‑M1/1‑150 (MQ=255) gTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAAc < 2:210546/124‑1 (MQ=255) gTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACAttt > 2:47911/1‑151 (MQ=255) tAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACAttt < 2:785252/150‑1 (MQ=255) tAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACAttt < 1:14336/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCGCTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTg < 1:129887/151‑1 (MQ=255) aaCCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGt > 2:314988/1‑151 (MQ=255) ggcggtGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGt > 1:661457‑M2/7‑151 (MQ=255) gtGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAt > 2:73647‑M2/3‑151 (MQ=255) gtGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAt > 2:619740‑M2/3‑151 (MQ=255) gAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACgg > 1:117280/1‑113 (MQ=255) gAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATaa > 1:382332/1‑151 (MQ=255) gAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATaa > 2:178612/1‑151 (MQ=255) gAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATaa > 1:442902/1‑151 (MQ=255) gAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATaa > 1:673768/1‑151 (MQ=255) gAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATaa > 2:55697/1‑151 (MQ=255) | TTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACG‑GCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATAAA > NC_000913/1622694‑1622995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |