| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1622789 | 1531 (35.420) | intergenic (+48/+171) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 2148 total aligned reads displayed.
CATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCG‑CGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAAT‑GAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGC > NC_000913/1622628‑1622928 | caTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCG‑CGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAAT‑GAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGT > 1:28754‑M1/1‑151 (MQ=255) aaaCGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCG‑CGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAAT‑GAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTT‑Ac < 1:464241/151‑1 (MQ=255) aaaCGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCG‑CGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAAT‑GAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTT‑Ac < 1:492015/151‑1 (MQ=255) 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aaCCGGCCCC‑TTGTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCg > 2:188553/1‑151 (MQ=255) ggCCCC‑TTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccag > 1:274163‑M1/1‑10 (MQ=255) ggCCCC‑TTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccag > 1:625763‑M1/1‑10 (MQ=255) gCCCC‑TTGTacacaactgtaactaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcaacccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacagtcatattaccc < 1:442235‑M1/148‑140 (MQ=255) gCCCC‑TTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccag < 1:556701‑M1/150‑142 (MQ=255) ccc‑TTTTA‑ACAGTGGTGAAAAGGGGCCCTTTTTTTTAGGAGGA‑AAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGacac < 1:41326/151‑1 (MQ=255) ccc‑TTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcat > 2:473479‑M1/1‑7 (MQ=255) cctttttt‑ACGGTTGTATAAAGGGGGCTTTATTTTTAGGCGGG‑AAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGacac < 1:641540/145‑1 (MQ=255) cctttttt‑ACAGTTGTGAACAGGGGGCTTTTTTTTTAGGACGG‑CAAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGacac < 2:513032/145‑1 (MQ=255) cc‑TTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcatt > 2:364875‑M1/1‑6 (MQ=255) c‑TTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcatta > 1:232252‑M1/1‑5 (MQ=255) ttGTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGt > 2:592607/1‑151 (MQ=255) tGTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTa > 1:139206/1‑151 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 2:125520‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 2:155800‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 2:228277‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagt > 2:69054‑M1/1‑2 (MQ=255) gTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 2:317084/1‑151 (MQ=255) gTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 1:303885/1‑151 (MQ=255) gTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 2:654054/1‑151 (MQ=255) tt‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 2:290037/1‑150 (MQ=255) tt‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 1:19261/1‑150 (MQ=255) tacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattgcccagcattattt < 1:684666‑M1/150‑150 (MQ=255) tacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt < 2:90886‑M1/150‑150 (MQ=255) tacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt < 2:419966‑M1/150‑150 (MQ=255) tacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcgaccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacatgcatattacccagcattattt < 1:533876‑M1/150‑150 (MQ=255) tacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggactatctccgttcattagtcatcccatttgtgtctgaaatacgcggcaagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt < 1:521777‑M1/150‑150 (MQ=255) | CATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCG‑CGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAAT‑GAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTT‑ACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGG‑CGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTG‑AATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGC > NC_000913/1622628‑1622928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |